Collection of Manually Curated Inferences of Regulons in Prokaryotic Genomes
-- version 3.2 --

Profile of regulator PsrA in Vibrionales

Properties
Regulator family: TetR
Regulation mode: repressor
Biological process: Fatty acid degradation
Effector: Oleate
Regulog: PsrA - Vibrionales
Member of regulog collections
Transcription factor binding sites
Locus Tag Name Position Score Sequence
Vibrio cholerae O1 biovar eltor str. N16961
VC1993 fadH -81 5.6 ATGTAAACACTTGTTTGATT
VC1046 fadI 69 5.7 ATTtAAACggcTGTTTGAtT
VC2758 fadB -136 5.5 TGTTAAACACTTGTTTAAAA
VC1741 psrA 16 5.5 TTTCAAACAGTTGTTTGATA
VC1985 fadD -130 5.6 ATTTAAACAAGTGTTTGAGA
VC0734 mdh -299 5.7 ATTTAAACACTTGTTTAAGT
Vibrio vulnificus CMCP6
VV1_3132 fadH -77 5.4 ATGTAAACGCATGTTTGATT
VV1_1975 fadI -78 5.7 ATTTAAACGCATGTTTGATA
VV1_0981 fadB -169 5.5 TGTTAAACACTTGTTTAAAA
VV1_2832 psrA -32 5.5 TTTCAAACAGTTGTTTGATA
VV1_0136 fadD -127 5.6 ATTTAAACAAGTGTTTGAGA
VV1_0450 mdh -270 5.2 AATCAAGCACTTGTTTGAAA
Vibrio harveyi ATCC BAA-1116
VIBHAR_03043 fadH -78 4.9 ATGTAAACGGCTGTTTGATC
VIBHAR_03121 fadI -78 5.7 ATTTAAACGCATGTTTGATA
VIBHAR_00460 fadB -186 5.5 TGTTAAACACTTGTTTAAAA
VIBHAR_02639 psrA -32 5.5 TTTCAAACAGTTGTTTAATA
VIBHAR_01379 fadD -112 5.6 ATTTAAACAAGTGTTTGAGA
VIBHAR_01041 mdh -348 5.6 ATTCATACACTTGTTTAAAT
VIBHAR_01041 mdh -265 5.6 AATCAAACACTTGTTTGATA
Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633
VP2151 fadH -87 5.5 ATGTAAACACCTGTTTGATT
VP2209 fadI -78 5.6 ATTTAAACGCACGTTTGATA
VP0030 fadB -175 5.5 TGTTAAACACTTGTTTAAAA
VP1229 psrA -32 5.5 TTTCAAACAGTTGTTTAATA
VP0870 fadD -112 5.6 ATTTAAACAAGTGTTTGAGA
VP0583 mdh -348 5.2 ATTCATACACCTGTTTTAAA
Vibrio shilonii AK1
VSAK1_03494 fadH -82 4.9 ATGTAAACGCTAGTTTGATT
VSAK1_03244 fadI -74 5.4 TATTAAACGACTGTTTTAAA
VSAK1_12702 fadB -136 5.5 TGTTAAACAGTTGTTTAAAA
VSAK1_06350 psrA -32 5.6 ATTCAAACATGTGTTTGATA
VSAK1_09078 fadD -174 5.5 AATTAAACAAGTGTTTGAGT
Vibrio splendidus LGP32
VS_0938 fadH -72 5.1 ATGTAAACGGTTGTTTGAAC
VS_0864 fadI -78 5.8 ATTTAAACGCCTGTTTGATT
VS_0041 fadB -147 5.5 TGTTAAACAATTGTTTAAAA
VS_1841 psrA -23 5.5 TTTCAAACAGTTGTTTAATA
VS_2220 fadD -112 5.1 ATTTAAACAAGTGTTTGAGC
Vibrio angustum S14
VAS14_05978 fadH -76 5.5 ATGTAAACAAATGTTTGAAA
VAS14_22297 fadB -132 5.4 TGTTAAACAAATGTTTAAAT
VAS14_00861 psrA -33 5.7 ATTTAAACATGTGTTTAATA
VAS14_17336 fadI -114 5.4 ATTTAAACACTTGATTGAAT
VAS14_17861 fadD -88 5.5 ATATAAACGCTTGTTTGATT
VAS14_14924 fadD -215 5.3 TTTCATACAAGTGTTTAAAA
Photobacterium profundum SS9
PBPRA2594 fadH -76 5.5 ATGTAAACAAATGTTTGAAA
PBPRA0064 fadB -115 4.9 TTTTAAATAAGTGTTGAAAT
PBPRA0961 fadI -135 5.7 AATAAAACATTTGTTTGAAA
PBPRB0510 fadD -179 5.4 AATTATACACTCGTTTAAAA
PBPRA2573 fadL2 -355 5.5 TTTAAAACGGTTGTTTTAAA
PBPRA2339 SO3908 -69 5.5 AGTTAAACGTATGTTTGAAT
PBPRA2573 fadL2 -373 5.1 TTCTAAACGCCCGTTTTATT
PBPRA0064 fadB -128 5 GGTTAAACAATTGTTTTAAA
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