Profile of regulator Rex in Clostridia-1
Properties
| Regulator family: |
Rex |
| Regulation mode: |
repressor |
| Biological process: |
Energy metabolism |
| Effector: |
NADH |
| Regulog: |
Rex - Clostridia-1 |
Member of regulog collections
Transcription factor binding sites
|
Locus Tag |
Name |
Position |
Score |
Sequence |
|
Clostridium acetobutylicum ATCC 824
|
|
CAC2712 |
crt |
-45 |
5.6 |
TTGTTATAATATTAACAA |
|
CAC3076 |
ptb |
-52 |
4.8 |
ACGTTAATCATTTAACAT |
|
CAC0267 |
ldh |
-98 |
5.6 |
TAGTTAATAAATTAACAA |
|
CAP0035 |
adhE2 |
-262 |
4.9 |
TTGTTAAATGTTTGACAA |
|
CAC2873 |
thl |
-161 |
4.6 |
TTGTGTTTTTTTTAACAA |
|
CAC1025 |
nadA |
-110 |
5.3 |
TTGATAAATATCTAACAA |
|
CAC1512 |
asrT |
-42 |
5.5 |
TTGTTATATTTTTAACAA |
|
Clostridium beijerincki NCIMB 8052
|
|
Cbei_4319 |
fld |
-37 |
5.5 |
AAGTTAATTATTTAACAA |
|
Cbei_1464 |
butA |
-41 |
5.3 |
ATGTGAATTAATTAACAA |
|
Cbei_0321 |
crt |
-87 |
5.5 |
TTGTTATATTATTAACAA |
|
Cbei_0325 |
hbd |
-146 |
4.8 |
AAGTTAATAATGTAACAT |
|
Cbei_0325 |
hbd |
-126 |
5.3 |
AAGATAATTAATTAACAA |
|
Cbei_0411 |
thlA |
-118 |
5.4 |
TTGTTTAAATTTTAACAA |
|
Cbei_0411 |
thlA |
-58 |
5.7 |
ATGTTAATAATTTAACAA |
|
Cbei_0327 |
hyd |
-84 |
5.6 |
TTGTTATAATTTTAACAA |
|
Cbei_0327 |
hyd |
-287 |
5.3 |
ATGTTAATAATTTATCAT |
|
Cbei_1722 |
bdh |
-99 |
5.3 |
TTGATAAAATAATAACAT |
|
Cbei_2181 |
bdh |
-129 |
5.1 |
TTGATAAAATAATCACAA |
|
Cbei_0203 |
ptb |
-74 |
5.5 |
TTGATATAAATTTAACAA |
|
Cbei_3630 |
thl |
-48 |
5.8 |
TTGTTAAAAAAATAACAA |
|
Cbei_1009 |
pflB |
-52 |
5.4 |
TTGATTAAAAATTAACAA |
|
Clostridium botulinum A str. ATCC 3502
|
|
CBO3202 |
crt |
-136 |
5 |
TAGATAAATTTTTATCAT |
|
CBO3202 |
crt |
-93 |
4.8 |
TTGTTAAAATAATAGCTA |
|
CBO1643 |
bdh |
-261 |
4.8 |
TAGTTATTATTTTATCAT |
|
CBO1519 |
ldh |
-161 |
5.3 |
ATGTTAATTAATTAACTA |
|
CBO1438 |
adhA |
-236 |
5 |
TTGTTAAAAAATTATTAA |
|
CBO2217 |
butA |
-51 |
5.5 |
ATGTTAATTAATTAACAT |
|
CBO1579 |
COG1115 |
-144 |
5 |
TTGAGAGAAAATTAACAA |
|
CBO0345 |
adhE |
-178 |
5.7 |
ATGATAAATATTTAACAA |
|
CBO0345 |
adhE |
-121 |
5.8 |
TTGTTAAATAAATAACAA |
|
CBO1438 |
adhA |
-87 |
5.4 |
TTGTTAAAAAAATAACTA |
|
CBO0246 |
maeB |
-145 |
5.7 |
TTGTTAATAATATAACAA |
|
Clostridium butyricum 5521
|
|
CBY_3016 |
etfB |
-198 |
5.3 |
CTGTTAAAAAAATAACAA |
|
CBY_3325 |
narA |
-169 |
5.2 |
TTATTAATTTTTTAACAA |
|
CBY_3325 |
narA |
-148 |
5.1 |
TTGTTAAAAAAAGAACAA |
|
CBY_3041 |
crt |
-98 |
5.6 |
TTGTTATAATATTAACAA |
|
CBY_2919 |
ptb |
-55 |
5.4 |
TTGATATAATTTTAACAA |
|
CBY_1290 |
thlA |
-81 |
5.4 |
ATGTTAATAATTTAACGA |
|
CBY_1290 |
thlA |
-140 |
5.3 |
TTGTCTAAAATTTAACAA |
|
CBY_3751 |
bdh |
-122 |
5 |
ATGATAAAAATATTACAA |
|
CBY_3747 |
bdh |
-92 |
5.4 |
TTGACAAAAAAATAACAA |
|
CBY_3643 |
fld |
-37 |
5.5 |
AAGTTAATTATTTAACAA |
|
CBY_3753 |
adhE |
-104 |
5.5 |
GTGTTAAAAAAATAACAA |
|
CBY_3753 |
adhE |
-146 |
5 |
TTGACAAAAAATAAACAA |
|
CBY_2357 |
maeB |
-145 |
5.4 |
TTGTTAAAAAAGTAACAA |
|
CBY_2472 |
butA |
-41 |
5.3 |
ATGTGAATTAATTAACAA |
|
Clostridium kluyveri DSM 555
|
|
CKL_0591 |
nadO |
-75 |
4.7 |
TTGTTTTAATTTTATCAT |
|
CKL_0454 |
crt |
-64 |
5.1 |
TTGTGATATTATTAACAA |
|
CKL_0591 |
nadO |
-46 |
5.4 |
TTGTCAAAAAATTATCAA |
|
Clostridium novyi NT
|
|
NT01CX_0385 |
pflD |
-198 |
5.4 |
TAGATAAATAATTAACAT |
|
NT01CX_1610 |
etfB |
-70 |
5.2 |
TTGAAAAATATATAACAA |
|
NT01CX_0604 |
hbd |
-233 |
5.4 |
ATGATATATATTTAACAA |
|
NT01CX_0604 |
hbd |
-46 |
5.6 |
AAGTTAAAAAATTAACAA |
|
NT01CX_0474 |
crt |
-69 |
5.2 |
TTGTTACTATATTAACAA |
|
NT01CX_2324 |
bcd |
-114 |
4.7 |
GTGTTTTTTTTTTAACAA |
|
NT01CX_0464 |
hyd |
-97 |
5.3 |
ATGTTACATATTTAACAA |
|
NT01CX_0468 |
bdh |
-61 |
5.7 |
TTGTTAATAAAATAACAA |
|
NT01CX_0309 |
COG1115 |
-30 |
5 |
TTGAGAGAAATTTAACAA |
|
NT01CX_0278 |
ctfA |
-90 |
5.4 |
ATGACAAAAATTTAACAA |
|
Clostridium perfringens ATCC 13124
|
|
CPF_2556 |
narK |
-44 |
5.4 |
GAGTTAAAAAATTAACAA |
|
CPF_2052 |
narA |
-47 |
5.5 |
ATGATAAATTTTTAACAA |
|
CPF_2585 |
crt |
-124 |
5.5 |
TTGTTACAAAATTAACAA |
|
CPF_2657 |
ptb |
-190 |
5.2 |
GTGTTTAAAATTTAACAA |
|
CPF_2657 |
ptb |
-43 |
5.7 |
TTGTTATAAATTTAACAA |
|
CPF_2460 |
thlA |
-35 |
4.7 |
TTGATAAATTTTTACCTA |
|
CPF_2460 |
thlA |
-115 |
5.6 |
TTGTTTAAAATTTAACAA |
|
CPF_0098 |
ldh |
-64 |
5.1 |
TTGTTATATAATTAACTT |
|
CPF_2855 |
adhE |
-286 |
5.2 |
TTGATAAAAAAATCACAA |
|
CPF_2855 |
adhE |
-266 |
5.2 |
TAGTTAAAAAAATAACGA |
|
CPF_0728 |
noxE |
-60 |
5.6 |
TAGATAAAAATTTAACAA |
|
Clostridium tetani E88
|
|
CTC01847 |
frdA |
-40 |
5.5 |
TAGTTAATATTTTAACAA |
|
CTC00400 |
PF04143 |
-39 |
5.2 |
TTGACAGATAATTAACAA |
|
CTC01178 |
noxE |
-141 |
5 |
TTGAAAGAAATTTAACAA |
|
CTC02427 |
crt |
-245 |
5 |
TTGTTATAAATTCAACAA |
|
CTC02427 |
crt |
-104 |
5.6 |
TTGTTATAATATTAACAA |
|
CTC00312 |
thl |
-64 |
5.3 |
TTGTTAATTTTTTAACTA |
|
CTC00710 |
bcd |
-64 |
5.1 |
AAGTTAGTTATTTAACAA |
|
CTC02422 |
bdh |
-157 |
4.8 |
AAGTTAAGTTATTAACAA |
|
CTC02422 |
bdh |
-50 |
5.4 |
ATGTTAAAAATATATCAA |
|
CTC02417 |
hyd |
-84 |
5.4 |
CTGTTAATAAATTAACAA |
|
CTC02546 |
ptb |
-48 |
4.8 |
TAGTTAAAAAGATATCAA |
|
CTC01366 |
adhE |
-139 |
5.5 |
TTGTTATATAATTAACAT |
|
CTC01488 |
frdA |
-147 |
5.4 |
TTGACAAAATATTAACAA |
Export
|
Regulatory Sites
|
[ FASTA format ]
|
DOWNLOAD
|
