Collection of Manually Curated Inferences of Regulons in Prokaryotic Genomes
-- version 3.2 --

Profile of regulator glmS in Clostridiaceae

Properties
Regulator family: RF00234
Regulation mode:
Biological process: Amino sugar metabolism
Effector: Glucosamine-6-phosphate
Regulog: glmS - Clostridiaceae
Member of regulog collections
Transcription factor binding sites
Locus Tag Name Position Score Sequence
Clostridium kluyveri DSM 555
CKL_0317 glmS -372 105.4 AAGCATAAAAAGCGCCAGAACTCAGGTGATTTTTTAAAATAAAATACATATAATTATTTTAAATGTATAAATTACTTTGAGTTGACGAGGATGGGGAGTATCGAATCTTCGGCGGGTGCCCCACGGTATCGCACTACCGTTAACAGCTGGTAAAACCAAAAAGTGATTTTTGGTACAATATCAGCCTGGTGTTAAAACC
Clostridium sp. SS2/1
CLOSS21_00892 glmS -291 80.2 ACAGAATTTAAGCGCCATGCACCTTCCTGATACGGAAACAGACCGATGAGGGTCTGATAGGAAGGTTAACGAGGAGGAAAGTGATCGAAAGATTCGGCGGATGCTTTCCCGCAGCTCCAGACTACGTGATATACTGAGTAAACCCATGAGTGATCATGAAACAGAGGCAGTATAATCTGGACAAAA
Clostridium cellulolyticum H10
Ccel_1205 glmS -432 82.8 GAATTAAAAAGGCGCCAGGACAGATTTTTATAAGTCTGTTGACGAGGAGAAGGAAGCGATGCACTAATTAACGTGTGTCGTATCGAAAGATTCGGCGGATACCTTCCGGCTGTTACGGTCGAGAGAGACAAAACAAAACTTGCAGGCGACTGCAAGAACAAAATGGTCTCATGTAGCTAATC
Clostridium phytofermentans ISDg
null glmS -209 67 AGATAAAATTAGCGCCATGTACCTCTATTGGACGGGAAATTTAGAGGTTAACGAGGTAGGGAGTTAGCGAATCTTCGGCGGATGCTCTCTCGTACAGTTTGAGTGCGTAAGGTGCTGAAAAAATGGCAGGTAACTGCAGCACAACAGCAGTACTATCAAACAACA
Clostridium tetani E88
CTC02543 glmS -296 95.7 AAAATATAATAAAGCGCCAGGACTTAGGTGATGAAACTCAGACTATGGTCTGAGTAAGTTCGACTAACCAAATCACAGATTTGGAGTAAGATTAATGAAACTCAGACTATGGTCTGAGTAAGTTCCACCAACCAAATCACAGATTTGGGGTGTCACTTAAGTTGACGAGGATGGGGAGTATCGAATCTTCGGCGGGTGCCCCACGGTACTGCACTACCGTTAAAGATTGACAAAACCAAGGAGTAATTTTTGGTACAAATCAATCAGGTGTTAAAA
Clostridium acetobutylicum ATCC 824
CAC0158 glmS -249 123.8 TTATAGTTAAAGCGCCCGAACTTGAGTGATATAGTTCATTTAAGTTGACGAGGATGGGGAGAATCGAATCTTCGGCGGATGCCCCACGGTACCGCACTACCGTTAGCGGTTGGTAAAAGCAGAAAGTGATTTCTGTCACAAAGCCAATCTGGTGTTAAAACC
Clostridium botulinum A str. ATCC 3502
CBO3410 glmS -224 58.5 GAAACTCAGATTAGCATCTGAGTAAGTTCCACTAACCAAATTGAAAATTTGGAGTGTCACTTAAGTTGACGAGGATATAGGAGTATCGAAATTTCGGCGGATATCCTATGGGATCTCACAGCCCTAAAAGCTATAATAAAAGTTAGAAGTGATTCTGATTACAAAAAAGCTTTAGTGAGGAC
Clostridium novyi NT
NT01CX_1166 glmS -221 81.5 TTTGAGTAAGTTCGCCTTAACCAAATCGTAGATTTGGAGGCTCACTTAAGTTGACGAGGATGGGGAGTATCGAGAATTCGGCGGATGTCCCACGGTATTTATGTACTACCGATAACAGTTAGCAAATCTAAAAAGCGATTTTTAGCACAAATCTAACTAGGTACATGATGG
Clostridium perfringens ATCC 13124
CPF_2636 glmS -302 97.9 ATAATAGATTAAAGCGCCAGAACTTAAAGTTTTATTGATAGACTAATAAGTAATTTAACTTTAGTAGATTAAAATGCTTATTAAGATTCTTAATAAATTTAAGTTGACGAGGTTGGGGAGTATCGAATTTTCGGCGGATGCCCCACGGTAAAGCACTACCGTAAAAGATTGGTTAAAGCTTAAAAGTGATTTTAAGGACAAAGCCAATTGGGTGTTTCAA
Clostridium difficile 630
CD0120 glmS -232 97.4 CACCTTTCTAAGCGCCAGAACTTAGTTATAGACATAATTATTGAGTAATATAGGAACTAAGTTGACGAGGTCAGAGTTAATCGAATTGTCGGCGGATGCTCTGCGGTGTGTTTACCATCGAAAGACTTCTTTAAATAATAGGAGCAATCCTATGGACAAAGGGAAGCCAAAGTAAACTTAT
Clostridium beijerincki NCIMB 8052
Cbei_0246 glmS -277 85.5 GTAAATTCAACTATCCAAATCGAAGATTTGGAGTTTCATTTACGTCGACGAGGTTGGGGAGTATCGAAACTTCGGCGGGTGCCCCACGGTATCGCACTACCGTAAACGACTGGTAAAACTGTGAAGTGATTCACAGGACAAATTCAGTCTGGTGTTAAAACC
Clostridium sp. OhILAs
Clos_2836 glmS -319 107.3 AATTTAATGAAAAGCGCCAGAACTTAGATTTCGATCGGGAAAAGGATCTAAGTTGACGAGGGACAGGGTTCATCGAGTTTTCGGCGGATGCCCTGCGGTGTATTCACCACCGATAGCGGATCTACAAAACCATGGAGCAATCTGTGGAACAAAATGATCTTGGTGAAAAGGT
Clostridium sp. L2-50
CLOL250_01278 glmS -311 44.6 TTTAGAAATCTTAGCGCCATGTCCCTTTTATCCTGGCATTGAAGGACTGACAGATGCGGTGTAAACGTGGTTGGTCGGTACAGCCTGTTGAGAAGGGTAACGAGGATGGAGGTTATCGAAAATTCGGCGGATGCCTCTACGTAGAGTCCGGATGCGCACATGTATGTCAAATATGGGAGAAATCTCAAAACAAAACAGCATGACCGGATAAT
Clostridium hiranonis DSM 13275
CLOHIR_00014 glmS -218 97.3 TTCTGTTTTTAGCGCCAGAACTTGTAAATTTAATATAAATTCAAGTTGACGAGGTCAGAGTTAATCGAATATTCGGCGGGTGCTCTGCGGTGTATTTACCATCGTAAAATTTCTTCAAAACTTAGAAGTGATTCTTTGAACAAAGGGAAATTTGAGTAAATAATT
Clostridium butyricum 5521
CBY_2954 glmS -431 96.9 AAATTTTTAAAGCGCCAGAACTTAAGTAAATTACTTTAGTTGATTGAATGTGGATGTTTAGAGTTTTTTTAAAAGGAAACTCGACTCACATACGTTCGCTGAGTAAGTTCCACTAACCAAATCATAGATTTGGATGCTCACTTAAGTTGACGAGGTTGGGGAGTTATCGAAACTTCGGCGGGTGCCCCACGGTATAGCACTACCGTTAACAGCTGGCAAAACTTTAAAGTGATTTAAAGTACAAATCCAGTTTGGTGTTAAAGCC
Clostridium bolteae ATCC BAA-613
CLOBOL_03730 glmS -328 53.3 ATAGCAAAGCTAAGCGCCATGCACCTTTTAGCGGGTACGTGAACAGCAGGAACGTCTGCTGCCGTTTATAAGGTTAACGAGGTGGAGAGAGAATCGAGAAATTCGGCGGGTGCTCTCCCATGCTGTCCGGGCGTGTTGCATACTGGAAAATATGCGGGTAACTGCAAAACAAAGCCAGTGTGACCGGATGTA
Clostridium bartlettii DSM 16795
CLOBAR_00755 glmS -205 90.9 TAGTGTTTATAAAGCGCCAGAACTTAATTTTTTAAGTTGACGAGGTCAGAGTTAATCGAAATATCGGCGGATGCTCTGCGGTGTGCCACCATCGAAGGATTTCTACAAAGGGTGAAAGCAATTTCACTACACAAAAAGAAACCCATGTGGATTG
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