# TF - NagR: CJA_1165
>CJA_3072(omp_nag) Score=6 Pos=-213 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ATTGACAGCGCTGTCATT
>CJA_0287(hex) Score=5.2 Pos=-81 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
CTGGACAACGTTGTCAGT
>CJA_2191(cbp) Score=5.6 Pos=-139 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
AAAGGCAACGTTGTCATT
>CJA_1157(omp_nag) Score=5.5 Pos=-121 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
GTTGACAACGTTGTCCGT
>CJA_1157(omp_nag) Score=4.9 Pos=-85 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ATCGACAACGTTGTCTTA
>CJA_0988(chiD) Score=5.2 Pos=-350 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
TTTGACAACGTTGTCTCT
>CJA_1069(omp_nag) Score=5.2 Pos=-223 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ATTGACAGCGCTGTCACA
>CJA_1160(nagK) Score=5 Pos=-252 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
TTTGACAACGTTGTCTCG
# TF - NsrR: CJA_1549
>CJA_1546(norB) Score=5.4 Pos=-88 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
AGATTCATTTATTTTGCATCT
>CJA_1547(DUF454) Score=5.4 Pos=-50 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
AGATGCAAAATAAATGAATCT
# TF - BirA: CJA_0677
>CJA_0426(bioB) Score=8.5 Pos=-63 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
TAGTAAACC---------------GGTTGACAG
>CJA_0425(COG1040) Score=8.5 Pos=-147 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
CTGTCAACC---------------GGTTTACTA
# TF - NrdR: CJA_2699
>CJA_1569(nrdA) Score=5.2 Pos=-255 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
CCACTATATCTAGTGG
>CJA_1569(nrdA) Score=4.2 Pos=-456 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
CCCCTAGATATAGGTT
>CJA_1569(nrdA) Score=3.6 Pos=-487 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
CCGCATTATCTTGTAG
# TF - SahR: CJA_0208
>CJA_0208(sahR) Score=7.1 Pos=-23 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ATATCAAAAAATTTTGATAT
>CJA_2542(metH) Score=6.4 Pos=-63 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ATATCAATTTTTTTTGATAT
# TF - Zur: CJA_3482
>CJA_3465(yciC) Score=6.1 Pos=-46 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
AATGTGTTATGTTATAACATATT
>CJA_3480(znuA) Score=5.4 Pos=-3 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
GTTATGTTACTCTATAACCTTTC
>CJA_3482(zur) Score=5.3 Pos=-53 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
GAAAGGTTATAGAGTAACATAAC
# TF - IscR: CJA_1465
>CJA_2843(ydhD) Score=6 Pos=-74 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ATACTTGACTGCATTACTTGGTTTT
>CJA_1465(iscR) Score=6.1 Pos=-131 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ATAGTTGAGTAAAATACTCGGGTTT
>CJA_0888(erpA) Score=6 Pos=-76 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ATAGTTGACTGTTTTGCTGGGGTAA
>CJA_2541(nfuA) Score=5.6 Pos=-66 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ATACCCGAGTATTTTAATCAGGTAT
# TF - NtrC: CJA_3537
>CJA_3534(glnA) Score=5 Pos=-288 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
CGCACCAATACAGTGCT
>CJA_3536(ntrB) Score=5.4 Pos=-152 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
AGCACCAAAATAGTGCA
>CJA_3392(glnK) Score=4.9 Pos=-241 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
TGCTTCATTTTGGTGCG
# TF - LexA: CJA_1697
>CJA_3351(recN) Score=5.8 Pos=-49 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
TACTGTATAAACAGACAGAT
>CJA_3708(PF04055) Score=5.7 Pos=97 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
TACTGTATATGCATACAGAT
>CJA_2230(recA) Score=5.2 Pos=-126 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
CACTGTATAAATTACTAGTA
>CJA_1697(lexA) Score=5.9 Pos=-32 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
AACTGTATAAATACACAGAA
# TF - RutR: CJA_0541
>CJA_0583(nupP) Score=4.4 Pos=-70 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ATCCATCCAAATGGTCAATT
>CJA_0546(xdhA) Score=4.8 Pos=-201 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ACCTGACTGCACGGACAAAA
>CJA_0546(xdhA) Score=4.2 Pos=-77 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
AATTGTCTATTTGGCCAGTC
>CJA_0545(ppuA) Score=4.5 Pos=-165 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
GACTGGCCAAATAGACAATT
>CJA_0545(ppuA) Score=4.4 Pos=-41 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
TTTTGTCCGTGCAGTCAGGT
# RNA - TPP
>CJA_2910(thiD) Score=66.8 Pos=-154 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
CACTTTCTTGTCGGGGTGCTCCGTATCTGTTTGCGGGGCTGAGAAATACCCGCCGACCTGATCCGGTTAGTACCGGCGTAGGGAACGAGAGCTCTTCACTT
>CJA_2106(thiO) Score=69.7 Pos=-103 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
CCCTCTTGTCGGGGCGCCTTGGTAGCACAGCTATTGCGAAGGCTGAGATGGGTTCGGCCCAACCCGTAGAACCTGATCAGGTTGAGACCTGCGGAGGGAACAAGTGCTGCCCATCCGG
# TF - CueR: CJA_1837, CJA_2025
>CJA_2023(copZ) Score=5.3 Pos=-63 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ACCTTACCATGATGTCAAGGA
>CJA_1835(copZ) Score=4.9 Pos=-60 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ACCTTGCCACCGAGGCAAGCC
>CJA_1836(copA) Score=6.1 Pos=-58 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ACCTTACCATGATGGGAAGGT
>CJA_2024(copA) Score=5.3 Pos=-247 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ACCTTACCATGATGTCAAGGA
# TF - CadR-PbrR: CJA_1838
>CJA_1839(czcD) Score=6.2 Pos=-63 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ACCCTCTAGTAACTATAGAGT
# TF - CJA_2253: CJA_2253
>CJA_2253(CJA_2253) Score=6.4 Pos=-43 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ACTTGTTATAACAAGT
# TF - CJA_1242: CJA_1242
>CJA_1244(uahA) Score=5.1 Pos=-39 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ACTTGTATCCAAGA
# TF - MetR: CJA_2446
>CJA_2446(metR) Score=4.7 Pos=-84 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ATGAATTTAATTAAT
>CJA_2448(metE) Score=4.7 Pos=-138 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ATTAATTAAATTCAT
>CJA_2446(metR) Score=4 Pos=-115 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ATGAATCAAACTGAT
# TF - YdcR: CJA_3711
>CJA_3712(COG0348) Score=9.8 Pos=-104 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
ATCTGATACGGTTTT---------AACTGAATCTGTTTT
# TF - CJA_0601: CJA_0601
>CJA_0598(HCH_01828) Score=6.1 Pos=-61 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
TGTGTATTAGTGTATTGATACACG
# TF - YjiR2: CJA_1192
>CJA_1193 Score=16.8 Pos=-142 [Cellvibrio japonicus Ueda107]
TACAGAT-(17)-TACAGTT-(13)-ATCTGTA-(23)-ATCTGTA