Collection of Manually Curated Inferences of Regulons in Prokaryotic Genomes
-- version 3.2 --

Profile of regulator NagC in Vibrionales

Properties
Regulator family: ROK
Regulation mode: repressor (activator)
Biological process: N-acetylglucosamine utilization
Effector: N-acetylglucosamine-6-phosphate
Regulog: NagC - Vibrionales
Member of regulog collections
Transcription factor binding sites
Locus Tag Name Position Score Sequence
Vibrio cholerae O1 biovar eltor str. N16961
VC2361 grcA -215 5.3 TATTTTTTATTATTTAAAATAAA
VC2000 gapA -39 4.7 GTTATCTTTAATCAGAAATTAAG
VC1153 tfoX1 -135 4.7 CTTATTTCTCTTCGTAAACTATC
VC1589 aldC -98 5.2 TATATTTTCTATATCAAAATAAA
VC0995 nagE1 -200 5.6 GTTTTTTTACATCATAAAATAAG
VC0995 nagE1 -106 5 TTTAATTTGCGGAGCAAAATTAA
VC2217 hex -130 5 TTAATTTTGCGCTTAGAAAAAAG
VC0994 nagA -291 5.6 CTTATTTTATGATGTAAAAAAAC
VCA1025 nagB -109 5.6 CTTATTTTATAATGCAAATTAAC
VC0966 ptsH -207 5.5 TTTATTTTTAGCTTCAAAATAAA
VC2448 pyrG -131 5.1 TTTGATTTGAAGCAAAAAATAAA
VC2013 ptsG -248 5.1 GTAATTTTGTTACTAAAAATAAC
VC2013 ptsG -214 4.6 TTTTATTTACCCAGTAAAATTAA
VCA0027 chiA -120 4.8 ATTTTTTTTCGCAAACAAAAAAG
VC1073 chiD -357 5.2 TTTTATTTATGATCAAAAATAAA
VC0972 chiP -197 5.4 TATTTTTTTAGATAAAAATTAAG
VC1588 alsR -30 5.2 TTTATTTTGATATAGAAAATATA
VCA0700 chiD -227 5.1 CTTTTTTTATGGTGAAAAATTTA
VCA0700 chiD -42 4.5 TTTATTTAATGGTTGAAATAATA
VC0769 chi -58 5.1 CTTATTTTTCACTATTAAATTAG
VC1722 tfoX -223 4.9 ATTAATTTTTATCAGGAAAAATG
VCA0811 cbp -319 5.1 GTTATTTAACTCTAAAAAATAAG
VC0449 mcp -144 4.9 TTTATTTCGAGGCAAAAATTTAA
VC0449 mcp -102 4.7 CTTACTTCGTATCAATAAATAAG
Vibrio vulnificus CMCP6
VV21298 null -71 5.1 CTTTTTTTAAAACAAAAAGAAAG
VV20680 null -290 5.1 TTTATTTTAAAAATAGAAATATC
VV1_1674 chiS -149 4.6 CTTACTTGTCAAAGTAAAAAAAC
VV20213 chiD -172 4.6 ATTAGTTATCGGTACAAAATAAG
VV20213 chiD -58 5.1 GTTATTTTACAGCGAAATATAAG
VV20402 mcp2 -120 4.8 TTTATTTTTAGCTTCGAATTTAT
VV1_0205 ybfM -211 5.3 TATTTTTTTAGAAAAAAAATAAG
VV1_3140 gapA -39 4.7 GTTATCTTTAATCAGAAATTAAG
VV1_2820 tfoX1 -150 4.6 CTTATTTTTTTTCATTAAGTATG
VV1_1023 glmU -101 4.8 CTTAATTTTTATTAGAAATTTTT
VV1_0241 hex -99 4.9 TTAATTTTACGCTTAGAAAAAAC
VV1_0179 nagE1 -145 5 TTTAATTTGCGGAGCAAAATTAA
VV1_0180 nagA -317 5.1 CTTATTTTATCATTCAAAAAAAT
VV21200 nagB -64 5.7 CTTATTTTATAATGCAAAATAAT
VV1_0210 ptsH -204 5.5 TTTATTTTTAGCTTCAAAATAAA
VV1_1578 pyrG -132 5.1 TTTGATTTGAAGCAAAAAATAAA
VV1_2999 ptsG -320 5.1 GTAATTTTGTTACTAAAAATAAC
VV1_1540 pgk -126 5.3 TTTATTTTTAGCCTTGAAATAAA
VV21217 chiA -122 5.2 AATTTTTTTTGCCGAAAAAAAAG
VV1_0417 chi -33 4.6 CATTTTTTGTGTAGAGAAAAAGG
VV1_2136 tfoX -261 4.4 CACATTTTTTATTTGAAAATGTG
VV1_1511 mcp -148 5 CTTTTTTCACGCTATAAATTTAA
Vibrio harveyi ATCC BAA-1116
VIBHAR_01313 ybfM -212 5.3 TATTTTTTTAGAAAAAAAATAAG
VIBHAR_05607 chi1 -107 5.5 GTTATTTTTATTTATAAATTAAG
VIBHAR_02628 tfoX1 -152 4.7 CTTATTTTTCAACGTTAAGTATG
VIBHAR_03049 gapA -39 4.7 GTTATCTTTAATCAGAAATTAAG
VIBHAR_01575 glgC -197 4.8 GTTATTTAGCGCCAAAAATAAAG
VIBHAR_03018 adh -266 5.2 CTTTTTTTGTTTAATAAAAAATG
VIBHAR_00419 glmU -97 4.9 ATTAATTTTAGTTGTAAATTTAC
VIBHAR_01336 nagE1 -105 5 TTTAATTTGCGGAGCAAAATTAA
VIBHAR_01335 nagA -313 5.5 CTTATTTTATTATACAAAAAAAT
VIBHAR_07002 nagB -63 5.6 CTTATTTTATAATGCAAATTAAT
VIBHAR_01265 hex -123 5 TTAATTTTACGCTTAGAAATAAC
VIBHAR_01336 nagE1 -199 5.5 ATTTTTTTGTATAATAAAATAAG
VIBHAR_01308 ptsH -207 5.5 TTTATTTTTAGGTTCAAAATAAA
VIBHAR_03526 pyrG -132 5.1 TTTGATTTGAAGCAAAAAATAAA
VIBHAR_02900 ptsG -321 5.1 GTAATTTTGTTACTAAAAATAAC
VIBHAR_02900 ptsG -287 5 TTTTATTTACGCCTTAAAATTAA
VIBHAR_03565 pgk -128 5.3 TTTATTTTAAGCCTTGAAATAAA
VIBHAR_06955 chiA -266 4.8 TTTAATTTCACTTGCAAAATAAC
VIBHAR_06955 chiA -112 5.4 TATTTTTTTTGAAAAAAAATAAG
VIBHAR_01580 tfoX -238 4.2 GTTAATTCAATATACGAAGTATC
Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633
VP0497 grcA -216 5.1 TATTTTTTATATTATCAAATAAA
VP2157 gapA -39 4.7 GTTATCTTTAATCAGAAATTAAG
VP1241 tfoX1 -151 4.7 CTTATTTTTCAACGTTAAGTATG
VP0802 ybfM -209 5.3 TATTTTTTTAGAAAAAAAATAAG
VP1023 glgC -192 5.3 TTTATTTAGCGTCAAAAAATAAG
VP3067 glmU -97 4.8 ATTATTTTTAGTTGGAAATTTAC
VP0829 nagA -313 5.5 CTTATTTTATTATACAAAAAAAT
VPA0038 nagB -231 4.6 CTTAATTCAAGCCATAAATTTTA
VPA0038 nagB -63 5.4 CTTATTTTATAATGCGAATTAAT
VPA1651 mcp2 -185 5.2 TTTATTTTGAGCAGTAAAATATA
VP0831 nagE1 -199 5.5 ATTTTTTTGTATAATAAAATAAG
VP0831 nagE1 -105 5 TTTAATTTGCGGAGCAAAATTAA
VP0755 hex -122 5.4 TTTATTTTACGCTTAGAAATAAC
VP0795 ptsH -208 5.3 TTTATTTCTAGCTTCAAAATAAA
VP2562 pyrG -132 5.1 TTTGATTTGAAGCAAAAAATAAA
VP2046 ptsG -321 5.1 GTAATTTTGTTACTAAAAATAAC
VP2046 ptsG -287 5 TTTTATTTACGCCTTAAAATTAA
VP2600 pgk -128 5.1 TTTATTTCAAGCCTTGAAATAAA
VPA0055 chiA -140 5.1 AATTTTTTTTGACGAAAAAAAAC
VP0619 chi -149 4.3 CATTTTTCTTGTGACAAAATGTG
VP1029 VP1029 -269 5.3 CTTTTTTTTATTAAAAAAATAAC
VP2629 mcp -148 5.1 CTTATTTCACGCTAAAAATTTAA
Vibrio shilonii AK1
VSAK1_16967 ompU -195 5.1 CCTATTTTTAAATATAAATTAAT
VSAK1_20854 nagB -62 5.4 CTTATTTTATAATGCGAATTAAT
VSAK1_06295 tfoX1 -155 4.8 CTTATTTTGCATTGTGAACTATT
VSAK1_05950 gapB -267 4.5 CTTGATTGAATGCGAAAAATAAG
VSAK1_04037 glgC -231 4.7 CTTATTTCAAAACGATAATTTAG
VSAK1_24585 glmU -88 5 CTTAATTTTTATTAGAAATTTAC
VSAK1_10643 nagA -291 5 CTTATTTTATCATACGAAAAAAT
VSAK1_10638 nagE1 -110 5 TTTAATTTGCGGAGCAAAATTAA
VSAK1_10638 nagE1 -68 3.5 CTAAATTGAACGGCTAAAATAAG
VSAK1_11440 ptsH -207 5.6 TTTATTTTAAGCCAAAAAATAAA
VSAK1_08019 pyrG -133 5 ATTGATTTGAAGCAAAAAATAAA
VSAK1_26880 ptsG -286 4.7 TTTTATTCACTGCGTAAAATTAA
VSAK1_14330 pgk -126 4.5 TTAATTTTGATGCTTGAAATTAA
VSAK1_11970 chiA -113 5 TTATTTTTTGAACACAAAATAAA
VSAK1_17082 cbp -118 4.4 CTTATTTTTCCACTCTAAATTAC
Vibrio splendidus LGP32
VS_0958 adh -131 5.1 TTTTTTTCACACTGTGAAATAAT
VS_2186 nagE2 -129 5 GTTTGTTTGCATTAAGAAATAAG
VS_1728 mcp2 -29 5.6 TTTATTTTAAAGCGTAAAATAAA
VS_1829 tfoX1 -155 4.7 CTTATTTTTCTTTTCGAAGTATC
VS_II0346 gapB -316 4.9 AGTATTTTTTGGCGAAAATTAAG
VS_0765 hex -217 4.3 CTCAGTTTTTACGTCAAAATAAA
VS_0765 hex -97 5.4 TTTAATTCACGGCAAAAAATAAG
VS_2260 nagE1 -73 4.7 TTTAATTTGCGGGGCAAAATTAA
VS_2261 nagA -295 5.1 CTTATTTTATCATTCAAAAAAAT
VS_II1435 nagB -64 5.4 CTTATTTTATAATGCGAATTAAT
VS_2290 ptsH -212 5.6 TTTATTTTTCGCTTCAAAATAAA
VS_2609 pyrG -132 5 ATTGATTTGAAGCAAAAAATAAA
VS_1032 ptsG -321 5.1 GTAATTTTGTTACTAAAAATAAC
VS_1032 ptsG -287 5 TTTTATTTACTCAGTAAAATAAT
VS_2648 epd -103 4.4 GTTTATTTGTATCTAAAGTTATG
VS_2646 pgk -126 5.6 TTTATTTTTTATCTTGAAATAAA
VS_II1414 chiA -121 4.9 TTTATTTTCAGTCATGAAATTAA
VS_2285 chiP -212 5.3 TATTTTTTTAGATGAAAATTAAG
VS_1087 tfoX -340 4.4 GTTTTTTTCCTCAACAAACAAAG
VS_2703 mcp -128 5.1 CTTTTTTTTCTTCGTAAATTTAA
Vibrio fischeri ES114
VF_A1010 hex -123 5 AATAATTTATACCGCAAAATATA
VF_A0438 nagE2 -159 4.8 GTTAATTTACGCCTCGAATTAAT
VF_2138 chiS -131 5 CTTGATTTTTAACATGAATTAAG
VF_0818 gltA -132 5.2 CTTTTTTTTCATTAAAAATATAA
VF_0896 tfoX1 -136 4.6 CTTGTTTCGTTACATGAATTAAT
VF_2510 null -128 4.7 TATATTTTTCAATAAAATAAATT
VF_1795 ompC -283 4.8 GTTATTTTGTGATGTAAACCAAG
VF_1795 ompC -143 4.8 TTAATTTTGTGAAGCGAATTAAT
VF_0807 nagA -40 4.7 TTTTTTTCGTACTCTAAATTATA
VF_A1010 hex -33 4 TGTAATTCCAGATTCGAAATTAA
VF_0808 nagE2 -128 4.5 TTTAATTTGCGGGGCGAAATTAA
VF_2357 nagB -65 5.4 CTTATTTTATAATGCGAATTAAT
VF_1894 ptsH -218 5.5 TTTATTTTTAGGTGTAAAATAAT
VF_2076 pyrG -136 4.6 ATTGATTTGGAGCAAAAAATAAA
VF_1732 ptsG -318 5 CTATTTTTGTTGCTAAAAATAAC
VF_0442 pgk -154 4.3 GTAAATTTGTGATGAAAAGATAA
VF_0442 pgk -126 4.5 ATGAATTTTTATCTTGAAAAAAG
VF_1598 chiA -233 4.6 CTAAATTCAAAGCACAAATAAAC
VF_1598 chiA -208 4.6 CTATTTTTATAAAGCAATAAAAA
VF_1889 chiP -237 5.2 TATTTTTTTTATTGGAAATTAAG
VF_1390 chi -39 4.4 CTTAATTTCGTTTTTAAATTATC
VF_1573 tfoX -104 5 GTTAATTTTTACGTTAAAATAAC
VF_A0143 cbp -210 4.9 TTTATTTCTTTATTTACAATAAG
VF_2161 mcp -273 4.3 TTTTATTTAAGATTTAATTCAAA
Vibrio salmonicida LFI1238
VSAL_II0721 nagE2 -160 5 GTTAATTTACAGCGCAAATAAAC
VSAL_I0841 gltA -132 5.2 CTTTTTTTTCATCAAAAATATAA
VSAL_I0103 null -80 5.4 CTTATTTTTAGTCGAAAAAAATA
VSAL_I1849 gapA -124 4.7 GTTATTTTTTGATTTTAAACAAT
VSAL_I1132 null -283 5.1 CTTTTTTTTATATGTAAATTTAG
VSAL_I2182 ompC -342 5 CCTTTTTTGTTATAAAAATTAAG
VSAL_I2182 ompC -145 4.7 TTAATTTTGCAGAGCGAATTAAT
VSAL_I0831 nagE2 -127 4.5 TTTAATTTGCGGGGCGAAATTAA
VSAL_I0831 nagE2 -86 3.6 TTAATAACGAGTAGCGAAATAAG
VSAL_II0050 hex -202 4.1 TTTTTTTTGATTGCCAAATTTAA
VSAL_II0050 hex -137 4.9 TTTAATTTATACCGTGAATTATT
VSAL_I0830 nagA -297 4.5 TTAATTTCGCCCCGCAAATTAAA
VSAL_I0830 nagA -41 4.8 TTTTTTTTGTATACTAAATTATA
VSAL_I2812 nagB -64 5.4 CTTATTTTACAATGCGAATTAAC
VSAL_I2357 ptsH -217 5.5 TTTATTTTTAGGTGTAAAATAAT
VSAL_I2515 pyrG -135 4.6 ATTGATTTGGAGCAAAAAATAAA
VSAL_I0556 pgk -126 5.1 ATTAATTTTCACCTTGAAAAAAG
VSAL_I1982 tfoX -104 5.2 GTTAATTTTTACTTAGAAATAAC
Vibrio angustum S14
VAS14_05168 tfoX1 -179 5.4 ATTATTTTGCGACAAAAAATATG
VAS14_06018 aldE -104 5.4 GATATTTTAAAGCGAAAAATAAG
VAS14_22517 glmU -201 4.5 CTTTTTTTATGGCTAAAATCTTA
VAS14_22517 glmU -105 5.2 GTTATTTCTTAGTGAGAATTAAA
VAS14_17646 nagB -172 4.5 TTAATTTCGCCCCGCAAATTAAA
VAS14_17646 nagB -78 5 CTTATTTTATCATTCGAAAAAAA
VAS14_11739 nagA -149 5.4 CTTAATTCACATAGAAAAATAAG
VAS14_17651 nagE2 -201 5 TTTTTTTCGAATGATAAAATAAG
VAS14_17651 nagE2 -107 4.5 TTTAATTTGCGGGGCGAAATTAA
VAS14_16916 ptsH -205 5 TTTATTTTTAGCTCCGAAATAAA
VAS14_20436 pyrG -128 4.7 CTTGATTTGAAGCAAAAAAAATC
VAS14_09224 chiA -97 4.5 CATGTTTCTACTTATAAAAAAAG
VAS14_15829 chi -316 4.2 CTTTTTTATAAAAGAGAATCATG
VAS14_03998 tfoX -268 4.3 TTAAATTTAATATTAAAAGTATT
Photobacterium profundum SS9
PBPRB0360 nagB -60 5.5 CTTATTTTACAATGAAAATAATG
PBPRA0868 ybfM -105 4.9 TATTTTTCGAAGAATAAATTAAG
PBPRA0556 grcA -204 4.7 TATTTTTTAAACTTTAAACTAAC
PBPRA2603 aldE -108 5.5 GATATTTTTAAACGAAAAATAAG
PBPRA1207 tfoX1 -163 4.8 CTTATTTCGCGTTAAATAATATG
PBPRA1724 gapB -250 5.3 CTTATATTTCATCAAAAAATAAG
PBPRA2790 ompC -338 4.9 CATAATTCGCGATAAAAAAATAG
PBPRA2790 ompC -293 5.1 ATTATTTCACGGCGTGAAATAAG
PBPRB0407 mcp2 -134 4.6 TTTTATTTCACTCAAAAATTAAC
PBPRA1032 nagE2 -202 5 TTTGTTTCGAATCATAAAATAAT
PBPRA1032 nagE2 -108 4.8 TTTAATTTGCGGAGCGAAATTAA
PBPRA1031 nagB -171 4.8 TTAATTTCGCTCCGCAAATTAAA
PBPRA1031 nagB -77 5 ATTATTTTATGATTCGAAACAAA
PBPRB0765 nagA -131 5.3 CTTATTTTCTATCGAGAATTAAG
PBPRA0863 ptsH -216 5.2 TTTATTTTAAGCATCGAAATAAA
PBPRA3080 pyrG -129 4.8 ATTGATTTGAGACAAAAAAAAAC
PBPRA1203 ptsG -335 4.3 GTATCTTCGTTACGTAAAATAAC
PBPRA3132 epd -232 5.2 TTTAATTTGCAGTGTGAAAAAAA
PBPRA2110 tfoX -169 4.7 TATTATTTGTGTCTTAAATAATA
PBPRB0312 cbp -30 4.7 GTTGTTTTTTTCTATAAAACAAC
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