Collection of Manually Curated Inferences of Regulons in Prokaryotic Genomes
-- version 3.2 --

Profile of regulator T-box(Ser) in Clostridiaceae

Properties
Regulator family: RF00230
Regulation mode:
Biological process: Amino acid metabolism
Effector: Ser-tRNA
Regulog: T-box(Ser) - Clostridiaceae
Member of regulog collections
Transcription factor binding sites
Locus Tag Name Position Score Sequence
Clostridium kluyveri DSM 555
CKL_3817 yurG -299 107.3 ATATTGTCTTATGAAGAGAATAGTAACATGAGTTCAGGTAAAAGAGAGTCAGTGGTTGGTGTAAACTGGTACCCATACTTTTGTGAATCCGCCTTGGAGGATTATTATGATGAATAATACGGAAAACCGTTATTTGAGTTGAGAGAATTATACATAAAAGGTATAATTAATAAGGGTGGCAACGCGAGTCAATCGTCCCTAAA
Clostridium cellulolyticum H10
Ccel_3183 serS -286 96.6 AAAAACAGCGATTATAAAAGCTATGATTTATTTACTTCTCAAGAGAGCCGATGGGTGGTGAAAATCGGTGAAAGAATAGATCTATCCACTTTTGGAGCTGTCGGTGATGAATCGAAAGGTTGGTACCCTTTATCCTACTTATGTCGAGAGGTCGGTAATTTACATACCGGCAATTTGGGTGGCAACGCGGATACCTTCCGTCCCAGTA
Clostridium phytofermentans ISDg
null serS -392 97.5 TCACGGTGATGATAAAAGCTACGATTTTTGTATTTGTTCAGAGAGCTGATGGTTGGTGTGAATCGGTCAAAGAAAAAATCTATCCACTTTTGGAGCCGGCAGTGAAAGCTGCAAGGTTAGTACCCTTTAGCGTACTTTATTGAGTGGCCGGTTTAACGGCAATTTGGGTGGCAACGCGGAATCCTTTCGTCCCATGTAA
Clostridium tetani E88
CTC00081 serS -255 116.3 ATTGAAACCTATGAAAAGGCTAGTAGCAATATAAAAGTCTTTAGAGATTCAGTGGTTGGTGAGAACTGAAACTATTTATTTTGTGAATCCACCTTGGAGGGATTGTGATAATAAACAGTACGTTAAGCACGTTAAGCTTATTTTAAAGAGGATTAATTTTACAAGTTAATCAATTAGGGTGGCAACGCGGAGTCTTTCGTCCCTTTA
CTC00695 yurG -275 118.5 TTAAAAAGCACTGAAAGGTAATAGTAAACAAATCTTTATTTAAGAGAGTCGATGGTAGGTGTAAATCGATAATAAAGATTGTTGAATCCGACCTAGAGCTGCATAGGGGTAACAACCTATGCCGGATTAATTCCGTTATAATTTTAAAGTCTACTCTTTTATTTAGAGTAGTAAATTAAGGTGGTACCACGTGATTATTGTAAATCCCGTCCTTAGC
Clostridium acetobutylicum ATCC 824
CAC0014 yurG -376 108.2 ATAAACCGTTGAAGAGAATAGTAACTGTTTAACAATTTTAGAGAGTCAGTGGTTGGTGAAAACTGATATTTGTTATTTAGTGAATCCGCCTCGGAGGGATTGCGATGAGCAATACGGCGATTGTGTCGTTAAATTTCAATTAAGATAATCATTTTAAATGATTAATTAGGGTGGTAACGCGGTCTTTCGTCCCTTACGT
Clostridium botulinum A str. ATCC 3502
CBO0510 serS -285 92.7 AAACAGTGTTGATAAAAGCTACGATTTATAAATTTCTTCAGAGAGCCGATGTTTGGTGAGAATCGGTGAAAGGTTAAATCTTTCCACTTTTGGAGCTGCTAGTGATAAACTAAAAGGTTAGTATCCTTTATCTTACTATTGTCGAGTGGCTGGTTCTTATGGTAGACTGGCAATTTGGGTGGCAACGCGGATACTTCCGTCCCATATTT
CBO0016 serS -283 131.1 TAAAACCTGTGAAGAGGAGCAGTAACTATATGAAGTTTTAAGAGAGTTAACGGCTGGTGTAAGTTAATAACCTTATATTGTGAATCCACCTCTGAGGGACTGTGGTAAAAACAGTACGGATAACCGTTATAATTAAGAGAGGATCATTTTATGATCAATTAGGGTGGCAACGCGGAGCTTTTCGTCCCTTTTAT
Clostridium novyi NT
NT01CX_0848 serS -274 120.3 ATTTAAACCATTGAAGAGAATAGTAGCAATATATTTTAGTTTTAGAGAGTGAATGGGTGGTGCAAATTCATACTAAAAGTTTTGTGAATCCAACTCTGAGGGATTGTGATAAACAATACGGTAAAACCGTTAATATTTAAAGTGGGTTTATTTATAAACCAATTAGGGTGGCAACGCGGAGTCCTTTCGTCCCTACA
NT01CX_0729 yurG -352 110.5 TACAAAAGCTATGAAGGGTAGCAGTAAATAAACTTTCATTTTAAGAGAGTGGATGTTTGGTGTGAATCCATAATGAAACTTATTGAATCCGACCTGAAGCTGCATTGGAGTAACAACCGATGCCGGAGTTATCCGTTACATAATGAGGCTGCAATAAAGCAGTAAACTAAGGTGGTACCACGTAGATAACTAAGAATATATCTCCGTCCTTGAA
Clostridium perfringens ATCC 13124
CPF_0014 serS -293 115.7 ATAAACCGTTGATCAGGCTAGTAATGTTATATATTGCTTTCAGAGAGCTAGTGGTTTTGGTGTGAACTAGTACAATATTTTCATGAATCCACCTGTGAGGGACTGTGATGAGCAGTACGGAATTAACCGTTAAAGTTTTTAAGAGGATAAAATCTTTTTTTGATTTTATCAATTAGGGTGGCAACGCGGAGTCTTTTCGTCCCTTTTTA
Clostridium difficile 630
CD0014 serS -330 132.4 AAAAAGCTGTGAAGGAAAATAGTAAAAAACAGATTGTATTCAGAGAATGAGTGGATGGTGAAAACTCATTACAATGGTTTTTGAATCTACTCTAGAGCTTCTAGTTAAAGCTAGACGTTTACCTACGTTATAGGTCTGAGAGGATTATACATTTTAGTATAGTCAATTAGGGTGGCAACGCGGATAAAAGATTTTCGTCCCTTTTAT
Clostridium beijerincki NCIMB 8052
Cbei_1431 serS -272 104.6 AAACAGCGATGATAAAAACTACGATTTATAAATTTCTTCAGAGAGCCGATGGGTGGTGCGAATCGGTGAAAGGTTAAATCTTTCCACTTTTGGAGCTGTGCGTGATAAATGCAAAGGTTAGTAACCTATATAATACTAGTGTCGAGGGGCTGGTTGTAATATTAACCAGCAATTTGGGTGGCAACGCGGATTATTCCGTCCCAATTAT
Clostridium sp. OhILAs
Clos_0014 serS -397 129.2 TTAATGCGAAGAAGAGAAATAGTATACAAGTAGCTTCTAAAGAGAGTCGATGGTTGGTGTGAATCGATGTAGTAAATTGTTGAATCCATCTCTGAGTGTTCTGCTGAAGGAAACAGTATGTAGAAACGATTAGCACCCGTTAAAGTGCTTTAAGGTGGATTAGTATTCTAATCAACTAGGGTGGCAACGCGGAGAGCTCGTCTTTCGTCCCTTTTCT
Clostridium hiranonis DSM 13275
CLOHIR_02081 serS -343 134.3 TGAAAAGGCAATGAAGGAGCTAAGTAAAAAACAGTTCTGTTTACAGAGAGTGAGTGGTCGGTGTGAACTCATATCAGTGGTTTTTGAATCTACTCTGGAGCTTCTAATCTGAAATAAGTTAGACGTATTCCTACGTTACAGGATTTTGAGAGGAATGTGCATTTATAGGTGCATTCAATTAGGGTGGCAACGCGGATAACAGATTTTCGTCCCTTTT
Clostridium butyricum 5521
CBY_1480 serS -293 80.5 AATAGGCGTTATTATAAAAGCTACGATTTATTAATATCTTCAGAGAGCTGGTGTATGGTGCGAACCAGTGATTATTATAAGTCTTTCCACTTTTAGAGCTGCTGATGATAAATCAGAAGGTTTATGCCCTTTATAGCATAGTTTAAGAGGTTAATGTAAGTTTTTATATTGACAATTTAGGTGGCAACGCGGATTCTATTCGTCCTATTATG
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