Profile of regulator T-box(Trp) in Staphylococcaceae

Properties
Regulator family:	RF00230
Regulation mode:
Biological process:	Amino acid metabolism
Effector:	Trp-tRNA
Regulog:	T-box(Trp) - Staphylococcaceae

Member of regulog collections

By taxonomy - Staphylococcaceae
By RNA motif - T-box
By effector - Trp-tRNA
By pathway - Amino acid metabolism

Transcription factor binding sites

	Locus Tag	Name	Position	Score	Sequence
Staphylococcus aureus subsp. aureus N315
	SA1199	trpE	-432	70.6	AGAATTTTCTAAAGAAATAGTAGCAGATATGAAACGTAGCAAATAGAAAGCTAATGGGTGATGGGAATTAGCACGCCATATCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGG
	SA1199	trpE	-228	66.6	TTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAACTAACACCGAGATTAATGAAATTGGGTTTTGTCTGCAACAGAAAAATTATATATAGTAAAGAGTGAACTATGAATATTTTGAATATTCGGTTAATTTAGGTGGTACCACGCGTCAGCGTCCTTTATAT
Staphylococcus capitis SK14
	STACA0001_1613	trpE	-419	63.5	TAATTTGAATGAATAAGTAGTTACTGCATGTTGTAGCACTAAGAAAGCTAATGGTTGATGTAAATTAGCACAATGCAATAAACGAATTGGGCTTTCAAATTACAATTAAATAATTTAAAAGTGAACAAATAAAATTGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTATTGC
	STACA0001_1613	trpE	-220	62.6	TTTAAGCAAAATGTAGTATTTAAAGAATAGGTAGTAACAGAAAGTTAGTGGTTGATGTAAACTAACACCTACTTTGAAGAAATTGGGTTTTGTGAAATAAAAAAATAAATACAAAGAGTGAGTTTTGAATATTACGAATATTCGGCTAATTAAGGTGGTACCACGCGTCAGCGTCCTTTTTCA
Staphylococcus epidermidis ATCC 12228
	SE1048	trpE	-412	62.2	TAATTTGATTGATAGAGTAATCATTATATTTTGTAGCAAGCAGAAAGCTAATGGTAGATGTAAATTAGCACATGATAATAGATGAAATGGGCTTTCAAATTTTAACTTAATCATTAAAGTGAACATATATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTATAGA
	SE1048	trpE	-220	66.1	TTGAAGCAAAGTGAAGTAACTAAAGTTGAGGTAGCACCAGAAAGTTAGTGGTAGATGAGAACTAACACCGTCTTTAGTGAAATTGGGTTTTGTGGAACAACTTAACATAAATTGAACAAGTGAGCTATGAATATATTATATTCTGCTAATAAAGGTGGTACCGCGCGTCAGCGTCCTTATAAC
Staphylococcus carnosus subsp. carnosus TM300
	Sca_1012	trpE	-227	74.7	ATGAGATAAAATGAAGTAGATCAGCAGATAAGAGAATTCAGAAAGTTAGTGGTGGATGCGAACTAACCTCTCTGCTGAACGAATTGGGTTTTATTGGAAGCTGCAAATTAAATCGGGAAATGAGTGAGCAGTTATGACTAACTGCTAACAAAGGTGGTACCGCGCAGAAAGCGTCCTTGTTTA
Staphylococcus haemolyticus JCSC1435
	SH1542	trpE	-233	63.7	TAAATAGGCATAAATGAAGTAGTGGTGAGTAAGGTAGTGACAGAAAGTTGATGGTAGATGCAAATCAACACCCCTTATCATGAATTTGGGTTTATGTTGAAAGACAAATCAATAAGAATGAGTGAACGCTTAATATTTTGATTATTCGGAATATTTCGTTAATTAAGGTGGTACCGCGCGTCAGCGTCCTTTAC
	SH1542	trpE	-446	63	AAACAATTCTATGAATGAAGTAGATAATATGATTTGTAGCAAATAGAAAGCCAATGGGTGATGTAAATTGGCACTACATATTAATCGAATTGGGTCTAGAATTTTAAACTTTAATAAAGTAAGAGTGAACAAAGTATTGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTATA
Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305
	SSP1379	trpE	-233	70.6	TTAGAAAACAAAATGAAGTAAGTTATGGCAGGGTAGTTACAGAAAGTTAGTGGTTGATGCAAACTAACACCCACATATACTGAAATTGGGTTTTGTTGGATTAAAACGAATAAAACAAAGAGCGAGTAGATGATTTTAAATTAATTGTTTATCTACTAATTTTAGGTGGTACCGCGCGTCAGCGTCCTTAAC

Export
	Regulatory Sites	[ FASTA format ]	DOWNLOAD