Profile of regulator Rex in Clostridia-2

Member of regulog collections

Transcription factor binding sites

	Locus Tag	Name	Position	Score	Sequence
Clostridium bartlettii DSM 16795
	CLOBAR_02221	CD2707	-91	4.9	ACGTTAAGAATTTAACAA
	CLOBAR_01995	lldD	-94	5.5	ATGTTAAAAAAATAACAT
	CLOBAR_02282	glcA	-119	5.2	ATGTTAATAAATAAACAA
	CLOBAR_00255	hydC	-128	4.7	TAGATAATTAAATAAAAA
	CLOBAR_02282	glcA	-138	4.3	TTTTTATTAATTTAAAAT
	CLOBAR_00531	nadA	-113	4.7	AAATTAAAAATTTAACTA
	CLOBAR_00902	hydC	-125	4.4	TATTTAAATTTTTAAAAA
	CLOBAR_00502	adhE	-130	5.3	ATGTTAAACAAATAACAA
	CLOBAR_00502	adhE	-106	4.8	AGGTTAATAATATAACAT
	CLOBAR_00902	hydC	-169	4.9	ATGTTAAAAAAGTATCAT
	CLOBAR_00502	adhE	-188	5.5	ATGATAAAAAAATAACAA
	CLOBAR_01830	rex	-156	4.3	ATAATATATTATTAACTA
	CLOBAR_00711	rex	-37	4	TTGTTATGAAAATATTAA
	CLOBAR_00711	rex	-99	4.1	TTGGTATAATATAATCAA
Clostridium difficile 630
	CD2354	grdE	-264	5.5	TTGATAAATTATTAACAT
	CD2354	grdE	-187	4.5	TTGTTAAAAAAATAATTT
	CD2707	CD2707	-34	5.7	ATGTTAATAAATTAACAA
	CD2540	noxE	-112	5.2	ATGTTAAATAAATAACTA
	CD1170	PF09861	-113	4	TTGTTATAAAATAAATTA
	CD1054	bcd2	-193	5	TTGATTTTAAATTAACAA
	CD1623	fprA	-63	5.4	TTGTTTAAAATATAACAA
	CD2344	CD2344	-190	4.6	TTGTTAATTAAATCATAA
	CD2344	CD2344	-129	5.4	ATGTTAATTTAATAACAA
	CD2344	CD2344	-66	5.2	TTGTTAATTTAATAACGA
	CD2966	adhE	-146	5.1	ATGTTAAAAAAATAACTT
	CD2966	adhE	-103	5.6	ATGTTAATAAATTAACAT
	CD0171	rex	-96	4.6	TTGATATAATATAATCAA
Clostridium hiranonis DSM 13275
	CLOHIR_00687	adhE	-209	5.3	ATGATAAAAAAATATCAA
	CLOHIR_00139	phf1	-107	4.8	ATGTTAAAAATATAAAGA
	CLOHIR_00139	phf1	-87	5.1	TTGATAAAAAAATGACAA
	CLOHIR_00157	nadA	-210	5.5	ATGATAAAAAAATAACAA
	CLOHIR_00157	nadA	-38	5.4	TAGATAAAAAAATAACAA
	CLOHIR_00042	rex	-55	4.3	ATGTTATATAATAAACCA
	CLOHIR_00042	rex	-101	4	TTGATATAATATATTCAA

Export
	Regulatory Sites	[ FASTA format ]	DOWNLOAD

Collection of Manually Curated Inferences of Regulons in Prokaryotic Genomes -- version 3.2 --