Collection of Manually Curated Inferences of Regulons in Prokaryotic Genomes
-- version 3.2 --

Profile of regulator T-box(Arg) in Clostridiaceae

Properties
Regulator family: RF00230
Regulation mode:
Biological process: Amino acid metabolism
Effector: Arg-tRNA
Regulog: T-box(Arg) - Clostridiaceae
Member of regulog collections
Transcription factor binding sites
Locus Tag Name Position Score Sequence
Clostridium tetani E88
CTC00966 argS -261 113.7 AAAATTCTAGGAAGAGGAAAGTAACTTTTTCTTTCTTTTTAAGCGAGCAGGGTATGGTGGGAGCCTGTAAAAGAGGAATAAGTAAAATAGAGCCTTAGAGAAGTTTATCTGAACTAATAGTAGGATAAACCGCTAAAAAGCGTTAAATTTTTAAGAGGACTTATGTCAATTAGAGTGGTACCGCGGATAAAACCGTCTCTTTATA
Clostridium acetobutylicum ATCC 824
CAC1041 argS -242 88.9 AAAAATCTATGAAGTGGAAAGTAGCATGTCGATTTTTTAAGCGAGCTGATATTTTGGTGAAAGTTCAGTATTAAGACATATGTGAAATAGAGCCATGGAGATGAATTATCCGCTTAACGCGTTAAAATTTTTAAGGTGGACTTTTATTAATAAGGTCAATCAGAGTGGTACCGCGAAATATAATCGTCTCTGCAGT
Clostridium botulinum A str. ATCC 3502
CBO1072 argS -236 28.1 GTATTATTATTTAGTCAACTAGAGTGGTACCGCGGATAATCCGTCTCTGT
Clostridium novyi NT
NT01CX_1587 argS -295 87 AAAATTCGATGATAAGGAGAGTATCTTTTTAAAATATAAAAGCGAGTAGAAGATGGTGTAAGTTCTACAATATTTTATTTAGAGAAAAGAACCTTTGAGAAGCTACTAAGTTATATTAAATTTTATGATGAGGTAAGCCGTTAACTGCGATAAAGTTATGAGGTGGACTAATTTTTAGTCAACTAGAGTGGTACCGCGGATATAACCGTCTCTATATA
Clostridium perfringens ATCC 13124
CPF_1915 argS -309 97.7 TAAAAAGTCTGTGAAGAGAAGAGTAGTCTTTATGATTTCTTAAGCGAGTAAGGGATGGTGTAAGCCTTATAGAATAGTTTAGATGAAGAGAGCCTCTGAGATTGCATTTTAATAACTAGTATTTTTATTAAAGTGTCGCTTATGCGTTAAATTATAAAGTGGGTTTTTAACCAATTAGAGTGGTACCGCGGATATATCCGTCTCTTTG
Clostridium difficile 630
CD1785 argG -459 121.2 TAAATCCTGTGAGAAAGAGAGTAACTTCTATGTGTTTTATAGAGAGCTGAGGATGGTGGAAGCTTGGCAAATAAGTATTAGTGAAAAGAACTTTGGAGGATACTAATTGAATTTAGTATGTTAGTAGGTAATCTCGCCTTAAGAGAAAGAGTGGATAAGTTTATCTTATCAATTAGAGTGGTAACGCGGATATATTTCGTCTCTTGGTT
CD2500 argH -290 121.3 TTTAGATTCAGTGAAAAAGAGAGTAGATATAGAGAAAATCTCAGCGAATTGGGGGATGGTGTGAGCCTAATGATAACACTTTATATTGAAAAGAACTTTGGAGAATACTACTTGAAATTCAGTATGGTAGTAGGTAATCTCGCCTTAAGAGAATAGAGTGGGTAAACATTGTTTACCAACTAGAGTGGTAACACGGAATATTTCGTCTCTTGG
CD2034 argC -167 23.4 CAATAAGAGTGGTACCGCGGAAAATCGCCTCT
CD2034 argC -468 112.5 TTGAAATCCTGTGAAAAAGAGAGTAGCATAAAGCTAGTTGATAGAGAGCTGGGAATGGTGGAAGCCTAGTAACGAATTTTATTGTGAATAGAGCTTTGGAGGAGATTACCAGAAGTAATAGTATGGTAATTGGTGAATCTCGCCTTAAGAGATTAGAGTGGGTAAGATTATCTTATCAATTAGAGTGGTAACGCGGGTGTATATTCGTCTCTTGG
CD0750 artP -435 138.8 CAAATCCAATGATAGAGAAAGTAGCATATATGGATTTACAGCGAGTTAGGGGTTGGTGTAAGCCTAGCAATGAAGTCTATGTGAAGAGAGCTCTGGAGGAGATTATCAGAAACTTTAGTATGATAATTGGTTTACCCGCCTTAAGGGATTGAGAGGATAAGTACTTACTTATCAAAAAGAGTGGTAACGCGGATATAATTCGTCTCTTAGCT
Clostridium beijerincki NCIMB 8052
Cbei_1019 argS -459 50.4 AAAATTCTAAGAAGAGGAAAGTAATTTAATTAATTCCTTTAGCGAATAGGGAGATGGTGTAAGCCCTATGGATAGATTAAGTGAAAAGAGCCTTGGAGAAATCACCTGAAATAAGT
Cbei_1019 argS -338 43.8 AAAAGATAATAATCTAATATAGCTGGTATGATATATTAATTATTATTTTTAAACCTTTAGTAGGGCTGGTCGCAAGTTAAATTGCGTTAAAAGTTGAGAGGTATTTTATTTATATAAAATACAATAAGAGTGGTACCGCGGATAATTCGTCTCTTTTTA
Clostridium sp. OhILAs
Clos_2740 argS -265 109.6 AAAATTCGATGATGAGAAGAGTATCAATTTATATTTCTAACAGCGAGCAGAAGGTTGGTGAAAGTTCTGCAAGAAAGAGAATTGGGAAAAGGGCCTCTGAGAAGCTACCTGAGCATTTGCAAGGGTGTGTCGTTAACTGCGTTAAAGTTCTGAGTGGACTATTTTAGTCAAATTGAGTGGTACCGCGGATTATACCCGTCTCTATTTT
Clostridium hiranonis DSM 13275
CLOHIR_01256 argG -416 105.3 AGTAATCGTTGAAAAAGAAAGTAGCTCAGAATGATTTTATAGAGAGCAGGGGATGGTGGAAGCCTTGCATTGATATCTGAAGTGAAGAGAGCTTTGGAGATTGTTGTGAAAGTCTTAAAGATATAAGCAACAGGTAATCCTGCCTTAAAGGAAAGAGTGGATAGTATTAACTATCAATTAGAGTGGTAACGCGGATTATATTTCGTCTCTTGGTT
CLOHIR_01842 artP -477 120.7 TAAATCCAGTGACAAAGAGAGTAGCCTATAATGGATTTCCAGCGAGTCGGAGTTTGGTGTGAGTCCGATAATGAAGTATAGAGTGAAGAGAACTTTTGAGGAGAATTCCAGAAATAATAGTATGGAATTAGGTCGCCCGCCTTAAGGGTTTGAGAGGGTAGGTAGAAATACTTATCAATAAGAGTGGTAACGCGGTTAATTCGTCTCTTAGTC
Clostridium butyricum 5521
CBY_2749 argS -386 98.2 GAAAGATTTGATGATGAGGATAGTACTTTAGTTGAGTCCATAAGCGAGCTGGGAAATGGTGTAAGCCTGGTAGGATAGATTAATAGGAAGAGAACCTTGGAGAAGTCTCCTGAAATGAGTAGGGATGACCGCAGGTGAAAAAATGATCTGCGTTAAAGTTAAAGTGGCATATTTTAATTTAGAATATGCAATTAGAGTGGTACCGCGAATAATTCGTCTCTTGT
Clostridium bartlettii DSM 16795
CLOBAR_01699 argG -426 112.8 CAAATTCATTGAAAAAGAAAGTAATTTATTTTAAGTTTATAGAGAGCTGAGGATGGTGGAAGCTTGGCAATTTTAAAATATATGAAGAGAGCTTTGGAGAAGATTATCTGAACTTAAGTAGGATAATAGGAATACCTTGCCTTAAAAGGAAGAGTGAATAAGTTTATCTTATTAATTAGAGTGGTAACGCGGAAATATTTCGTCTCTTGATA
CLOBAR_01401 argC -105 28 TAGTATAAGAAATTTTATCAATAAGAGTGGTACCGCGGAATTTCGCCTCT
CLOBAR_01401 argC -361 118.1 GATAAATTCGATGACAAAGACAGTAACATAAGTCTAATTTATAGAGAGCTTAGGATGGTGGAAGCTGAGCAATGAAGCTTATTGTGAAGAGAACTTTTGAGAATGTTTCTTGAATTGAGTATGGAAACAGGTAATCTTGCCTTAAAAGAGTAAAGTGGATAAGTTTCTTATCAATAAGAGTGGTAACGCGGTATATTCGTCTCTTGG
CLOBAR_01955 argF -292 116.6 TTTAAATTCATTGATAAAGAGGAGTAGCATGGATTTTATTTATAGAGAGTTGGGGTTGGTGGAAGCCTAATAATTACATCCATTGTGAAAAGAGTTTTTGAGAAGGCTATCTGAATTTTAGTACGATAGTCGGTAAACCTGCCTTAAAGGTCAGAGTGGATAAGGTATCTTATCAATTAGAGTGGTAACGCGCAATGTCGTCTCTTAG
CLOBAR_01250 artP -151 106.1 GTATAATTCAATGAAAAAGAAAGTAACATAAATATAAGTTACAGCGAGCTGAGTATGGTGCGAGTCAGCAACGGAGTTTATTGTGAAAAGAGCTTTGGAGAAGACTATCTGAATATAGTAGGATAGTAGGTAGCCTGCCTTAAAGGTTTGAGTGGATAATTATTATTTTATAATTATCAAGAAGAGTGGTAACGCGGTAATTCGTCTCTTAG
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