Collection of Manually Curated Inferences of Regulons in Prokaryotic Genomes
-- version 3.2 --

Profile of regulator PckR in Rhizobiales

Properties
Regulator family: LacI
Regulation mode: repressor
Biological process: Central carbohydrate metabolism
Effector:
Regulog: PckR - Rhizobiales
Member of regulog collections
Transcription factor binding sites
Locus Tag Name Position Score Sequence
Agrobacterium tumefaciens str. C58 (Cereon)
Atu3740 fba -90 5 CATTTCAATCGTTTCAATGA
Atu3740 fba -109 5.4 AGTTTCAAACGATTGAAATC
Atu0035 pckA -127 5.4 CTTTTAAATCGATTAATATA
Atu2639 mdh -136 5.1 TGATCTAAACGATTGAAAAT
Atu0035 pckA -157 5.1 GTCTTCAACCGATTTAAAAA
Atu0600 zwf -56 5.5 TTTTTAAATCGATTAGATTA
Atu0185 mgsA -40 5.3 GCTTCAAATCGATTTAATTC
Atu2645 sdhC -163 4.8 TGAACCAATCGATTAAATTC
Atu4505 pckR -69 4.1 TGTTTAAATTGTTTAATTGC
Atu4494 eda -36 5 GATTTCAATCGTTTCAATCG
Atu3760 COG3931 -135 4.8 GAGTTTAATCGATTATATTG
Atu3761 COG5480 -23 4.8 CAATATAATCGATTAAACTC
Atu0401 scrK -51 5.2 CGTCTAAATCGATTTAAGTT
Azorhizobium caulinodans ORS 571
AZC_4063 pckA -128 5.2 AAATTCAAACGATTTGAACG
AZC_4207 hpr -100 5.1 TGATTAAAACGATTGAACTA
Rhizobium etli CFN 42
RHE_CH03500 fba -128 5.2 CCTTTCAAACGATTGAATTG
RHE_CH03500 fba -109 5 GATTTCAATCGTTTCAATGA
RHE_CH00037 pckA -128 5.4 AATTTAAATCGATTAATTAT
RHE_CH03891 mdh -132 5 GCATCTAAACGATTGAAAAT
RHE_CH00037 pckA -158 5.2 CTCTTCAAACGATTTAAAAA
RHE_CH00704 zwf -57 5.5 TTTTTAAATCGATTAGATTA
RHE_CH00173 mgsA -40 5.3 CGATCAAATCGATTGAATTG
RHE_CH03897 sdhC -169 4.6 AACCCGAATCGATTAAATTA
RHE_CH03622 pckR -65 4 TGGTTAAATCTTTTAATTAA
RHE_CH03635 eda -32 4.8 AATTTCAATCGTTTCAAGGA
RHE_CH03544 COG3931 -137 4.5 AATGCTAATCGATTATATTT
RHE_CH03543 COG5480 -81 4.5 AAATATAATCGATTAGCATT
RHE_CH00475 scrK -47 4.7 TCGCTTAATCGATTGAAGAA
Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841
RL4012 fba -137 4.9 GAATTCAATCGTTTCAATGA
RL4012 fba -156 5.3 ACTTTCAAACGATTGAATTG
RL4439 mdh -135 5.1 GTATCTAAACGATTGAAAAC
RL0037 pckA -158 5.5 CTATTCAAACGATTTAAAAT
RL0037 pckA -128 5.4 AATTTAAATCGATTAATTAT
RL0753 zwf -57 5.5 TTTTTAAATCGATTAGATTA
RL0183 mgsA -39 5.1 CGGTCAAATCGATTGAATTG
RL4446 sdhC -168 4.4 AACGCGAATCGATTAAATTA
RL4145 pckR -88 4.1 CGATTAAATCTTTTAATTAA
RL4162 eda -32 4.7 GAATTCAATCGTTTCAAGGA
RL4062 COG3931 -140 4.5 AATGCTAATCGATTATATTT
RL4061 COG5480 -81 4.5 AAATATAATCGATTAGCATT
Rhizobium sp. NGR234
NGR_c31300 mdh -138 4.9 TGATCTAACCGATTGAATTT
NGR_c33940 pckA -157 5.1 CGATTCAACCGATTAAAAAA
NGR_c33940 pckA -127 5.3 TCTTTAAATCGATTAATATA
NGR_c29180 pckR -65 4.1 TGATTTAAACAGTTTAAAGA
NGR_c03190 zwf -56 5.4 CTTTTAAATCGATTAGATTA
NGR_c34840 mgsA -73 5.3 CACTCAAATCGATTTAAATG
NGR_c31370 sdhC -162 4.6 TCGTCTAATCGATTTTATTT
NGR_c29340 eda -30 5.4 AGATTCAATCGTTTTAAAAG
NGR_c28370 COG3931 -222 4.7 AACTCTAATCGATTATATTT
NGR_c28360 COG5480 -92 4.7 AAATATAATCGATTAGAGTT
NGR_c28100 fba -164 5.1 TTTTTAAATCGTTTTAGTCG
NGR_c28100 fba -183 5.5 TATTTCAAACGATTAAATTT
Sinorhizobium meliloti 1021
SMc03983 fba -181 5.5 CTTTTCAAACGATTAAAATT
SMc02495 null -203 4.7 CGAATAAATCGGTTGAATCA
SMc03983 fba -162 4.9 TATTTAAATCGTTTTAGCCC
SMc02479 mdh -140 5 CGATCTAACCGATTGAAATT
SMc02562 pckA -157 5.1 CGATTCAACCGATTAAAAAA
SMc02562 pckA -127 5.3 TCTTTAAATCGATTAATATA
SMc03070 zwf -55 5.5 ATTTTAAATCGATTAGATTA
SMc02834 mgsA -86 5.3 CCTTCAAATCGATTTAAACG
SMc02463 sdhC -160 5 CCGTCAAATCGATTAAATTG
SMc02975 pckR -59 4.2 TAATTTAAACAGTTTAAAGG
SMc03153 eda -30 5.4 TTATTCAATCGTTTTAAAAG
SMc04007 COG3931 -120 4.7 AACTCTAATCGATTATAATC
SMc04006 COG5480 -129 4.7 GATTATAATCGATTAGAGTT
Xanthobacter autotrophicus Py2
Xaut_1176 gnd -56 4.6 CATGTTAAACGATTTAACGG
Xaut_2843 pckA -127 4.3 GCCTTCAATCGGTTAGAGAG
Xaut_1698 edd -95 5 GGATCAAATCGATTTGATCG
Xaut_1177 pckR -69 4.6 CCGTTAAATCGTTTAACATG
Xaut_0504 hpr -151 5.4 AATTTAAAACGATTGAACTT
Mesorhizobium loti MAFF303099
mlr5096 pckA -152 4.9 ATATATAAACGATTTAAACA
mlr3754 fba -86 4.7 ACTTTCAATCGATTCGAGCT
mlr5096 pckA -122 5.1 TTTTTAAATCGATTAATGAT
mlr2994 eda -30 4.4 TCTGCTAATCGGTTGAAATG
mll6516 zwf -62 5.6 AATTTAAATCGATTAGAATA
mll4308 mdh -179 4.9 CCATCTAACCGATTGAAAAT
mlr7586 glgP -48 5.4 CATCTAAATCGATTGAATAT
mlr3822 COG3931 -160 5 AATTCCAATCGATTTAGGAA
mll3821 COG5480 -40 5 TTCCTAAATCGATTGGAATT
mll3969 pyc -104 5.3 GATTTAAATCGGTTTAAACC
mll0929 glpX -128 5 TGGTTCAATCGATTGATATT
Mesorhizobium sp. BNC1
Meso_3502 pckA -162 4.5 GCGTTTAAACGATTTAGTGA
Meso_3436 fba -86 4.8 CATTTCAATCGATTAGGGAG
Meso_3502 pckA -132 5.5 TTTTTAAATCGATTAAAGAA
Meso_0159 zwf -53 5.2 TTATTAAATCGATTAGACTA
Meso_3395 mdh -158 5 CCATCTAAACGATTGAAAAA
Meso_3595 mgsA -40 4.8 AGCTTCAATCGATTTAGGAG
Meso_3246 sdhC -157 4.7 AACTTCAATCGATTCAGTCG
Meso_0989 glpX -129 5 TTATTCAATCGATTCATATT
Brucella melitensis 16M
BMEI0244 null -59 5 GAATTAAATGGTTTTAAATT
BMEI0137 mdh -155 5 AAATCTAACCGATTGAAAAC
BMEI2037 pckA -149 4.6 CGGGTTAAACGATTTAAAAA
BMEI2037 pckA -120 5.8 ATTTTAAATCGATTAAATAT
BMEII0513 zwf -94 5.5 AATTTAAATCGATTAGATAT
BMEII0252 mgsA -59 4.9 GATTTAAAACGATTTAGCCG
BMEII0009 eda -75 5.4 GATTTAAATCGATTTATAAG
BMEI1833 scrK -47 5.5 ATTTTCAATCGATTTAACAG
BMEI0726 glpX -158 4.6 GCTCTAAATCGATTAAGGCT
BMEI1636 pgi -32 5.4 AGATTAAATCGATTTGATTC
Export
Regulatory Sites [ FASTA format ] DOWNLOAD
© 2009-2020 RegPrecise