Collection of Manually Curated Inferences of Regulons in Prokaryotic Genomes
-- version 3.2 --

Profile of regulator PyrR in Clostridiaceae

Properties
Regulator family: RF00515
Regulation mode:
Biological process: Pyrimidine metabolism
Effector: PyrR
Regulog: PyrR - Clostridiaceae
Member of regulog collections
Transcription factor binding sites
Locus Tag Name Position Score Sequence
Clostridium kluyveri DSM 555
CKL_3361 pyrB -151 45.5 CTGAACCTTTAAGACTAGTTCCGTGAAGCTAGGAAGGCATGGTAAAAATTATGATGTTATTATATTTATGGTATAATAATGCCTTCCAAACAGGGAGGCATTTTTTTAA
CKL_1201 pyrR -119 42.7 AATATCCTTTAAAATGATCCCGTGAGGTCACTAAGGCAATTAAAATAGATACTTCTATGCCCTCTCGTTTGGAGAAGGGCTTTTTTATT
CKL_0649 carA -216 31.5 TACACTTTAAATTGGTCCTGTGAGGCCAGAAAGGGGTATATATCTATATGTATGGGTATAGTTGTTTGTTA
Clostridium cellulolyticum H10
Ccel_0485 pyrP -202 59.6 AAACTTTTAAATTAGTCCAGAGAGGCTAGTAAGGGTATATATGGGATAAGTGTATTTTTATGGATAGAGACCCTACCTTACTGCGCCTTGTCAGTAAGGTTTTTTTATTTG
Ccel_0611 pyrR -200 45.5 TTACCTTTAAATTAGTCCAGAGAGGCTATAAGGTCAGATTTTAAAATATACTGCATTTATGTATAATCATCATAGTATGGTTGTATTTGTATATGTTAAGCTTCTTGCCTTATGGCAGGAAGCTTTTTTAGCTG
Clostridium tetani E88
CTC01613 pyrR -91 41.3 TAAATCCTTTAAAGTGATCCAGAGAGGTCAGAAGGCGTTTTAAAAGAGAACTAATGTAATTATTTGTAGATAAAAGCGTCTTCACACATAGTTGAGATGCTTTTTTTAT
CTC02384 pyrB -146 54.5 TAAAGCCTTTAAAAAAGTCCAGAGAGACTTTAAAGGAAGTGTTATAGGAATACTGTACATTAGGACTTCTATGCCTTCCTTTAGGGAAGGCATTTTTTAA
CTC01612 pyrP -21 30.2 ATATACTTTTAAATTAGTCCGGTGAGACTAAAAAAGGAGGAATTATT
Clostridium acetobutylicum ATCC 824
CAC2112 pyrP -47 35.9 GAGGTACTTTTAATATAGTCCAGAGAGGCTAAAAAGGAGGAATTATT
CAC2645 carA -422 46.9 ATATACCTTTAATGATTGGTCCAGAGAGGCTAAGAAGGATTAAAAGTTTTGTTTTATGGAGAGTATTATAGTCTTTTGCGTCTGGCAAAAGACTTTTTATTTT
CAC2654 pyrB -150 50.4 ATAAACCTTTAATTAAGGTCCTGTGAGGCCTGGAAGGTGCTGATAAGCTAGTAATAGGTGTATTATACCTTCCTTTAATTGAGGAAGGTTTTTATTTT
Clostridium botulinum A str. ATCC 3502
CBO1479 pyrP -44 27.3 GCATCTTTTAAAATAGTCCAGAGAGACTAAAAGGGGGAAATAATAT
CBO1478 pyrR -237 42.1 TTACCTTTAAAATGATCCTGTGAGGTCATAAGGCTATAAATAAATCTACACGGAATTATTATGCCTTTACTCACAGAGTAAAGGCATTTTTTATCT
CBO3241 pyrB -195 37 TAAGACCTTTAAAATTAGTCCTGTGAGACTAAAAAGGAAGAGAAAAGCATATTTTAT
CBO2073 codB -197 37.8 TAGTACCTTTAAAATTAGTCCAGAGAGACTAATAAGGTCGTATAGATTTAT
CBO2821 pyrR -119 29.8 AAAGCCCTTTAAATGATCCTGAGAGATTGTAAGGCAGATATCTAATAAGTCTATACAAATGTCTTGGCGAAGGGTCGAGACATTTTTTGTTG
Clostridium novyi NT
NT01CX_0192 pyrP -215 55.4 GATAATCTTTAATACGGTCCAGAGAGGCTGACAAGATTGATAGTTTAGCTATGTTTGTATTTATATTTAAGATAACTCAAACTTCTTGTCAGTAGGCAAGAGGTTTTTTTATT
NT01CX_0192 pyrP -86 43.8 GATAACTTTTTAAATCAGTCCAGTGAGGCTGAAAAAAGGAGAAGATGAATTTCTCCTTAGAATAAAAAATATAAGGAGGTTTTTTTA
NT01CX_0395 pyrB -180 33.2 GCGTGCCTTTAATTCAGTACGAGATACTGGAAAGGGTAGACAAAGGGTTTTTGTCTTTATAAGTATATAGAGCGTATTTTATTATATATTAGTATACTCATGCCTTTCCAAAATCTTGGAAAGGCATTTTTTAT
NT01CX_0383 carA -245 50.9 ATTAACCTTTAATTTAGTCCAGAGAGATTAGAAAGGTGGTACTTAGAGTGTGGATATTTACTATGCTATAAGTATGACGTTTATAATGATGGTAAATTTAAAAACCTTCTGCTCTGTGGCAGAAGGTTTTTTTATT
NT01CX_0383 carA -365 35.6 AAAGTCCTTTAAGGTAGTCCGAGAGACTAATAAGGTGCTTATATTTATAATTTTAATATAGTTATGATATGGTATCCTTCTGTCTTAAAGCAGAAGTTTTTTTATA
Clostridium perfringens ATCC 13124
CPF_1756 pyrP -47 26.1 AAACTTTTAATTTAGACCTGAGAGTCTAGAAAAGGG
CPF_2898 carA -283 29.2 AATACACTTTAAATTGGTCCCGTGAGGCCAGAAAGAGGTATAATTATGTTAAATAGAATTTTTTGT
CPF_1422 pyrP -207 30.6 ACTATTCTTTAAAGATAGTCCAGAGAGGCTACAAGAATTAATTATT
CPF_1422 pyrP -84 38.1 TTTACCTTTTTAAATCAGTCCCGTGAGGCTGAAAAAAGGAGAAGCAGAGCTTTCTCCTTAAGAAAAAATAAGGAGGCTTAAATTAT
CPF_1387 pyrB -180 46.9 AATAACCTTTAAATTTGATCCAGAGAGGTCAATAAGGAAGTTATATAGTTGAATTATAATCGTAAAAGATTTATTTATACGTGAAAAGTCTTCCTTATCTTAGGAAGACTTTTTTTAAT
Clostridium difficile 630
CD3592 pyrF -146 52 AAAGTCTTTTAAACTAGTCCAGAGAGACTGGGAAAGATATCTCATAGCTAATGAATAGAGTTATGTATAGATAAAATCCTTATGCCTCTTTTGGTGTGAGGATTTTTTTAT
CD3592 pyrF -261 32.6 AAATTCCTTAAAGTAGTCCAGAGAGACTAAAGGGTTATAGATAATGTTAGTATATAACCTCTAGTAAATCTTCTAGAGGTTTTTGATG
CD0184 pyrB -46 27.8 ATACTTTTAATTTTAGTTCAGAGAGGCTAAAAAAGGAGGACGAAAGATGTTAAAATCAAGAAATTTAATCCAACCAGAAGACTTTTCAAT
Clostridium beijerincki NCIMB 8052
Cbei_1000 pyrB -165 37.4 TAACCTTTAATTTGATTCAGAGAGATCAATAAGGAAGTTATATAATACCAATGATCTAGGATTATTATGCCTTCCTTTATTTTAAGGAAGGTTTTTTATTA
Cbei_1715 pyrP -38 29.4 TTTTAATTTAGTTCAGAGAAGCTAAGAAGGG
Cbei_0028 carA -232 33.9 TACACTTTAACTTGGTCCTGTGAGGCCAAAAAGGGAAGCATAACTATGATATTTGAAAGCTGAATGAAAAATTTCATAGCTTATTTTTTGA
Clostridium sp. OhILAs
Clos_2188 pyrB -94 44.7 TTACCTTTAAATTAGTCCAGAGAGGCTAAAAAGGGAGTGTGTGGATACTCCCATCAATTATTAA
Clos_1951 pyrP -96 41.3 TAATACCTTTAAATCGATCCTGTGAGATCGAAAAGGAGAAAGTATAGGAACTTCTCCTTGGTATGCAAGCATGCAAATTTAAAAGGAGGTTTTTTTAT
Clos_2194 pyrC -494 33.5 GTCGACCTTTAAGAATGGTCCTGTGAGGCTGGGAAGGGAGTAATTTAGATGGAGTTCATCACTGCGTGTTTTTTTCATGTCTTTTTTACAATCAAAGAAAATCATATTATA
Clos_1951 pyrP -241 54.8 ATAAATCTTTAATGCAGTCCCGTGAGGCTGGTAAGATGATAATAAATTACTGAATTGTAATTGATTGTAATTATTATAACTTCTTGCGGCCCACGTAAGAAGTTTTTTTAAT
Clostridium hiranonis DSM 13275
CLOHIR_02208 pyrF -106 47.3 AGTCTTTTAAGCTAGTCCAGAGAGACTGGGAAAGATATCTCATAGCGTTTTTTTGTTATGGAAAGATAAAATCCTTATGCCTCTTTTTGTGGTGTAAGGATTTTTTGTGTA
CLOHIR_00048 pyrB -47 25.2 ATAGCTTTAAATTCGGTTCAGTGAGGCCGAGAAGGAGGAATTAAAAAATGTTAAAATCAAGAAATCTAATACAGCCAGAAGACTTTACTGTTGAAGAAATAGATGAGGTTCTATCTCTTG
Clostridium butyricum 5521
CBY_2289 carA -225 29 GATGCACTTTAACTTGGTCCTGTGAGGCCAAAAAGGTAGTATAACTATGATATTTAAATATTCAACGGTGAATTTCATAGCTTATTTTT
CBY_1339 codB -231 29.8 AGTCCTTTAAGTTATGTCCTGTGAGACAAACAAGGTCGTATAACACATAGATGAAACACATTGATATTGTGGAGTATCAAAGATTATATAGATATTAAGGGACTGTTATACTAATTATTAATTAGTAGCAGTTCCTTTATTT
CBY_2768 pyrB -158 37 AATAACCTTTAATTTGATTCAGAGAGATCAATAAGGAAGTTATATAACAATGTAGATGCATTAGGATTATTATGCCTTCCTTTAAATTAGGAAAGGCTTTTTTTAT
CBY_3673 pyrP -79 27.1 AGACATATTTTAATTCTAGTCCAGAGAGGCTAAAAAGGGAGAATATAAAGTTCTTCTTTTAAATTTGAGGAGGTATTGTATGTCA
Clostridium bartlettii DSM 16795
CLOBAR_01469 pyrR -156 24.3 ATATACCTTTAATTGATACAGAGAGATCATAAGGCATAGATGTACTTTTGATGTGTAAAAAAGTATAACTTCCTGTCTTGTGCAGGAAGTTTTTTTGTTG
CLOBAR_00677 pyrB -47 33 AATAACTTTTAATTTTAGTCCGGTGAGGCTAAAAAAGGAGGATAAATATGTTAAAATCAAGAAATTTGGTCCAACCAGAAGACTTTTCA
CLOBAR_00209 pyrF -141 54.6 AAGTCTTTTAAAATAGTCCAGAGAGGCTGATAAAGATACTTCATAGTTAACAGTTAGTTATTTATGTATACAAAGTCCTTATACCTCTATGGTGTAAGGGCTTTTTTTAAA
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