# TF - NsrR: Bpro_4724 1824361 Bpro_4720 PF10006 # TF - HexR: Bpro_0750 1820468 Bpro_0751 zwf 1823220 Bpro_3551 edd 1823219 Bpro_3550 eda 1820469 Bpro_0752 tal 1820470 Bpro_0753 pgi 1824278 Bpro_4634 pykA # TF - NrdR: Bpro_2875 1820820 Bpro_1107 nrdA 1820819 Bpro_1106 nrdB # TF - Zur: Bpro_1677 1821374 Bpro_1677 zur 1821375 Bpro_1678 COG2884 1821376 Bpro_1679 COG4591 1821377 Bpro_1680 Aave_2810 1821378 Bpro_1681 PF11736 1821379 Bpro_1682 COG4531 1821380 Bpro_1683 omr # TF - NorR: Bpro_3407 1823078 Bpro_3408 hmp 1823077 Bpro_3407 norR # TF - HutC: Bpro_1165, Bpro_1044 1820761 Bpro_1047 hisX 1820760 Bpro_1046 hisY 1820759 Bpro_1045 hisZ 1820758 Bpro_1044 hutC 1820757 Bpro_1043 hutH 1820756 Bpro_1042 hutU 1820755 Bpro_1041 COG1414 1820754 Bpro_1040 COG834 (HisJ) 1820753 Bpro_1039 COG765 (HisM) 1820752 Bpro_1038 COG1126 (GlnQ) 1820751 Bpro_1037 COG5285 1820750 Bpro_1036 hutD 1820749 Bpro_1035 hutI 1820748 Bpro_1034 hutF 1820876 Bpro_1164 hutU 1820875 Bpro_1163 COG2423 1820874 Bpro_1162 COG3221 (PhnD) 1820873 Bpro_1161 COG3181 1820872 Bpro_1160 hutH 1820877 Bpro_1165 hutC 1820878 Bpro_1166 hutG 1820871 Bpro_1159 COG2855 1820870 Bpro_1158 COG1732 (OpuBC) 1820869 Bpro_1157 hutH2 1820868 Bpro_1156 COG1174 (OpuBB) 1820867 Bpro_1155 COG1174 (OpuBB) 1820866 Bpro_1154 COG1125 (OpuBA) # TF - IscR: Bpro_2177 1821865 Bpro_2177 iscR 1821866 Bpro_2178 iscS 1821867 Bpro_2179 iscU 1821868 Bpro_2180 iscA 1821869 Bpro_2181 hscB 1821870 Bpro_2182 hscA 1821871 Bpro_2183 fdx # TF - NtrC: Bpro_1810 1821503 Bpro_1807 glnA 1821504 Bpro_1808 ntrZ 1821505 Bpro_1809 ntrB 1821506 Bpro_1810 ntrC 1822948 Bpro_3273 narK 1819908 Bpro_0182 CHP02001 1819909 Bpro_0183 glnK 1819910 Bpro_0184 amtB # TF - LexA: Bpro_2954 1822629 Bpro_2954 lexA 1822840 Bpro_3165 parE 1822839 Bpro_3164 yjbJ 1822838 Bpro_3163 parC 1824615 Bpro_4982 umuD 1824616 Bpro_4983 umuC 1822810 Bpro_3135 PF04055 1822068 Bpro_2386 imuA 1822069 Bpro_2387 imuB 1822070 Bpro_2388 dnaE2 1824329 Bpro_4685 recA 1824328 Bpro_4684 recX 1819926 Bpro_0200 radA # TF - LiuR: Bpro_4192 1823845 Bpro_4192 liuR 1823844 Bpro_4191 paaI 1823843 Bpro_4190 liuA 1823842 Bpro_4189 cah 1823841 Bpro_4188 aceK 1823840 Bpro_4187 ivdA 1823839 Bpro_4186 null 1823838 Bpro_4185 ivdC 1823708 Bpro_4054 mcm 1822818 Bpro_3143 etfB 1822817 Bpro_3142 etfA 1822816 Bpro_3141 acdH 1822768 Bpro_3093 paaH # TF - FadP: Bpro_3958 1823613 Bpro_3958 fadP 1823612 Bpro_3957 acdH 1823611 Bpro_3956 acdB 1823610 Bpro_3955 null 1823609 Bpro_3954 null 1823608 Bpro_3953 acdA 1822818 Bpro_3143 etfB 1822817 Bpro_3142 etfA 1822816 Bpro_3141 acdH2 1822815 Bpro_3140 null 1822250 Bpro_2573 fadB 1822249 Bpro_2572 fadA 1822248 Bpro_2571 null 1822247 Bpro_2570 acdH3 1824107 Bpro_4459 null # TF - VanR: Bpro_3386, Bpro_2134 1823058 Bpro_3387 vanA 1823057 Bpro_3386 vanR 1823056 Bpro_3385 vanB 1823055 Bpro_3384 Pnap_2730 1823054 Bpro_3383 CtesDRAFT_4799 1823053 Bpro_3382 CtesDRAFT_4800 1823052 Bpro_3381 CtesDRAFT_4801 1823051 Bpro_3380 CtesDRAFT_4802 # RNA - TPP 1822016 Bpro_2332 cytX 1819765 Bpro_0037 thiC 1819766 Bpro_0038 thiO # TF - HrcA: Bpro_1303 1820477 Bpro_0760 groS 1820476 Bpro_0759 groL 1820968 Bpro_1256 rpoH # TF - SoxR: Bpro_1373 1821083 Bpro_1373 soxR 1821084 Bpro_1374 PF03992 # TF - MerR: Bpro_4798, Bpro_2232 1824437 Bpro_4797 merT 1824436 Bpro_4796 merP 1821918 Bpro_2231 merT 1821917 Bpro_2230 merP 1821916 Bpro_2229 merC 1821915 Bpro_2228 merA 1821914 Bpro_2227 merD 1821913 Bpro_2226 merE # TF - CadR-PbrR 1823150 Bpro_3481 czcD # RNA - SAH_riboswitch 1823786 Bpro_4132 ahcY 1823785 Bpro_4131 COG1189 1823784 Bpro_4130 metF 1819900 Bpro_0174 metH # TF - CueR: Bpro_4873, Bpro_3495 1823165 Bpro_3496 copA 1823164 Bpro_3495 cueR2 1823166 Bpro_3497 copZ2 1824509 Bpro_4872 copA 1824510 Bpro_4873 cueR2 1824508 Bpro_4871 copZ2 # TF - PhnR2: Bpro_3219, Bpro_4693 1824337 Bpro_4693 phnR2 1824336 Bpro_4692 phnA 1824335 Bpro_4691 gap 1824338 Bpro_4694 phnS 1822893 Bpro_3218 phnT 1822892 Bpro_3217 phnU 1822891 Bpro_3216 phnW 1822894 Bpro_3219 phnR2 1822895 Bpro_3220 phnA 1822896 Bpro_3221 gap 1822897 Bpro_3222 null # TF - Bpro_5109: Bpro_5109 1824737 Bpro_5109 Bpro_5109 1824738 Bpro_5110 Veis_4522 1824739 Bpro_5111 Veis_4523 # TF - ModE3: Bpro_1757 1821455 Bpro_1758 tupA 1821456 Bpro_1759 tupC 1821457 Bpro_1760 tupB 1820653 Bpro_0936 fdoX 1820654 Bpro_0937 fdoG 1820655 Bpro_0938 fdoH 1820656 Bpro_0939 fdoY 1820657 Bpro_0940 fdoI 1820658 Bpro_0941 fdoZ 1820659 Bpro_0942 fdhD # TF - ModE2: Bpro_2496 1822174 Bpro_2496 modE2 1822175 Bpro_2497 modA 1822176 Bpro_2498 modB 1822177 Bpro_2499 modC # TF - Bpro_5165: Bpro_5165 1824791 Bpro_5163 COG1573 1824792 Bpro_5164 cog3189 # TF - Daci_0595: Bpro_4233 1823887 Bpro_4234 PF01810 1823888 Bpro_4235 PF00892 1823889 Bpro_4236 CtesDRAFT_4179 1823890 Bpro_4237 null 1823891 Bpro_4238 Aave_4745 1823892 Bpro_4239 null 1823893 Bpro_4240 COG1167 1823894 Bpro_4241 Bpro_4241 1823895 Bpro_4242 phzF 1823896 Bpro_4243 Aave_4440 1823897 Bpro_4244 PF01810 1823898 Bpro_4245 Aave_4441 # TF - YdcR: Bpro_3442 1823118 Bpro_3448 COG2863 1823119 Bpro_3449 COG3258 # TF - Daci_3053: Bpro_2754 1822431 Bpro_2754 Daci_3053 1822432 Bpro_2755 dld2 1820269 Bpro_0548 sgaA2 1822430 Bpro_2753 sgaA 1822429 Bpro_2752 Daci_3770 1822428 Bpro_2751 Daci_3771 1822427 Bpro_2750 Daci_3772 # TF - GabR2: Bpro_2911 1822587 Bpro_2912 gabT 1822588 Bpro_2913 gbtA 1822589 Bpro_2914 gbtD 1822590 Bpro_2915 gbtB 1822591 Bpro_2916 gbtC # TF - Aave_3430: Bpro_2661 1822339 Bpro_2662 null 1822338 Bpro_2661 Aave_3430 # TF - UxuR2: Bpro_3963 1823632 Bpro_3977 uxuR3 1823633 Bpro_3978 Bpro_3978 1823617 Bpro_3962 COG4948 1823616 Bpro_3961 Bpro_3961 1823615 Bpro_3960 Bpro_3960 1823614 Bpro_3959 mhpD 1823618 Bpro_3963 uxuR2 1823619 Bpro_3964 dctP 1823620 Bpro_3965 dctQ 1823621 Bpro_3966 dctM 1823622 Bpro_3967 uxaA 1823631 Bpro_3976 null 1823630 Bpro_3975 null 1823629 Bpro_3974 null 1823628 Bpro_3973 null 1823627 Bpro_3972 COG2055 1823626 Bpro_3971 COG2706 1823625 Bpro_3970 uxuA # TF - UxuR3: Bpro_3977 1823632 Bpro_3977 uxuR3 1823633 Bpro_3978 Bpro_3978 1823631 Bpro_3976 COG0834 1823630 Bpro_3975 COG0765 1823629 Bpro_3974 COG0765-2 1823628 Bpro_3973 COG1126 1823627 Bpro_3972 COG2055 1823626 Bpro_3971 COG2706 1823625 Bpro_3970 uxuA # TF - SdhR: Bpro_3599 1823265 Bpro_3599 sdhR 1823266 Bpro_3600 sdhC 1823267 Bpro_3601 sdhD 1823268 Bpro_3602 sdhA 1823269 Bpro_3603 sdhB 1823270 Bpro_3604 COG2938 1823271 Bpro_3605 gltA 1823264 Bpro_3598 mdh 1823263 Bpro_3597 citE 1823262 Bpro_3596 Aave_2209 1823261 Bpro_3595 acnB 1821789 Bpro_2101 aceA # TF - GudR: Bpro_3418, Bpro_4527 1823089 Bpro_3419 kdgD 1823090 Bpro_3420 tctC4 1823091 Bpro_3421 gudD 1823092 Bpro_3422 kgsD 1824173 Bpro_4526 tctC 1823088 Bpro_3418 gudR 1824174 Bpro_4527 gudR # TF - GguR: Bpro_3110 1822785 Bpro_3110 gguR 1822784 Bpro_3109 udh 1822783 Bpro_3108 uxuL1 1822782 Bpro_3107 uxuP 1822781 Bpro_3106 uxuQ 1822780 Bpro_3105 uxuM 1822779 Bpro_3104 garD 1822778 Bpro_3103 garL 1822777 Bpro_3102 garR 1822776 Bpro_3101 tctC1 1822775 Bpro_3100 aldE # TF - TalR: Bpro_0436 1820161 Bpro_0436 talR 1820160 Bpro_0435 talD 1820159 Bpro_0434 tctC