Profile of regulator T-box(Trp) in Staphylococcaceae
Properties
| Regulator family: |
RF00230 |
| Regulation mode: |
|
| Biological process: |
Amino acid metabolism |
| Effector: |
Trp-tRNA |
| Regulog: |
T-box(Trp) - Staphylococcaceae |
Member of regulog collections
Transcription factor binding sites
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Locus Tag |
Name |
Position |
Score |
Sequence |
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Staphylococcus aureus subsp. aureus N315
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SA1199 |
trpE |
-432 |
70.6 |
AGAATTTTCTAAAGAAATAGTAGCAGATATGAAACGTAGCAAATAGAAAGCTAATGGGTGATGGGAATTAGCACGCCATATCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGG |
|
SA1199 |
trpE |
-228 |
66.6 |
TTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGAAAGTTAGTGGATGATGTGAACTAACACCGAGATTAATGAAATTGGGTTTTGTCTGCAACAGAAAAATTATATATAGTAAAGAGTGAACTATGAATATTTTGAATATTCGGTTAATTTAGGTGGTACCACGCGTCAGCGTCCTTTATAT |
|
Staphylococcus capitis SK14
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STACA0001_1613 |
trpE |
-419 |
63.5 |
TAATTTGAATGAATAAGTAGTTACTGCATGTTGTAGCACTAAGAAAGCTAATGGTTGATGTAAATTAGCACAATGCAATAAACGAATTGGGCTTTCAAATTACAATTAAATAATTTAAAAGTGAACAAATAAAATTGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTATTGC |
|
STACA0001_1613 |
trpE |
-220 |
62.6 |
TTTAAGCAAAATGTAGTATTTAAAGAATAGGTAGTAACAGAAAGTTAGTGGTTGATGTAAACTAACACCTACTTTGAAGAAATTGGGTTTTGTGAAATAAAAAAATAAATACAAAGAGTGAGTTTTGAATATTACGAATATTCGGCTAATTAAGGTGGTACCACGCGTCAGCGTCCTTTTTCA |
|
Staphylococcus epidermidis ATCC 12228
|
|
SE1048 |
trpE |
-412 |
62.2 |
TAATTTGATTGATAGAGTAATCATTATATTTTGTAGCAAGCAGAAAGCTAATGGTAGATGTAAATTAGCACATGATAATAGATGAAATGGGCTTTCAAATTTTAACTTAATCATTAAAGTGAACATATATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTATAGA |
|
SE1048 |
trpE |
-220 |
66.1 |
TTGAAGCAAAGTGAAGTAACTAAAGTTGAGGTAGCACCAGAAAGTTAGTGGTAGATGAGAACTAACACCGTCTTTAGTGAAATTGGGTTTTGTGGAACAACTTAACATAAATTGAACAAGTGAGCTATGAATATATTATATTCTGCTAATAAAGGTGGTACCGCGCGTCAGCGTCCTTATAAC |
|
Staphylococcus carnosus subsp. carnosus TM300
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Sca_1012 |
trpE |
-227 |
74.7 |
ATGAGATAAAATGAAGTAGATCAGCAGATAAGAGAATTCAGAAAGTTAGTGGTGGATGCGAACTAACCTCTCTGCTGAACGAATTGGGTTTTATTGGAAGCTGCAAATTAAATCGGGAAATGAGTGAGCAGTTATGACTAACTGCTAACAAAGGTGGTACCGCGCAGAAAGCGTCCTTGTTTA |
|
Staphylococcus haemolyticus JCSC1435
|
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SH1542 |
trpE |
-233 |
63.7 |
TAAATAGGCATAAATGAAGTAGTGGTGAGTAAGGTAGTGACAGAAAGTTGATGGTAGATGCAAATCAACACCCCTTATCATGAATTTGGGTTTATGTTGAAAGACAAATCAATAAGAATGAGTGAACGCTTAATATTTTGATTATTCGGAATATTTCGTTAATTAAGGTGGTACCGCGCGTCAGCGTCCTTTAC |
|
SH1542 |
trpE |
-446 |
63 |
AAACAATTCTATGAATGAAGTAGATAATATGATTTGTAGCAAATAGAAAGCCAATGGGTGATGTAAATTGGCACTACATATTAATCGAATTGGGTCTAGAATTTTAAACTTTAATAAAGTAAGAGTGAACAAAGTATTGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTATA |
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Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305
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SSP1379 |
trpE |
-233 |
70.6 |
TTAGAAAACAAAATGAAGTAAGTTATGGCAGGGTAGTTACAGAAAGTTAGTGGTTGATGCAAACTAACACCCACATATACTGAAATTGGGTTTTGTTGGATTAAAACGAATAAAACAAAGAGCGAGTAGATGATTTTAAATTAATTGTTTATCTACTAATTTTAGGTGGTACCGCGCGTCAGCGTCCTTAAC |
Export
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Regulatory Sites
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[ FASTA format ]
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DOWNLOAD
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