Collection of Manually Curated Inferences of Regulons in Prokaryotic Genomes
-- version 3.2 --

Profile of regulator T-box(Tyr) in Lactobacillaceae

Properties
Regulator family: RF00230
Regulation mode:
Biological process: Amino acid metabolism
Effector: Tyr-tRNA
Regulog: T-box(Tyr) - Lactobacillaceae
Member of regulog collections
Transcription factor binding sites
Locus Tag Name Position Score Sequence
Oenococcus oeni PSU-1
OEOE_1815 tyrS -209 72 TCTCGGCTGATAGTAGTGGATTGGCGGTCACACAGAAAGTTGGTGGAGCTGAAAACCAACCCAGAAAATTCATGAATTACACAGCAAACTTTGAGATCCGTCTCGATAATTAAGTTGGTGTTTTCCTTGAAAACACAATCCGGGTGGTACCGCGGAGAAATTCGTCCCGATTAT
Lactobacillus reuteri JCM 1112
LAR_0142 tyrS -238 69.3 CAAAGATGAAGAAGTAATCTTAGTAGTAAGCGGTTGGACATTTAGGAAGCAAGTGGTAACTGTAAACTTTGCCAATGCCGTTATACGAATTACACTTACGGAGTCTTTCAGTATTTGAACGGATCGTCTCGTTATCGACTAGAGTGGTAGCTAGCTAGCTGCAATCAAGGTGGTAACGCGGTAAATCGTCCCTGACTT
LAR_1714 tyrT -250 61.1 ACAATTATCGTTTCAGTAGAACCTTCGTTGGGCGTAAGAGAGCCGGTGGTTAGGTGCGAACCGGTCAGGCGGAGTGTTTCGAATTATCACGTGATCTGAATTGTCCGGCCATATTCAGTGCCGTTACCACCTGATATGAGTGCGCATAAAATCAAGATGCGTAGGTGGGTGGTACCGCGATTAAAATAATCGTCCCGTTGAT
Lactobacillus helveticus DPC 4571
lhv_0208 tyrS -219 49.9 TAACTAACGAATGAGTAGCGAATCGGCTCAGCGTTCAGAGAACTAGCGGGTGGTGTGAGCTAGACAGGCCGGTTTTAGCGAATTACTTAATAGGGTTGCTCCTTTACAGGCTTTAATAAGGCGCAATAGCGCAAACGTGGGTGGTACCACGGCTAATAATGTAATTTAGTCGTCCCTTGATC
lhv_0562 tyrT -243 68.9 TCAACAATCAACGACAAAGTAGCTACTTCGTTAAGCGTTCAGAGATCTGGTGGTTAGTGCGAACCAGTCAGGCGAAGTTAGACGAATTACATCGTGATTCAATATTGTTCGGATAACTTTTCAGAACCGTTACCATCTGATAGAGATTCAAGCTCTTACGCTTGAAAGAGTGGGTGGTACCACGGCTATCGTCGTCCCGTTG
Lactobacillus fermentum IFO 3956
LAF_0068 tyrS -249 61.5 TAGTTACATTGTGATGGGAACCCAGTAGAAGCCGTCCCGCTGGCCAAGGGAGCTAATGGTGGTTGGGAATTAGCGCACGGGCGGTCTTCGAATTACACTCCCATCAATTTTTAATCTAATCCGCGTTAAATGAGGTGCGTTTTTACGCATAAAAATGGGTGGTACCACGGCTGATTCGTCCCTGTG
Lactobacillus salivarius subsp. salivarius UCC118
LSL_0931 tyrT -305 78.1 TAATTCTAATGGAACCCAGTAGTTAGATACTCCCTGGCTAAGAGAGTTAACGGTAGCTGCAAGTTAAACCATAGTATTCTAATGAATTACAACCATCAAAATTAGAATTGCGTTTGCTTACGATACAGCGATTGAGGTGCAAGTTATTGCATAAATACTGGGTGGTACCACGAGAATTTCGTCCCACGGCT
LSL_1366 tyrS -242 107.3 TATTAAAGCGATGAAGTAGATTAGTAGATTTGATAGTCAATTTTTAAGAGACTTGGTGGTGCTGCGAATCAAGATAAACTATCAATCGAATTACACTATGGAGCTTGTCCGGGTCATTCCGATAAAGATGACAGAGCGGCTTTTTAAGCAATCTGGGTGGTAACGCGGAAATAATTTTTCGTCCCTAAT
LSL_0855 tyrT -317 58.2 TCTTATTAATGATTTAATTAGACTTTAATCTGGGTGTCAGAAAGCTAATGGGTGATGCGAATTAGTCAGGATTAAATGTTCGAAATACATATAAGTTCGGCTAGTAGGACCGTTATTGCCTACATGGAGTGGAACTTTAATAGTTCAATGTGGGTGGTACCACGGTTATTTAGATCGTCCCAGTTAT
Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC BAA-365
LBUL_0219 tyrS -222 49.1 AAAACGCGACAATGAAGTAGCTGCTTGGTTCAGCGTTCAGAGAACTAGCGGTTGGTGCGAGCTAGACAGGCCAGGCAGACGAAATACAGCGCGGGGAAGGAGAACCCCGTTAAGAAGCTCCCAAGAGGCACTTTGTGCGAACGTGGGTGGTACCACGGCTAAGACAGAATTTAGTCGTCCCTGGATC
LBUL_1680 tyrT -305 57.7 AAAATTCGAGTGATCTTTTAGTAGCTGCCAGGCTCAGCGCTCATAAAACCGGTGGTTGATGCGAACCGGACAGGCCTGGAGCAGCGAATTACGGGATCAAGCAGTTCGGCCGGTCTAGCCCCGTTACGGCTAAAGCAAGTGCAGCATGCTGCAAAGTTGGGTGGTACCGTGCCTATAAGCGCCCCAGCCTG
Lactobacillus acidophilus NCFM
LBA0192 tyrS -222 58.2 TCATTATTAACACAAGTAGTAAATCGATTCAGTGTTCAGAGAACTAGCGGTTAGGTGTGAGCTAGGCAGGTCGATTTTGACGAAATACTGATAGGGTAGTTTCTTTATCAACTATTTTGAGATGCCAAATAGGCATGAACGTGGGTGGTACCACGGCTAAAGAAGATAATTAGTCGTCCCTTGAGA
LBA0538 tyrT -237 68.5 CAACAATTAACGAAACAGTAGCTGCTTCGCTCAGCGTTCAGAGAACTGGTGGTAGGTGCAAACCAGACAGGCGGAGTTAGACGAATTACTTCGTAATTATTATTGCTCGGAAATGTTCAGATCCGTTACCATCTGATAGAGATTCAAGCTATGATGCTTGAAATAGTGGGTGGTACCACGGCAATCGTCGTCCCGTTG
Lactobacillus johnsonii NCC 533
LJ0175 tyrS -206 50.1 CATAGGTAATAATAGTAGCAACTTAATTCAGTGTTCAGAGAACTAGCGGTTGGTGTGAGCTAGGCAGGTTAAGTGAGCGAAGTACATGGTGGGGTAGTTTCCGTATCAACTATATTTAAGGCGCATTAGGCGTAAACGTGGGTGGTACCACGGCTAATAAAGTAATTTAGTCGTCCCTAGATT
LJ1701 tyrT -223 59.6 TAATTATCGTCACAGTAGTGCTTATGTTAAGCGTCAGAGAGCTGGTGGTGAAGTGCGAACCAGTCAGGCATAAGTTACGAATTACAACGATTCATCTTTATTCGGCCACAATCAGTGCCGTTACCACCTGATTAGAGTGCTGCAATCTGCAGTAAATAGGTGGTACCACGGTAATGCGTCCTGTTGAT
Lactobacillus plantarum WCFS1
lp_3338 tyrT -362 76.1 TAACTGTACGATAACGTTACATCAAGTAGACATAGTGGTAGGTGTCAGGAAGCCGGTGGTTGCTGCGAACCGGTCAGCTACTATGATTGAAATACGGTAACCGAGTTTCGACTGAACGGATAATAACTAGAACCGTTATCTTCTAGTGAGTGGTGGATTAAGTGTCAATAATCCGCAACCTGGGTGGTACCGCGACTAGTCTAATCGTCCCTGTT
lp_0192 tyrT -340 65.3 ATAACGAACGATAATCTTACTTTCAAGTAGCGAATTAACTGTGCGTCAGGAAGTCGGTGGGTGCTGCGAACCGATCAGGTTAATCTCGATGAAATACGGTAGGAGAGGTCCGGGTACGCCCGGCGGATAACAACTAGAGCCGTTAACTGCTAGTGAGTGGAGTCATATTGTGGCTCAAGCTGGGTGGTACCACGGTCTAATCAATCGTCCCTGTT
lp_2807 tyrS -249 106.1 TTAAAAAGTAGTGATCGTTAATTAGTAGTCGTTGACCCAACAGTCTAGCGACTCGGTGGGTGGTGCGAACCGAGCTGTGGTCAAAGATGAATTACATAACGTGAACTGCCATTGGCCGGATGATATCCGTTACTAATCAATGAGCGATCACATTTGGTGATAACTTGGGTGGTAACGCGGAAAACTCGTCCCTGTT
Lactobacillus casei ATCC 334
LSEI_2031 tyrS -432 76.7 CATAAAGTCACCAGATGAGCCGCAGTAGTGGTCCTAGGCAGGTCTAAGAAAAACGGTGGTTGCTGCAAACCGTTCCGCCTTTGATTACGAATTACACCTCAATGAAAGCCTGGTTAACGGGTCATGCCGATATCCATTAGAGTGATGCAAAGCATAATGTGGGTGGTACCGCGGTGAAAATCGTCCCTGGT
Lactobacillus brevis ATCC 367
LVIS_0199 tyrT -278 59.6 TAATTTCCATTACCAAGTAGCGTGTCATCTGGGTGTCAGAAAGTCGGTGGTTGCTGCGAACCGATCAGGGTGATTACGACGAAATACAGTGGGATGTCCTGGTCCGCCAGGCGGGAAATAACTAGAGCCGTTACCTTCTAGTGAGTGGAGTGACTGGGTCTAGAACCAGTGGCTCAAGTTGGGTGGTACCACGGTTTAGTCTAAAATCGTCCCTGTTGC
LVIS_2216 null -459 51.7 TAAGAAATCTTTCAAACGAAGTAGTGACTTATCTGAGGGTTCAGAGAATTGGCGGTTGGTGCAAGCCATGCAGGGTAAGCTTAACGAAATACGAAAGGTGTTTCTTCGGGGTATCTCCACGTTATTGGGGATTAAAGTGCAGCGGACTTAGGTCCCTGAAGCTGGGTGGTACCGCGCTAAGGCGTCCCTTCT
LVIS_0424 tyrS -251 99.6 CATAAGCAAAGAAGCAGTTCAGTAGTGGTGGCGGCTCCGGTTGAGAGATTTGACGGTGCTGGGAGTCAAAACGTCCGTGGCCATGAATTACCCTGTGGAGCGGCCGAGGTGTCGGCGGGTCATTCCGTTAACAATGACGAGCGGTTGTCAATCGACAACAACTTGGGTGGTAACGCGGATTTCAATTCGTCCCTGATGG
Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K
LSA1827 tyrT -386 61.4 TCATCTCATTCAAACCAAGTAATGCTTTATCTGTGTGTCAGGAAGTCGGTGGTTGCTGCGAACCGACCAGGGTAAATGTCGTGAAATACTGAATGAAGACTTCGGCTAATTAACAGGACCGTTACCCCCTGTAAGAGTGGCGTGTTGGCTTAAATTGGCGCGCTAAATGGGTGGTACCGCGGTTTCCAATCGTCCCTATTCG
LSA0769 tyrS -256 66.9 AAATATCAATGACCGCGTAATGAGTAGAGAATAAGCCACTATATCAGAGAGCTGGGATTGCTGGAAACCAGTATATGCTTAGAATCGAATTACAATACGCTAAGTGGTCAGACGTGTGATTGACGTACCAATCAATGAGTGATGCTAGGCAACTAGCATAATTCGGGTGGTACCGCGAACTTAAACTTTAAGTCGTCCCTATAAT
Pediococcus pentosaceus ATCC 25745
PEPE_1838 tyrT -262 64.2 CATTTTAACTTTCACATTAAGTAGTGCATAATCTGGGTGTCAGAAAGTCGGTGGTTGCTGCGAACCGATCAGGGTTATGTTGTCGAAATACCGTGGAATAGTTTAATTTAACGGAAAATAACTAGAACCGTTATCAATCTAGTGAGTGAAGAGGTCTTTTTGGGTTCTCTTAAGCTGGGTGGTACCACGGTCTCCATATCGTCCCTGTT
PEPE_0235 tyrS -263 100.8 ACGAAGCTTTGAAGTAGCATAGTAGGTTATTAAGCAAGCAAACAGAAATCTGGTGGGGATGCGAATCAGACTTGTTAATGACGCGAATTACACTATGGAGCTTTCATTTAATGAACGGATCATCTCGTTATCGATGTTGAGCGGAGTATTGATACTCAATCAAGGTGGTAACGCGGAAAAATTCGTCCCTGATCT
Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293
LEUM_2006 tyrT -262 64.5 CATAAATACTAAGTAAGATTGACATTCGGGGTGAAGAGAAGCAGTGGTTGGTGAAAACTGCGCAGGTGTCGTTATCTGAAATACAGCTATTAATATTTAAGCGTGGCAACACCATGTTATCAAATGTTAAAGTGATGCGTTTTTGACGCGTAAGCTGGGTGGTACCACGGATTTCTGTAAATGTCGATTCGTCCCTTCT
LEUM_2044 tyrS -232 87.6 ATTCATTACACTGATAAAGATAATATCATACGCGTCAAAGAGAGTTAGCGGCTGCTGTGAGCTAATCCGTGGATATTGTTGAGTTACACAGTGTGCAAATCAATGACGTGTGCCGCGATAAGGCATATTAAGTGGTAGGTCCGATGACTTACAATTTAGGTGGTACCACGGTGAAAATCGTCCTAGTC
Lactobacillus rhamnosus GG
LGG_02017 tyrS -294 74.2 TATAAAATTTACCAGCTGAGTCGCAGTAGTGTTATCTAGGTAGGCTTTCAGAAAAACGGTGGTTGCTGCAAACCGTTCCACCTGATAGCACGAATTACAGCTCAATGAATTCTGGCCGCGGGTCATGCCGATATCCATGAGAGTGATGCAAAGCATAATTTGGGTGGTACCGCGGTGAAAGTCGTCCCTGAT
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