Collection of Manually Curated Inferences of Regulons in Prokaryotic Genomes
-- version 3.2 --

Profile of regulator Rex in Clostridia-1

Properties
Regulator family: Rex
Regulation mode: repressor
Biological process: Energy metabolism
Effector: NADH
Regulog: Rex - Clostridia-1
Member of regulog collections
Transcription factor binding sites
Locus Tag Name Position Score Sequence
Clostridium acetobutylicum ATCC 824
CAC2712 crt -45 5.6 TTGTTATAATATTAACAA
CAC3076 ptb -52 4.8 ACGTTAATCATTTAACAT
CAC0267 ldh -98 5.6 TAGTTAATAAATTAACAA
CAP0035 adhE2 -262 4.9 TTGTTAAATGTTTGACAA
CAC2873 thl -161 4.6 TTGTGTTTTTTTTAACAA
CAC1025 nadA -110 5.3 TTGATAAATATCTAACAA
CAC1512 asrT -42 5.5 TTGTTATATTTTTAACAA
Clostridium beijerincki NCIMB 8052
Cbei_4319 fld -37 5.5 AAGTTAATTATTTAACAA
Cbei_1464 butA -41 5.3 ATGTGAATTAATTAACAA
Cbei_0321 crt -87 5.5 TTGTTATATTATTAACAA
Cbei_0325 hbd -146 4.8 AAGTTAATAATGTAACAT
Cbei_0325 hbd -126 5.3 AAGATAATTAATTAACAA
Cbei_0411 thlA -118 5.4 TTGTTTAAATTTTAACAA
Cbei_0411 thlA -58 5.7 ATGTTAATAATTTAACAA
Cbei_0327 hyd -84 5.6 TTGTTATAATTTTAACAA
Cbei_0327 hyd -287 5.3 ATGTTAATAATTTATCAT
Cbei_1722 bdh -99 5.3 TTGATAAAATAATAACAT
Cbei_2181 bdh -129 5.1 TTGATAAAATAATCACAA
Cbei_0203 ptb -74 5.5 TTGATATAAATTTAACAA
Cbei_3630 thl -48 5.8 TTGTTAAAAAAATAACAA
Cbei_1009 pflB -52 5.4 TTGATTAAAAATTAACAA
Clostridium botulinum A str. ATCC 3502
CBO3202 crt -136 5 TAGATAAATTTTTATCAT
CBO3202 crt -93 4.8 TTGTTAAAATAATAGCTA
CBO1643 bdh -261 4.8 TAGTTATTATTTTATCAT
CBO1519 ldh -161 5.3 ATGTTAATTAATTAACTA
CBO1438 adhA -236 5 TTGTTAAAAAATTATTAA
CBO2217 butA -51 5.5 ATGTTAATTAATTAACAT
CBO1579 COG1115 -144 5 TTGAGAGAAAATTAACAA
CBO0345 adhE -178 5.7 ATGATAAATATTTAACAA
CBO0345 adhE -121 5.8 TTGTTAAATAAATAACAA
CBO1438 adhA -87 5.4 TTGTTAAAAAAATAACTA
CBO0246 maeB -145 5.7 TTGTTAATAATATAACAA
Clostridium butyricum 5521
CBY_3016 etfB -198 5.3 CTGTTAAAAAAATAACAA
CBY_3325 narA -169 5.2 TTATTAATTTTTTAACAA
CBY_3325 narA -148 5.1 TTGTTAAAAAAAGAACAA
CBY_3041 crt -98 5.6 TTGTTATAATATTAACAA
CBY_2919 ptb -55 5.4 TTGATATAATTTTAACAA
CBY_1290 thlA -81 5.4 ATGTTAATAATTTAACGA
CBY_1290 thlA -140 5.3 TTGTCTAAAATTTAACAA
CBY_3751 bdh -122 5 ATGATAAAAATATTACAA
CBY_3747 bdh -92 5.4 TTGACAAAAAAATAACAA
CBY_3643 fld -37 5.5 AAGTTAATTATTTAACAA
CBY_3753 adhE -104 5.5 GTGTTAAAAAAATAACAA
CBY_3753 adhE -146 5 TTGACAAAAAATAAACAA
CBY_2357 maeB -145 5.4 TTGTTAAAAAAGTAACAA
CBY_2472 butA -41 5.3 ATGTGAATTAATTAACAA
Clostridium kluyveri DSM 555
CKL_0591 nadO -75 4.7 TTGTTTTAATTTTATCAT
CKL_0454 crt -64 5.1 TTGTGATATTATTAACAA
CKL_0591 nadO -46 5.4 TTGTCAAAAAATTATCAA
Clostridium novyi NT
NT01CX_0385 pflD -198 5.4 TAGATAAATAATTAACAT
NT01CX_1610 etfB -70 5.2 TTGAAAAATATATAACAA
NT01CX_0604 hbd -233 5.4 ATGATATATATTTAACAA
NT01CX_0604 hbd -46 5.6 AAGTTAAAAAATTAACAA
NT01CX_0474 crt -69 5.2 TTGTTACTATATTAACAA
NT01CX_2324 bcd -114 4.7 GTGTTTTTTTTTTAACAA
NT01CX_0464 hyd -97 5.3 ATGTTACATATTTAACAA
NT01CX_0468 bdh -61 5.7 TTGTTAATAAAATAACAA
NT01CX_0309 COG1115 -30 5 TTGAGAGAAATTTAACAA
NT01CX_0278 ctfA -90 5.4 ATGACAAAAATTTAACAA
Clostridium perfringens ATCC 13124
CPF_2556 narK -44 5.4 GAGTTAAAAAATTAACAA
CPF_2052 narA -47 5.5 ATGATAAATTTTTAACAA
CPF_2585 crt -124 5.5 TTGTTACAAAATTAACAA
CPF_2657 ptb -190 5.2 GTGTTTAAAATTTAACAA
CPF_2657 ptb -43 5.7 TTGTTATAAATTTAACAA
CPF_2460 thlA -35 4.7 TTGATAAATTTTTACCTA
CPF_2460 thlA -115 5.6 TTGTTTAAAATTTAACAA
CPF_0098 ldh -64 5.1 TTGTTATATAATTAACTT
CPF_2855 adhE -286 5.2 TTGATAAAAAAATCACAA
CPF_2855 adhE -266 5.2 TAGTTAAAAAAATAACGA
CPF_0728 noxE -60 5.6 TAGATAAAAATTTAACAA
Clostridium tetani E88
CTC01847 frdA -40 5.5 TAGTTAATATTTTAACAA
CTC00400 PF04143 -39 5.2 TTGACAGATAATTAACAA
CTC01178 noxE -141 5 TTGAAAGAAATTTAACAA
CTC02427 crt -245 5 TTGTTATAAATTCAACAA
CTC02427 crt -104 5.6 TTGTTATAATATTAACAA
CTC00312 thl -64 5.3 TTGTTAATTTTTTAACTA
CTC00710 bcd -64 5.1 AAGTTAGTTATTTAACAA
CTC02422 bdh -157 4.8 AAGTTAAGTTATTAACAA
CTC02422 bdh -50 5.4 ATGTTAAAAATATATCAA
CTC02417 hyd -84 5.4 CTGTTAATAAATTAACAA
CTC02546 ptb -48 4.8 TAGTTAAAAAGATATCAA
CTC01366 adhE -139 5.5 TTGTTATATAATTAACAT
CTC01488 frdA -147 5.4 TTGACAAAATATTAACAA
Export
Regulatory Sites [ FASTA format ] DOWNLOAD
© 2009-2020 RegPrecise