Collection of Manually Curated Inferences of Regulons in Prokaryotic Genomes
-- version 3.2 --

Profile of regulator Rex in Clostridia-3

Properties
Regulator family: Rex
Regulation mode: repressor
Biological process: Energy metabolism
Effector: NADH
Regulog: Rex - Clostridia-3
Member of regulog collections
Transcription factor binding sites
Locus Tag Name Position Score Sequence
Bacteroides pectinophilus ATCC 43243
BACPEC_02251 adhE -48 5.5 TTGTTAAAATATTAACGA
BACPEC_03060 bdh -43 5.1 ATGATAAAAAATTAACGA
BACPEC_00707 ladH -55 4.9 GTGTTATAATTTTAACAG
BACPEC_01917 pckA -135 5.2 TCGTTAAAATTTTATCAT
BACPEC_01128 phf1 -57 4.8 GTGTGAAAATATTAACAT
BACPEC_03240 pflB -128 5.2 TTGTTGATTTTTTAACAA
BACPEC_01011 rex -69 4.4 TTGACATGATTTTAACGA
BACPEC_01494 por -158 4.4 TTGACAAAGGTTTAACAA
BACPEC_01011 rex 7 4.4 GCGATAAAAAAATATCAT
Blautia hansenii DSM 20583
BLAHAN_03194 bdh -65 4.8 TCGTTAAAAAAATAACGT
BLAHAN_03194 bdh -51 5 ACGTTAAAAAAATAACAT
BLAHAN_02079 pckA -179 5.2 TCGTTAAATTTTAAACAA
BLAHAN_02340 rex -40 4.7 TTGACTTTAATTTAACAA
Bryantella formatexigens DSM 14469
BRYFOR_04079 pckA -140 5.2 TTGTTAATAAAATATCAT
BRYFOR_02286 rex -59 4.6 TTGACATTTTTTTCACAT
Clostridiales bacterium 1_7_47_FAA
Cbac1_010100020622 adhE -92 4.9 TTGACATATTTTTAACGA
Cbac1_010100020622 adhE -50 5.6 TTGTTAATTAATTATCAA
Cbac1_010100013906 stpK -119 5.2 ACGTTAAAAATTTATCAA
Cbac1_010100015703 bdh -54 5.2 TTGTTAAAGAAATAACAA
Cbac1_010100019254 gap -54 5.2 TTGATTATTATTTAACAA
Cbac1_010100016333 ladH -81 5.7 TTGTTATAATATTAACAA
Cbac1_010100026864 pckA -69 4.6 TTGACTTTTAATTAACAA
Cbac1_010100011950 fba -39 5.2 TAGTTAATAAAATAACAA
Cbac1_010100009193 phf1 -106 5.5 TTGATATAAAATTAACAA
Cbac1_010100002579 pncB -140 5.6 TTGTTATATTTTTAACAT
Cbac1_010100019049 pgpB -86 5.3 TTGTGAAAATATTAACAT
Cbac1_010100004767 COG1959 -34 5.3 TTGTTATATCTTTAACAA
Cbac1_010100025357 asrA -134 4.6 ATGATAAATTTTTATTAT
Cbac1_010100025357 asrA -76 5.4 TTGTTATAATAATAACAT
Cbac1_010100026274 rex -77 4.3 TTGACATTTTTTTGACAC
Cbac1_010100004252 nadO -67 5.3 TTGTTAATTAGTTAACAA
Clostridium bolteae ATCC BAA-613
CLOBOL_06541 adhE -135 4.8 TTGACATTTTTTTAACGA
CLOBOL_00811 stpK -119 5.2 ACGTTAAAAATTTATCAA
CLOBOL_06541 adhE -93 5.6 TTGTTAATTAATTATCAA
CLOBOL_05214 gap -54 5.3 TTGATTAATATTTAACAA
CLOBOL_03318 ladH -92 5.7 TTGTTATAATATTAACAA
CLOBOL_02749 fba -37 5.2 TAGTTAATAAAATAACAA
CLOBOL_05631 phf1 -61 5.6 TTGATATAATTTTAACAA
CLOBOL_06020 pncB -141 5.5 TTGTTAAATTTTTATCAT
CLOBOL_05166 pgpB -81 5.4 TTGTTAAAATATTAACAG
CLOBOL_02457 COG1959 -33 5.4 TTGTTACAATTTTAACAA
CLOBOL_00463 asrA -133 4.6 ATGATAAAAATTTATTAT
CLOBOL_00463 asrA -75 5.4 TTGTTATAATAATAACAT
CLOBOL_04148 rex -79 4.3 TTGACATTTTTTTGACGT
Clostridium nexile DSM 1787
CLONEX_04092 adhE -73 5 TTGACAAATATTTAACGA
CLONEX_04091 stpK -102 4.8 TTGTTAAAAAATACTCAA
CLONEX_01601 bdh -71 4.6 GCGTTAAATAATTAACAG
CLONEX_01601 bdh -43 4.5 CTGTTAAAAGGTTAACAA
CLONEX_00392 aroE -63 5.5 TTGTTTAAAATTTAACAA
Clostridium scindens ATCC 35704
CLOSCI_02188 adhE -54 5.5 TTGTTAAAAAAATATCAA
CLOSCI_02188 adhE -29 5.3 TTGACAAATAATTAACAA
CLOSCI_02187 stpK -107 5.6 ATGTTAAATATATAACAA
CLOSCI_02187 stpK -69 5 AAGTTAAAAAAATATCAA
Dorea formicigenerans ATCC 27755
DORFOR_01318 adhE -150 5.1 ATGATAAAAAATAAACAA
DORFOR_01318 adhE -130 5.2 ATGTTAAAAAAATATCAT
DORFOR_01318 adhE -105 4.9 TTGACAAATAATTAACGA
DORFOR_01431 gap -89 4.7 TTGATGAATCTTTAACAA
DORFOR_01493 bdh -76 4.9 GCGTTAAATTATTATCAA
DORFOR_01493 bdh -43 4.5 GTGATAAAAATTTAACGC
DORFOR_00826 ladH -57 5.1 TTGTTAAAATAAAAACAT
DORFOR_01796 pckA -118 4.8 TTGTTAAAAATTTATTGA
DORFOR_01112 fba -125 5 TTGTTAAAAATATGACGA
DORFOR_02389 ppsA -148 5.2 TTGACAAAAATATAACAA
DORFOR_01508 pflB -160 5 TTGTCAATAGTTTAACAA
DORFOR_02415 por -133 4.8 TCGTTAATTTTGTATCAA
Dorea longicatena DSM 13814
DORLON_02221 adhE -117 5.3 ATGTTAAAAAAATATCAA
DORLON_02221 adhE -97 4.9 ATGTGAAAAAAATATCAA
DORLON_02221 adhE -72 4.8 TTGACAAAGAATTAACAA
DORLON_02222 stpK -144 5.5 ATGTTAAAAAAATAACAA
DORLON_02222 stpK -106 4.7 TAGTGAAAAAAATATCAA
DORLON_00585 bdh -110 4.5 ATATTAAAAAAATCACAA
DORLON_00585 bdh -44 4.5 GTGTTAAAAGATTAACAC
DORLON_02552 ladH -231 5 AAGTTATTTATATAACAA
DORLON_02552 ladH -102 4.7 TTGTTAAAATAAAGACAT
DORLON_00700 aroE -53 4.8 TTGTTAAAATATAAGCAA
Eubacterium eligens ATCC 27750
EUBELI_02054 adhE -54 5.6 TTGTTAAATTATTATCAA
EUBELI_02006 bdh -28 5.4 TTGTTTATAATTTAACAA
EUBELI_01190 gap -57 5 TAGTTGAAATTTTAACAA
EUBELI_01188 tpi -144 5.3 TTGTTATTTATTTCACAA
EUBELI_20348 ladH -170 5 TTGTTATAAGTATAACAT
EUBELI_20348 ladH -78 5 TTGTTATTATTTTGTCAT
EUBELI_01169 pckA -110 5 TCGAGAAAAATTTAACAA
EUBELI_01258 ppsA -71 5.6 ATGTTATAATTTTAACAA
EUBELI_01405 phf1 -40 4.8 TCGATAATTTTTTGTCAA
EUBELI_01680 pfkA -93 5.1 TTGGTAAAAAATTATCAA
EUBELI_01381 rex -114 4.8 TGGTTAAAATTTTGACAT
Eubacterium rectale ATCC 33656
EUBREC_1522 gap -78 5.2 TAGTGAAAATTTTAACAA
EUBREC_2002 pckA -82 5.1 TTGATTTTTTTTTAACAA
EUBREC_0700 fba -78 5 GTGTTAAAAATTTAACTT
EUBREC_2390 phf1 -219 5.3 TTGTGAAAAAAATAACAA
EUBREC_2843 aroE -98 5 TTGTTAAGTTTTTAACGA
EUBREC_0733 null -111 5.3 TTGACAAATTATTAACAA
EUBREC_0733 null -54 5.4 TTGTTAAAAAATTAACAG
EUBREC_1058 pfkA -18 5.3 ATGATAATTTTTTAACAT
EUBREC_3075 cat2 -60 5.2 TTGTTATTTTTTTAACGT
EUBREC_1017 crt -91 4.8 TTGACAAAAATTTGTCAA
EUBREC_1967 rex -225 4.8 ATGTTAAATTCTTAACAC
Roseburia intestinalis L1-82
ROSINTL182_01942 gap -142 5.2 TAGTGAAAAATTTAACAA
ROSINTL182_03172 bdh -125 5.6 TTGTTATTTAATTAACAA
ROSINTL182_03866 pckA -90 5 TTGACAAAAAAATAACAT
ROSINTL182_02682 fba -86 5.2 TTGTTATAAATTTAACTT
ROSINTL182_01690 aroE -90 5.4 TTGTTAAGTTTTTAACAA
ROSINTL182_02619 null -82 5.4 TTGTTAAAAAATTAACAG
ROSINTL182_02872 cat2 -30 5.2 ATGGTAAATTTTTAACAA
ROSINTL182_00883 crt -41 5.6 TTGTTAATTTTTTATCAA
ROSINTL182_04859 rex -69 4.7 TAGTTAAAAATTTCACAC
Ruminococcus gnavus ATCC 29149
RUMGNA_02651 adhE -116 4.6 ATGTTAAAAAGATAACGT
RUMGNA_02651 adhE -102 4.9 ACGTTAAATATTTGTCAA
RUMGNA_02651 adhE -76 5.3 TTGACAATTATTTAACAA
RUMGNA_02650 stpK -181 4.8 AAGTTAAGAAATTAACAA
RUMGNA_01756 gap -97 4.7 TTGATGAATCTTTAACAA
RUMGNA_02449 ladH -33 4.8 TTGTTAAAATCAAAACAA
RUMGNA_03804 nadA -43 5.2 ACGATAAAAATTTAACAA
Ruminococcus lactaris ATCC 29176
RUMLAC_02580 adhE -63 5.4 GTGTTAAATTATTAACAA
RUMLAC_02580 adhE -37 4.9 TTGACAATTTATTAACGA
RUMLAC_02581 stpK -157 5.5 ATGTTAAAAAAATAACAA
RUMLAC_01918 gap -96 4.6 TTGATGAATTCTTAACAA
RUMLAC_00614 ladH -67 4.7 TTGTTAAAATAAAGACAT
RUMLAC_00224 aroE -111 4.8 TTGTTTGATAATTAACAA
RUMLAC_02728 pfkA -61 4.9 TTGATAAAAAATAGACAA
RUMLAC_01487 por -179 5.1 TTGTGAAAAAATTATCAT
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