# TF - NsrR: Rfer_1883, Rfer_1866 1274516 Rfer_4128 PF01152 1272232 Rfer_1883 nsrR 1272233 Rfer_1884 nnrS # TF - HexR: Rfer_1124 1271458 Rfer_1125 zwf 1271457 Rfer_1124 hexR 1272410 Rfer_2060 edd 1272411 Rfer_2061 eda 1270535 Rfer_0205 pykA 1271459 Rfer_1126 tal 1271460 Rfer_1127 pgi # TF - NrdR 1270699 Rfer_0368 nrdD 1270700 Rfer_0369 Ajs_0086 1270701 Rfer_0370 nrdG 1273719 Rfer_3347 nrdA 1273720 Rfer_3348 nrdB # TF - Zur: Rfer_2054 1272404 Rfer_2054 zur 1272403 Rfer_2053 znuC 1272402 Rfer_2052 znuB 1272401 Rfer_2051 znuA # TF - LldR: Rfer_0202 1270531 Rfer_0201 lldE 1270530 Rfer_0200 lldG 1270529 Rfer_0199 lldF 1270532 Rfer_0202 lldR # TF - HutC: Rfer_4157 1274549 Rfer_4161 COG1414 1274548 Rfer_4160 COG834 (HisJ) 1274547 Rfer_4159 COG765 (HisM) 1274546 Rfer_4158 COG1126 (GlnQ) 1274545 Rfer_4157 hutC 1274544 Rfer_4156 hutD 1274543 Rfer_4155 hutG 1274542 Rfer_4154 hutF # TF - IscR: Rfer_2176 1272527 Rfer_2176 iscR 1272528 Rfer_2177 iscS 1272529 Rfer_2178 iscU 1272530 Rfer_2179 iscA 1272531 Rfer_2180 hscB 1272532 Rfer_2181 hscA 1272533 Rfer_2182 fdx # TF - NtrC: Rfer_2982 1273346 Rfer_2979 glnA 1273347 Rfer_2980 ntrZ 1273348 Rfer_2981 ntrB 1273349 Rfer_2982 ntrC 1272913 Rfer_2554 nrtA 1272914 Rfer_2555 nrtB 1272915 Rfer_2556 nrtC 1272916 Rfer_2557 nasD 1272917 Rfer_2558 nasE 1270804 Rfer_0472 glnK 1270805 Rfer_0473 amtB # TF - ModE: Rfer_2857 1273224 Rfer_2858 modA 1273225 Rfer_2859 modB 1273226 Rfer_2860 modC 1273223 Rfer_2857 modE # TF - LexA: Rfer_2994 1273361 Rfer_2994 lexA 1271558 Rfer_1225 imuA 1271559 Rfer_1226 imuB 1271560 Rfer_1227 dnaE2 1273001 Rfer_2642 parE 1273000 Rfer_2641 parC 1270176 Rfer_4342 umuD 1270175 Rfer_4341 umuC 1274336 Rfer_3948 recA 1274335 Rfer_3947 recX 1270832 Rfer_0500 radA # TF - LiuR: Rfer_3843 1274231 Rfer_3843 liuR 1274230 Rfer_3842 liuA 1274229 Rfer_3841 cah 1274228 Rfer_3840 aceK 1274227 Rfer_3839 ivdA 1274226 Rfer_3838 ivdC 1273990 Rfer_3612 mcm 1272306 Rfer_1957 etfB 1272307 Rfer_1958 etfA 1272308 Rfer_1959 acdH 1272556 Rfer_2204 paaH # TF - LiuR2: Rfer_2820 1273183 Rfer_2819 null 1273184 Rfer_2820 liuR2 1273182 Rfer_2818 atuC 1273181 Rfer_2817 atuD 1273180 Rfer_2816 atuE 1273179 Rfer_2815 atuF 1273178 Rfer_2814 Rfer_2814 # TF - FadP: Rfer_3520 1273893 Rfer_3520 fadP 1273892 Rfer_3519 acdH 1273891 Rfer_3518 null 1273890 Rfer_3517 acdB 1273889 Rfer_3516 acdA 1273385 Rfer_3018 etfD 1272306 Rfer_1957 etfB 1272307 Rfer_1958 etfA 1272308 Rfer_1959 acdH2 1272309 Rfer_1960 null 1272742 Rfer_2386 fadB 1272741 Rfer_2385 fadA 1272740 Rfer_2384 acdH3 1273986 Rfer_3608 null 1271993 Rfer_1646 acdQ 1271992 Rfer_1645 acdP # RNA - TPP 1272821 Rfer_2463 cytX 1272822 Rfer_2464 thiO 1272823 Rfer_2465 thiS 1272824 Rfer_2466 thiG 1272825 Rfer_2467 thiE 1272057 Rfer_1708 thiC 1273617 Rfer_3246 thiB 1273616 Rfer_3245 thiP 1273615 Rfer_3244 thiQ 1272830 Rfer_2472 thiM 1272829 Rfer_2471 thiE 1272828 Rfer_2470 thiD # TF - HrcA: Rfer_1650 1271465 Rfer_1132 groS 1271464 Rfer_1131 groL 1272040 Rfer_1692 rpoH # TF - GntR: Rfer_0957 1271290 Rfer_0957 gntR 1271289 Rfer_0956 gntK # TF - NmlR: Rfer_4023 1274411 Rfer_4023 nmlR 1274410 Rfer_4022 PF00248 # TF - CadR-PbrR: Rfer_0853 1271187 Rfer_0854 cadA # RNA - SAH_riboswitch 1270985 Rfer_0652 ahcY 1270986 Rfer_0653 COG1189 1270987 Rfer_0654 metF 1270798 Rfer_0466 metH # TF - Aave_3515: Rfer_0874 1271207 Rfer_0874 Aave_3515 1271206 Rfer_0873 COG3819 1271205 Rfer_0872 COG3817 1271204 Rfer_0871 pcp 1271203 Rfer_0870 COG1540 1271202 Rfer_0869 alhAB 1271201 Rfer_0868 alhC # TF - CueR: Rfer_0023 1270354 Rfer_0024 copA 1270353 Rfer_0023 cueR # TF - SdaR: Rfer_1641 1271988 Rfer_1641 sdaR 1271987 Rfer_1640 COG579 # TF - ModE3: Rfer_2870 1273634 Rfer_3262 fdoX 1273633 Rfer_3261 fdoG 1273632 Rfer_3260 fdoH 1273631 Rfer_3259 fdoY 1273630 Rfer_3258 fdoI 1273629 Rfer_3257 fdoZ 1273628 Rfer_3256 fdhD 1273235 Rfer_2869 tupA 1273234 Rfer_2868 tupC 1273233 Rfer_2867 tupB # TF - Daci_0595: Rfer_3725 1274114 Rfer_3726 PF01810 1274115 Rfer_3727 racX 1274116 Rfer_3728 PF00892 1274117 Rfer_3729 COG1167 1274118 Rfer_3730 Bpro_4241 1274119 Rfer_3731 phzF # TF - GabR: Rfer_0348 1270680 Rfer_0349 puuD 1270681 Rfer_0350 puuA 1270682 Rfer_0351 gatP 1270683 Rfer_0352 puuO 1270684 Rfer_0353 puuL 1270685 Rfer_0354 puuM 1270686 Rfer_0355 puuN # TF - GabR2: Rfer_0591 1270924 Rfer_0592 gabT 1270925 Rfer_0593 gbtA 1270926 Rfer_0594 gbtD 1270927 Rfer_0595 gbtB 1270928 Rfer_0596 gbtC 1270929 Rfer_0597 speB 1270930 Rfer_0598 gabD # TF - MdcY: Rfer_1839 1272188 Rfer_1839 mdcY 1272189 Rfer_1840 matP 1272190 Rfer_1841 matQ 1272191 Rfer_1842 matM 1272192 Rfer_1843 mdcA 1272193 Rfer_1844 mdcC 1272194 Rfer_1845 mdcD 1272195 Rfer_1846 mdcE 1272196 Rfer_1847 mdcG 1272197 Rfer_1848 mdcB 1272198 Rfer_1849 mdcH # TF - SdhR: Rfer_1802 1272151 Rfer_1802 sdhR 1272150 Rfer_1801 sdhC 1272149 Rfer_1800 sdhD 1272148 Rfer_1799 sdhA 1272147 Rfer_1798 sdhB 1272146 Rfer_1797 COG2938 1272145 Rfer_1796 gltA 1272152 Rfer_1803 mdh 1272153 Rfer_1804 null 1272154 Rfer_1805 Aave_2209 1272155 Rfer_1806 acnB 1271669 Rfer_1335 aceA