Collection of Manually Curated Inferences of Regulons in Prokaryotic Genomes
-- version 3.2 --

Profile of regulator T-box(Trp) in Streptococcaceae

Properties
Regulator family: RF00230
Regulation mode:
Biological process: Amino acid metabolism
Effector: Trp-tRNA
Regulog: T-box(Trp) - Streptococcaceae
Member of regulog collections
Transcription factor binding sites
Locus Tag Name Position Score Sequence
Streptococcus pneumoniae TIGR4
SP_1817 trpE -298 92.4 AATAATAGATGGAAAAATTACAGTTCTTTCTCTCACAGAGAGCTTGTGGTTGCTGAAAACAAGCAGAGAAAGCTGTAAAGTTGGGTTCATCTGAAACGAGAGAAGAAAACATCATTCTCAAGGGAGTGCCCTTTATCGCACAGCCTGTTACAGGAGATATCTGAGACAGGAATGAGAGATAGGAGAAATCCTATAATTGAGGTGGCACCGCGAATTTCGTCCTCACG
SP_1069 trpX -299 105.6 TAACCATTCAGAAAAGTAATCATACAAACTTTTTAGAGAGTCTGTGGTAGCTGAAAACAGATAAGTGGCAATGATGAAAATTGGGCTGAATGCTATTTAGAATTTGAAATTATAAAAATTCGGTAAGCACACCTTACAGTGCATCTCGTTATTGCGAGACTGAGCGATAGGGAAATTCCCTATAATTGAGGTGGTACCGCGCATCGACGTCCTCACACA
Streptococcus gallolyticus UCN34
GALLO_0582 tyrA -215 38.8 AAAACAAAGTGAAGCAAACGCTGATGATGAGTTGAGAATTAGTGGTACGTTTCAGGTAGGCACCCCTTATCGTGCAGCTCCTTGTTGGAGGAGATAGAGATGACGAAACTTATTTTTCGTTAAATGAGGTGGCACCGCGCTAACTAGCTTTAGACGCCCTCACACA
GALLO_2256 trpS -257 89.6 GAAGAAGATTCAGAAGAGTAATGTAAACGCGTACTTTTAGAGAGCTGATGGTGCTGAAAATCAGTAGTACCCTTGCATGAATGGGCTGATGTATATAATGGAAAATAATGTTTGCATTTATCTGTGAACTTTTAATAGTGGTAAGAGATGGTAGAAAATTTTCTATCAATTGAGGTGGTACCGCGTATTAATAACGCCCTCACG
Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis GGS_124
SDEG_2167 trpS -298 91.3 GAATAATGCTACGTTAGAAGAGTAATCTTTTCCTTGTTTTTAGAGAGTTAGCGGTAGGTGCGAGCTAACAACAAGCAAGATGAAATGGGCTAATGGTTATAGTTTGGAAGGAACACATAACTTTCAGGTCGGCACCCCTTATCGTGCAACTTCTTAATATGGAGAAGATTGAGATAATATCCTGTTTTATTGTGGGTATTAATTGAGGTGGTACCGCGTATTACTTGTCATAACGCCCTCACG
Streptococcus suis 05ZYH33
SSU05_1487 trpX -372 33.2 AGGAGAGTTAACGAAGTAACTAGCCAAAACAGTCACGTAAATGAACTTAAAACAATGATAGTTCGGTCCGCACACCTTACAGTGCAACTCCTTGTTAGAGGAGATGAGATATGGGAGGATTCTAGACAATTCCCATAAGTGAGGTGGCACCGTGTCATTGACGCCCTCGCA
SSU05_2184 trpS -188 98.6 TATAATAGGAATCAATCAGAAGAGTAGTAAGTGGATAATTTTTAGAGAGTTTGTGGTTGGTGTAAACAAACAAGAGTCGCTTATGAATGGACTGAGTGAATAGAATCTGAATAAATAAGGATTCGGCTAGCAGGCCTTATGTGCAAAAAGATGTAAGCTTATTTAATGCTTATAAGTGAGGTGGCACCGTGTCCTTGACGCCCTCGCA
Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403
L0358 trpS -340 94.1 TAAAATTTAAAACAACAAGAAAGTAACTTTGATTTTGAAATCTTTAGGAAGTTGGTGGTTGTGCAAACCAACGTTTTCAGCAAAGTGAATGGGCTTGTGATTAACTAATAAATTTGATTTAAAAAAATAAAGAATCACGGCCGCTTCCGTTACAGAGCAACTTGTTTTTTGACAAGTTCTAAGAAAATCATTTGATTTTAAATTTACGGTGGCACCGCGCTCAAAGCGCCCGTAGG
L0054 trpE -315 45.1 TTTGAAAGTCGAGAACGATTTGTTTTTCGCAATTTGATTTGAAACAATAAAAATCACGGATGCTCCCGATACCAAGCGACTTGTTGTTAGACGAGGAAAAGAAGAGTTTTTCTAGTATTTTTTTAATACTTTTAGGGACTCTTAAATTACGGTGGCACCGCGTGACATACGCCCGTAGA
Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11
LACR_0058 trpS -341 92.3 TAAAATTTATTACAACAAGAAAGTAACTTTGATTTTGAAATCTCTAGGAAGTTGGTGGTTGTGTAAACCAACGTTTTCAGCAAGGTGAATGGGCTTGTTATTAACTAATGAATTTGATTTAAAAAAATAATGAATCACGGCCGCTTCCGTTACACAGCAACCTGTTTACTGACAGGTCTTAAGAAAATCATTTGATTTTAAAATTACGGTGGCACCGCGCTCAAAAGCGCCCGTAGG
LACR_1560 trpE -312 40.9 ATTTAAAGTCGAAAAGTCTTATTTTTCGCAATTTGATTTGAAACAATAAAAATCACGGATGCTCCCGATACCAAGCGACTTGTTGTTAGACGAGGAAAAGAAGAGAATTTTCTAGTATTTTTGTAATACTTTTAAGGACTCTTAAATTACGGTGGCACCGCGTGGAATACGCCCGTAGA
Streptococcus uberis 0140J
SUB1863 trpS -272 98.3 TAAAATAATTTTGAATTAGATGAGTAACTTTTTAACTATTTTTAGAGAGCTAATGGTTGCTGAAAATTAGCAGTAGAAAAAGTGAAATGGGCTAATGTTTCGTGAGAGGAACCAATAACTCTCAGGTTTTGTGCACCTTATCGTACAACTTCTTGTTAGAGAAGATGAGATAATATCTAGTATGATATTAATTTGAGGTGGCACCGCGTCATTGAGTAATAACGCCCTCACG
Streptococcus sanguinis SK36
SSA_0908 trpX -359 83.3 AAAATATAGGAAATTAGAAAAGTAGTAGATGCATTTGTTTTTAGCGAGCTTGTGGTTGGTGGAAATGAGCAGCAAATCTTTACGAAATTGGGCTAATGGATAAAATGAATTTGAAACAATAAGAATTCGGTGGGCACACCTTACAGTGCAGCTTGTTTGATGACAAGACAGAGATATGGGGAATATTAGCTATTTTCCATAATTGAGGTGGCACCGCGATTTACGCCCTCACACA
SSA_0632 trpE -404 80.9 AATACCCAGCAGAAGAGTAGTAACATCCCTCCTTTCAGAGAGTCTGTGGTTGCTGAGAACAGGCAGGAGAAGTTATGAAATGGGCTGTTGGAGTCAACATTTTGTCCTTTAGTTGAACTTTTATTATTTTGTTAGCTTACTTTGCTGTAAAATAGTATGCTGCCTTCTGCTAAAAGGAATCTAAATGACTGTAAATAAGTAAATGAGATGTGGAGCCTAAAAACTCCATAACTGAGGTGGCACCGCGATGATACGCCCTCACAGG
SSA_0631 trpB2 -289 101.6 TAAATCATCAGAAAAGTAATAATTTTTCTACTTTCAGGGAGCCTGTGGTTGGTGGAAACAGGTAGTGGGGGATTATGAAGTGGGCTGATGTAAAAAATGAATTTGAAGCAATAAAAATTCGGTGAGCACACCTTACAGTGCAACTTGTTGTTAGACAAGACAGAGATATGGAGGCAGTCTATACTTTGCTCCATAATTGAGGTGGCACCGCGATTATACGCCCTCACACA
Streptococcus pyogenes M1 GAS
SPy2207 trpS -297 102.5 TAGAATAAATCTAAATTAGAAGAGTATTCTTTTCATGTTTTTAGAGAGTTAGTGGTTGGTGCAAGCTAACAACAGAAAAGGTGAAATGGACTAATGATTATTTGAAAGGAAACCATAACTTTCAGGTTGGCACCCCTTACCGTGCAGCTTCTTTCATTGAGAAGATTGAGATAGTATCTCGTTTTGATAAAGCAGATGCTAATTGAGGTGGTACCGCGTATTACTTGTAATAACGCCCTCACG
Streptococcus mutans UA159
SMU.531 tyrA -287 82.2 CGTAAGAAATAAATTAGAAAAGTACCAAACCTTTTGTTTTCAGGGAGTCTGTGGGTATTGTGAACAGGCAGCAGAATTTTGGGAAGTGGGCTGATTTTTAGAAAGCGAAGATAAACAATATTCTTCCGGTGAGCACACCTTATCGTGCAACTCCTTGTTAGAGGAGATTAAGATAACGGGGAAAGACTATTGGTTCCCGTTAATTGAGGTGGCACCGTGTTAGCTAGATTTAACGCCCTCACACA
Streptococcus thermophilus CNRZ1066
str1594 tyrA -337 60 ACAATAGTGAGTAAATCAGAAAGTAACTGGTCTTAGATTTTCAGGGAGCCTGCGGTGATTGTGAGTAGGTAATCGAGATGAGCGAACATTGGGCTGATTGGATGATAATGAGAAGGTAATACATATCCTTCTCGGTTGGCACCCCTTACCGTGCAACTCCTTGTTAGAGGAGATAGAGATGATGGTCGTTTTTTTGGAGACCATTAACTGAGGTGGTACCGTGTTAAACTAGATTTAATGCCCTCACA
str2018 trpS -285 82.1 AATAATAGTCATCAGAAGAGTAATTCTTCCTTTCTTTTTTAGAGAGCTGGTGTTAGGTGTAAACCAGAATGAAGGTGGAATGAATGGGCTGAGGAAAATTGACGAGTAACGTGAACACATAAACGTTAGGTTTGGCACCCCTTACCGTGCAACTTCTTTGTTGAGAAGTTTTGAGATGATAGCTTTACAAAGAGTTATCGACTGAGGTGGTACCGCGTATCAAAAGTGATTAACGCCCTCACG
Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1
SGO_0656 trpB2 -289 101.5 TAAATCATCAGAAAAGTAATAATTTTTTCTACTTTCAGGGAGCCTGTGGTTGGTGGAAACAGGTAGTGGAAGATTATGAAGTGGGCTGATGTAAAAAATGAATTTGAAGCAATAAAAATTCGGTGAGCACACCTTACAGTGCAACTTGTTGTTAGACAAGACAGAGATATGGAGGCAGTCTATACTTTGCTCCATAACTGAGGTGGCACCGCGATTTTACGCCCTCACACA
SGO_0657 trpE -402 79.1 AATACCCAGCAGAAGAGTAGTAACATCCCTCCTTTCAGAGAGTCTGTGGTTGCTGTAAACAGGCAGGAGAAGTTATGAAATGGGCTGTTGGAGTCAACATTTTGTCCTTTAGTTGAACTTTTATTACTTTGTTAGCTTACTTTGCTGTAAACCAGTATGCTGACTTGAACTAAAAGGGATCTAAATGACTGTAAATAAGTAAATGAGATGTGGAGCCTGAAGACTCCATAACTGAGGTGGCACCGCGATGATACGCCCTCACAGG
SGO_0856 trpX -278 39.4 GTAATTTACTGATAAGCTAAAAGAATAAATGAATTCGAAACAATAAGAATTCGGTTGGCACACCTTACAGTGCAACTTGTTGGTAGACAAGGCAGAGATATGGGAGAATGCTATTTATTTTTCCATAATTGAGGTGGCACCGCGATTTACGCCCTCACACA
Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565
Sez_1954 trpS -295 91.2 TAGAATGGCCCTAAACTAGATGAGTAATCTTACCCTTGTTTTTAGAGAGCTAGTGGTCGGTGAGAGCTAGCAGCAAGCAAGATGAAATGGACTAGTGGATCTTTTGAGAGGAAACCATAACTTTCAGGTCTGGCACCCCTTATCGTGCAATTTCTTGAGTTGAGAAGATGAGATAGTATTGATTGATTAGAGATACTAATTGAGGTGGTACCGCGTATTTATTGTAATGACGCCCTCACG
Streptococcus mitis B6
smi_0988 trpX -328 104.9 TAACCATTCAGAAAAGTAATCATATAAACTTTTTAGAGAGTCTGTGGTAGCTGAAAACAGATAAGTGCTGATGATGAAAATTGGGCTGAATGTTATTTAGAATTTGAAATCATAAAAATTCGGTGAGCACACCTTACAGTGCATCTCGTTATTGCGAGACAGAGCGATAGGGAAATTCCCTATAATTGAGGTGGTACCGCGCATCGACGTCCTCACACA
Export
Regulatory Sites [ FASTA format ] DOWNLOAD
© 2009-2020 RegPrecise