Collection of Manually Curated Inferences of Regulons in Prokaryotic Genomes
-- version 3.2 --

Propagation of NanR regulog to Bacteroides cellulosilyticus DSM 14838

Reference regulog properties
Source regulog: NanR - Bacteroidaceae
Regulator type: Transcription factor
Regulator family: ROK
Regulation mode: repressor
Biological process: Sialic acid utilization; N-acetylglucosamine utilization
Effector: N-acetylglucosamine; N-acetylneuraminic acid
Phylum: Bacteroidetes
Propagated regulon:
Target genome Bacteroides cellulosilyticus DSM 14838
Orthologous TF(s) BACCELL_04950
Regulated genes 2
Built upon 59 sites [see more]
Predicted regulatory interactions in Bacteroides cellulosilyticus DSM 14838
Locus tag Position Score Sequence
Position: -47
Score: 4.7
Sequence: AATATAATAAACAAATTAATTAA
Position: -44
Score: 5.7
Sequence: ATAATAAACAAATTAATTAATTA
Position: -43
Score: 4.9
Sequence: TAATAAACAAATTAATTAATTAA
Position: -40
Score: 4.8
Sequence: TAAACAAATTAATTAATTAATCT
Locus tag: BACCELL_01010
BACCELL_01010 -47 4.7 AATATAATAAACAAATTAATTAA
-44 5.7 ATAATAAACAAATTAATTAATTA
-43 4.9 TAATAAACAAATTAATTAATTAA
-40 4.8 TAAACAAATTAATTAATTAATCT
Supported by regulated orthologs from reference regulons
Ortholog gene name: exbB
Ortholog function: Outer membrane transport system, transport protein ExbB
Bacteroides cellulosilyticus DSM 14838 BACCELL_01010 -44 5.7 ATAATAAACAAATTAATTAATTA
Bacteroides coprophilus DSM 18228 BACCOPRO_02433 -43 5 TTTATAAACTATTAATTAATTAA
Bacteroides eggerthii DSM 20697 BACEGG_00309 -44 5.5 ATAATAAGTAATTTAATTAATTA
Bacteroides fragilis NCTC 9343 BF3530 -43 5.5 ATAATAATAATTTAATTAATTAA
Bacteroides ovatus ATCC 8483 BACOVA_00648 -39 4.8 ATAATAATCAATTAATTAATCTT
Bacteroides stercoris ATCC 43183 BACSTE_03148 -44 5.5 ATAATAAGTAATTTAATTAATTA
Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 BT2055 -39 4.8 ATAATAATCAATTAATTAATCTT
Bacteroides uniformis ATCC 8492 BACUNI_01658 -44 5.9 ATAATAAATAAATTAATTAATTA
Position: -266
Score: 4.8
Sequence: ATATAGATATATTTATTAAATAA
Position: -239
Score: 5.9
Sequence: TAGATAATAAATTATTTTATTAT
Position: -236
Score: 6.2
Sequence: ATAATAAATTATTTTATTATTAA
Position: -37
Score: 5.5
Sequence: ATATTAATAAAATTATTAAGTAT
Position: -34
Score: 4.9
Sequence: TTAATAAAATTATTAAGTATCTT
Locus tag: BACCELL_04950
BACCELL_04950 -266 4.8 ATATAGATATATTTATTAAATAA
-239 5.9 TAGATAATAAATTATTTTATTAT
-236 6.2 ATAATAAATTATTTTATTATTAA
-37 5.5 ATATTAATAAAATTATTAAGTAT
-34 4.9 TTAATAAAATTATTAAGTATCTT
Supported by regulated orthologs from reference regulons
Ortholog gene name: nanR
Ortholog function: Putative N-acetylglucosamine repressor of sialic acid catabolism, ROK family
Bacteroides cellulosilyticus DSM 14838 BACCELL_04950 -37 5.5 ATATTAATAAAATTATTAAGTAT
Bacteroides dorei DSM 17855 BACDOR_00695 -217 5.5 AAACTAAATTTATTTATTAATAA
Bacteroides eggerthii DSM 20697 BACEGG_02291 -58 6.2 TAATTAATAAATTATTTTATTAT
Bacteroides fragilis NCTC 9343 BF1711 -52 4.8 TTAATAAACAAATTAACTATCTT
Bacteroides ovatus ATCC 8483 BACOVA_01791 -50 5.8 TTAATAAAAAAATTAATTATCTT
Bacteroides plebeius DSM 17135 BACPLE_00597 -88 5.4 TAAATATAATAATTTATTAATGA
Bacteroides stercoris ATCC 43183 BACSTE_01902 -242 6 TATATAATAAATTATTTTATTAT
Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 BT0433 -51 5.8 TTAATAAAAAAATTAATTATCTT
Bacteroides uniformis ATCC 8492 BACUNI_02075 -52 5.1 AATTTACAAAATTATTTTAGTAT
Bacteroides vulgatus ATCC 8482 BVU_4116 -190 5.5 AAACTAAATTTATTTATTAATAA
© 2009-2020 RegPrecise