# TF - TrpR: VF_0559 943540 VF_0660 COG0733 943928 VF_2602 trpE 943931 VF_1033 trpE 943930 VF_1032 trpD_a 943929 VF_1031 trpD_b 943927 VF_1029 trpC 943926 VF_1028 trpB 943925 VF_1027 trpA # TF - FabR: VF_2438 945533 VF_2548 hyIII 946269 VF_A0699 COG2030 944733 VF_1813 fadL 944192 VF_1292 fabA 945199 VF_2264 lcfH 945834 VF_A0274 OLE1 # TF - NsrR: VF_2315 946009 VF_A0439 nnrS 943458 VF_0578 aox 945250 VF_2315 nsrR 945251 VF_2316 hmp # TF - HexR: VF_0891 943047 VF_0202 gpmM 944814 VF_1894 ptsH 944815 VF_1895 ptsI 944817 VF_1897 crr 945243 VF_2308 ppc 943786 VF_0891 hexR 943670 VF_0776 nirB 943669 VF_0775 nirD 944893 VF_1973 aceB 944892 VF_1972 aceA 943864 VF_0967 ygaW 943616 VF_0736 pepD 945044 VF_2124 gltB 945045 VF_2125 gltD 943808 VF_0913 gapA 946377 VF_A0806 glgC 946376 VF_A0805 glgA 946156 VF_A0586 pntA 946155 VF_A0585 pntB 945035 VF_2115 grcA 943051 VF_0206 tpiA # TF - ArgR: VF_0275 945238 VF_2303 argH 945241 VF_2306 argC 945240 VF_2305 argB 945239 VF_2304 argG 945242 VF_2307 argE 943465 VF_0585 argA 943262 VF_0407 argF # TF - BirA: VF_2425 5488670 VF_A1189 bioB 946318 VF_A0747 bioF 946317 VF_A0746 bioC 946316 VF_A0745 bioD 946319 VF_A0748 bioA # TF - NrdR: VF_0699 945843 VF_A0281 nrdD 945844 VF_A0282 nrdG 944100 VF_1202 nrdA 944099 VF_1201 nrdB # TF - Zur: VF_0306 943724 VF_0829 znuC 943723 VF_0828 znuB 945309 VF_2367 znuC 945310 VF_2368 znuB 943173 VF_0328 zbp 943725 VF_0830 znuA 945308 VF_2366 znuA 943173 VF_0328 zbp 943172 VF_0327 VV1_0719 943171 VF_0326 VC2554 943170 VF_0325 VC2555 # TF - PdhR: VF_2182 945116 VF_2182 pdhR 945115 VF_2181 aceE 945113 VF_2179 aceF 945112 VF_2178 lpdA # TF - FadR: VF_1633 944732 VF_1812 fadL 944731 VF_1811 fadI 944730 VF_1810 fadJ 944557 VF_1642 fadH 943706 VF_0811 VC2105 944852 VF_1932 fadE2 945406 VF_2443 plsB 942869 VF_0025 fadB 942868 VF_0024 fadA # TF - NorR: VF_1783 944702 VF_1782 norV 944701 VF_1781 norW 944700 VF_1780 fpr 944699 VF_1779 tehB 944703 VF_1783 norR1 # TF - HutC: VF_A0454 946023 VF_A0453 hutI 946022 VF_A0452 hutG2 946021 VF_A0451 hutU 946020 VF_A0450 hutH 946024 VF_A0454 hutC # TF - IscR: VF_0616 945424 VF_2461 nfuA 943496 VF_0616 iscR 943497 VF_0617 iscS 943498 VF_0618 iscU 943499 VF_0619 iscA 943500 VF_0620 hscB 943501 VF_0621 hscA 943502 VF_0622 fdx 943503 VF_0623 yfhJ 945059 VF_2134 erpA # TF - NagC: VF_0806 945473 VF_2510 null 943791 VF_0896 tfoX1 943713 VF_0818 gltA 944715 VF_1795 ompC 945063 VF_2138 chiS 946008 VF_A0438 nagE2 943703 VF_0808 nagE2 946581 VF_A1010 hex 944651 VF_1732 ptsG 944996 VF_2076 pyrG 944995 VF_2075 eno 945092 VF_2161 mcp 945703 VF_A0143 cbp 944479 VF_1573 tfoX 944290 VF_1390 chi 944814 VF_1894 ptsH 944815 VF_1895 ptsI 944817 VF_1897 crr 944809 VF_1889 chiP 944509 VF_1598 chiA 943307 VF_0442 pgk 943308 VF_0443 fbaA 945299 VF_2357 nagB 943702 VF_0807 nagA 943701 VF_0806 nagC # TF - SiaR: VF_0664 943545 VF_0665 nagA2 943546 VF_0666 nanE 943547 VF_0667 nanK 943548 VF_0668 nanT 943549 VF_0669 yhcH 943544 VF_0664 siaR 943543 VF_0663 nanA 946357 VF_A0786 ptsG2 # TF - NtrC: VF_0095 945078 VF_2153 glnK 945077 VF_2152 amtB 942941 VF_0096 ntrB 942940 VF_0095 ntrC 942943 VF_0098 glnA # TF - Fur: VF_0810 944124 VF_1226 hutW 944125 VF_1227 huvX 944126 VF_1228 hutZ 944088 VF_1190 irpA 945404 VF_2441 COG3315 944454 VF_1554 nrfA 943822 VF_0927 PF10952 946398 VF_A0827 vctP 946397 VF_A0826 vctD 946396 VF_A0825 vctB 946395 VF_A0824 vctC 946394 VF_A0823 viuB 944132 VF_1234 hutA 946419 VF_A0848 PF11449 943954 VF_1056 VCA1041 945718 VF_A0158 fhuC 945719 VF_A0159 fhuD 945720 VF_A0160 fhuB 945751 VF_A0191 fhuE 945752 VF_A0192 PF11932 945753 VF_A0193 exbB1 945754 VF_A0194 exbB2 945755 VF_A0195 exbD2 945756 VF_A0196 tonB 945757 VF_A0197 VC1543 945717 VF_A0157 PF07690 946355 VF_A0784 fhuA 946354 VF_A0783 fhuC 946353 VF_A0782 fhuD 944177 VF_1277 VV1_2646 944176 VF_1276 pqiA 944175 VF_1275 pqiB 944123 VF_1225 tonB-hmu 944122 VF_1224 exbB-hmu 944121 VF_1223 exbD-hmu 944120 VF_1222 hmuT 944119 VF_1221 hmuU 944118 VF_1220 hmuV 946327 VF_A0756 COG3016 945760 VF_A0200 VV21178 945759 VF_A0199 VV21177 945758 VF_A0198 VCA0003 945721 VF_A0161 iucA 945722 VF_A0162 iucB 945723 VF_A0163 iucC 945724 VF_A0164 iucD 945725 VF_A0165 iutA 945895 VF_A0333 ptrB 945894 VF_A0332 hutR 945893 VF_A0331 VCA0065 945892 VF_A0330 VCA0066 945891 VF_A0329 VCA0067 944453 VF_1553 nrfB 944452 VF_1552 nfrC 944451 VF_1551 nrfD 946398 VF_A0827 vctP 946397 VF_A0826 vctD 946396 VF_A0825 null 946395 VF_A0824 vctC 946394 VF_A0823 VIBHAR_06920 943728 VF_0833 feoA 943729 VF_0834 feoB 943730 VF_0835 feoC 945076 VF_2151 fbpA 945075 VF_2150 fbpB 945074 VF_2149 fbpC 945276 VF_2334 frdA 945277 VF_2335 frdB 945278 VF_2336 frdC 945279 VF_2337 frdD # TF - FruR: VF_A0943 946513 VF_A0942 fruB 946512 VF_A0941 fruK 946511 VF_A0940 fruA 946515 VF_A0943 fruR # TF - PurR: VF_1572 944690 VF_1770 folD 944398 VF_1498 purC 945522 VF_2537 purE 945523 VF_2538 purK 942961 VF_0116 xanP 943806 VF_0911 gsk 945336 VF_2394 purH 945337 VF_2395 purD 944848 VF_1928 purM 944849 VF_1929 purN 943532 VF_0652 purL 944387 VF_1487 purT 944847 VF_1927 upp 943672 VF_0778 ushA 944611 VF_1692 cvpA 944610 VF_1691 purF 944713 VF_1793 fhs 943575 VF_0695 glyA 944185 VF_1285 pyrD # TF - RbsR: VF_1449 944344 VF_1444 rbsD 944345 VF_1445 rbsA 944346 VF_1446 rbsC 944347 VF_1447 rbsB 944348 VF_1448 rbsK 944349 VF_1449 rbsR # TF - AgaR: VF_A1006 946560 VF_A0989 agaY 946577 VF_A1006 agaR2 946576 VF_A1005 agaZ 946575 VF_A1004 agaS 946574 VF_A1003 agaV-II 946573 VF_A1002 agaW-II 946572 VF_A1001 agaE-II 946571 VF_A1000 agaF-II 946570 VF_A0999 agaA # TF - LexA: VF_2442 944556 VF_1641 topB 942889 VF_0044 rmuC 943401 VF_0535 recA 944918 VF_1998 recN 943320 VF_0455 mutH 944393 VF_1493 VC1191 943313 VF_0448 xerD 943314 VF_0449 dsbC 943315 VF_0450 recJ 944169 VF_1269 umuD 943614 VF_0734 dinB 945405 VF_2442 lexA 943848 VF_0951 ruvA 943849 VF_0952 ruvB 943196 VF_0341 uvrA 942913 VF_0068 uvrD 943457 VF_0577 yebG # TF - EbgR: VF_A0348 945900 VF_A0338 SSF48208 945910 VF_A0348 ebgR 945909 VF_A0347 ebgA 945908 VF_A0346 ebgC 945907 VF_A0345 ygjI 945902 VF_A0340 ygjI # TF - PhnR: VF_1530 946661 VF_A1087 phnS2 946662 VF_A1088 PF01663 946663 VF_A1089 phnU2 946664 VF_A1090 phnV2 946665 VF_A1091 phnT2 946666 VF_A1092 COG0560 # TF - NorR2: VF_A0862 946433 VF_A0862 norR2 946434 VF_A0863 hcp 946435 VF_A0864 hcr # RNA - MOCO_RNA_motif 943837 VF_0940 moaA 943838 VF_0941 moaC 943839 VF_0942 moaD 943840 VF_0943 moaE # RNA - Trp_leader 943928 VF_2602 trpE 943931 VF_1033 trpE 943930 VF_1032 trpG 943929 VF_1031 trpD 943927 VF_1029 trpC 943926 VF_1028 trpB 943925 VF_1027 trpA # RNA - yybP-ykoY 946535 VF_A0964 COG2119 945840 VF_A0278 ykoY # RNA - L10_leader 945358 VF_2416 rplJ 945357 VF_2415 rplL # RNA - Lysine 943193 VF_0338 lysC 944545 VF_1630 lysW # RNA - Leu_leader 943140 VF_0295 leuA 943139 VF_0294 leuB 943138 VF_0293 leuC 943137 VF_0292 leuD # RNA - TPP 942877 VF_0032 thiC 942878 VF_0033 thiE 942879 VF_0034 thiF 5488684 VF_2576 thiS 942880 VF_0035 thiG 942881 VF_0036 thiH 945878 VF_A0316 thiD 945879 VF_A0317 thiZ 945880 VF_A0318 thiX 945881 VF_A0319 thiY 945882 VF_A0320 tenA 945883 VF_A0321 thiM 945884 VF_A0322 thiE2 943112 VF_0267 thiB 943113 VF_0268 thiP 943114 VF_0269 thiQ # RNA - GEMM_RNA_motif 944479 VF_1573 tfoX # RNA - S15 943355 VF_0489 rpsO # RNA - Glycine 944354 VF_1454 glyP # RNA - Thr_leader 945038 VF_2118 thrA 945037 VF_2117 thrB 945036 VF_2116 thrC # RNA - Cobalamin 945398 VF_2435 btuB 945397 VF_2434 COG2102 945396 VF_2433 COG0796 946544 VF_A0973 btuF 946543 VF_A0972 btuC 946542 VF_A0971 btuD # RNA - His_leader 943910 VF_1012 hisG 943911 VF_1013 hisD 943912 VF_1014 hisC 943913 VF_1015 hisB 943914 VF_1016 hisH 943915 VF_1017 hisA 943916 VF_1018 hisF 943917 VF_1019 hisI # TF - NarP: VF_1909 943837 VF_0940 moaA 943838 VF_0941 moaC 943839 VF_0942 moaD 943840 VF_0943 moaE 945749 VF_A0189 torY 945748 VF_A0188 torZ 945276 VF_2334 frdA 945277 VF_2335 frdB 945278 VF_2336 frdC 945279 VF_2337 frdD 944501 VF_1590 pflB 944828 VF_1908 narQ 944829 VF_1909 narP 944454 VF_1554 nrfA 944827 VF_1907 napF 944826 VF_1906 napD 944825 VF_1905 napA 944824 VF_1904 napB 944823 VF_1903 napC 943670 VF_0776 nirB 943669 VF_0775 nirD 943668 VF_0774 nirC 943667 VF_0773 cysG 944208 VF_1308 fnr 945295 VF_2353 aspA 945296 VF_2354 dcuA 944744 VF_1824 ccmA 944743 VF_1823 ccmB 944742 VF_1822 ccmC 944741 VF_1821 ccmD 944740 VF_1820 ccmE 944739 VF_1819 ccmF 944738 VF_1818 ccmG 944737 VF_1817 ccmH 944736 VF_1816 ccmH 945441 VF_2478 pckA 945859 VF_A0297 torE 945860 VF_A0298 torC 945861 VF_A0299 torA 945643 VF_A0083 dmsD 945644 VF_A0084 dmsX 945642 VF_A0082 dmsA 945641 VF_A0081 dmsB 945640 VF_A0080 dmsC 944453 VF_1553 nrfB 944452 VF_1552 nfrC 944451 VF_1551 nrfD 944450 VF_1550 nrfE 944449 VF_1549 nrfX 944448 VF_1548 nrfF # TF - ZntR: VF_2393 944422 VF_1522 zntA # TF - CueR: VF_0782 943676 VF_0781 copA 943675 VF_0780 copG 946012 VF_A0442 VCA0262 946013 VF_A0443 cusC 946014 VF_A0444 cusB 946015 VF_A0445 cusA 946016 VF_A0446 cusF 943677 VF_0782 cueR # TF - GalR: VF_A0361 945923 VF_A0361 galR 945914 VF_A0352 galE 945915 VF_A0353 galT 945917 VF_A0355 galK 945918 VF_A0356 galM # TF - MalI: VF_1720 944639 VF_1720 malI 944638 VF_1719 malX 944637 VF_1718 malY # TF - VF_1255: VF_1255 944154 VF_1254 nhaX 944153 VF_1253 malY # TF - CelR2: VF_0608 943483 VF_0603 celF 943484 VF_0604 celE 943485 VF_0605 bglA 943486 VF_0606 glk 943487 VF_0607 celG 943488 VF_0608 celR2 # TF - MetJ: VF_2268 944983 VF_2063 metA 943304 VF_0439 metK 945202 VF_2267 metB 945201 VF_2266 metL 943566 VF_0686 metN 943565 VF_0685 metI 943564 VF_0684 metQ 943192 VF_0337 metH 945203 VF_2268 metJ 944466 VF_1566 mtsA 944465 VF_1565 mtsB 944464 VF_1564 mtsC 946339 VF_A0768 csd 944641 VF_1722 metR 944640 VF_1721 metE 945244 VF_2309 metF # TF - MetR: VF_1722 944641 VF_1722 metR 943575 VF_0695 glyA 944640 VF_1721 metE 945244 VF_2309 metF 945702 VF_A0142 pfl # TF - TyrR: VF_A0751 943428 VF_0553 aroF 943429 VF_0554 tyrA 944516 VF_1605 COG0733 946322 VF_A0751 tyrR 944095 VF_1197 tyrP # TF - PhsR: VF_A0103 945661 VF_A0101 sirA 945660 VF_A0100 sirC 945659 VF_A0099 sirB 945658 VF_A0098 yceA 945662 VF_A0102 phsS 945663 VF_A0103 phsR # TF - SdaR: VF_2155 945081 VF_2156 grtP 945082 VF_2157 garK