# TF - NsrR: Bxe_A2375 3360573 Bxe_A2376 PF01152 3360574 Bxe_A2375 nsrR # TF - HexR: Bxe_A0588 3362385 Bxe_A0588 hexR 3359447 Bxe_A3452 zwf 3359446 Bxe_A3453 pgl 3359445 Bxe_A3454 glk 3362384 Bxe_A0589 edd 3362383 Bxe_A0590 eda # TF - NrdR: Bxe_A3913 3362452 Bxe_A0521 nrdA 3362451 Bxe_A0522 null 3362450 Bxe_A0523 nrdB # TF - NikR: Bxe_C0039 3366116 Bxe_C0038 hoxN 3366117 Bxe_C0039 nikR # TF - Zur: Bxe_A0718 3362254 Bxe_A0718 zur 3362255 Bxe_A0717 znuA 3362256 Bxe_A0716 znuC 3362257 Bxe_A0715 znuB 3365174 Bxe_B0900 omr2 3365175 Bxe_B0899 exbB 3365176 Bxe_B0898 exbD 3365177 Bxe_B0897 tonB # TF - LldR: Bxe_A4447, Bxe_B1175 3364898 Bxe_B1176 lldE 3364897 Bxe_B1177 lldF 3364896 Bxe_B1178 lldG 3358444 Bxe_A4447 lldR # TF - NorR: Bxe_B2332 3363734 Bxe_B2333 hmp # TF - HutC: Bxe_B1824, Bxe_B1823, Bxe_A2946 3364241 Bxe_B1829 hisJ2 3364242 Bxe_B1828 hisQ2 3364243 Bxe_B1827 hisM2 3364244 Bxe_B1826 hisP2 3364245 Bxe_B1825 hutH2 3364246 Bxe_B1824 hutC 3359962 Bxe_A2947 hutH 3359963 Bxe_A2946 hutC 3359964 Bxe_A2945 hutU 3359965 Bxe_A2944 hutD 3359966 Bxe_A2943 hutI 3359967 Bxe_A2942 hutF 3359968 Bxe_A2941 hutG # TF - IscR: Bxe_A1552 3361403 Bxe_A1552 iscR 3361402 Bxe_A1553 iscS 3361401 Bxe_A1554 iscU 3361400 Bxe_A1555 iscA 3361399 Bxe_A1556 hscB 3361398 Bxe_A1557 hscA 3361397 Bxe_A1558 fdx 3361396 Bxe_A1559 yfhJ # TF - NagQ: Bxe_A4156 3358739 Bxe_A4156 nagQ 3358740 Bxe_A4155 nagA 3358741 Bxe_A4154 nagB2 3358742 Bxe_A4153 ptsI 3358743 Bxe_A4152 nagE # TF - GlcC: Bxe_A2218 3360735 Bxe_A2218 glcC 3360734 Bxe_A2219 glcD 3360733 Bxe_A2220 glcE 3360732 Bxe_A2221 glcF 3360731 Bxe_A2222 glcG 3360730 Bxe_A2223 glcB # TF - NtrC: Bxe_A1524 3361434 Bxe_A1522 glnA 3361433 Bxe_A1523 ntrB 3361432 Bxe_A1524 ntrC 3360739 Bxe_A2214 nasD 3360740 Bxe_A2213 nasE 3360741 Bxe_A2212 nasBA # TF - RbsR: Bxe_A2000 3360955 Bxe_A1997 rbsB 3360954 Bxe_A1998 rbsA 3360953 Bxe_A1999 rbsC 3360952 Bxe_A2000 rbsR # TF - ModE: Bxe_B2851 3363212 Bxe_B2848 modA 3363211 Bxe_B2849 modB 3363210 Bxe_B2850 modC 3364595 Bxe_B1479 modB 3364594 Bxe_B1480 modA 3364593 Bxe_B1481 modC # TF - LexA: Bxe_A2471 3361965 Bxe_A1003 PF04055 3363037 Bxe_B3023 PF10616 3363036 Bxe_B3024 PF00589 3359908 Bxe_A3001 uvrA 3360477 Bxe_A2471 lexA 3362301 Bxe_A0671 recA 3362300 Bxe_A0672 recX 3359080 Bxe_A3818 BPSS1334 3362762 Bxe_A0227 imuA 3364895 Bxe_B1179 PF08774 3364894 Bxe_B1180 PF06733 # TF - LiuR: Bxe_A4252 3358643 Bxe_A4252 liuR 3358642 Bxe_A4253 aceK 3358641 Bxe_A4254 cah 3358640 Bxe_A4255 ivdA 3358639 Bxe_A4256 null 3358638 Bxe_A4257 ivdC 3358637 Bxe_A4258 null 3365114 Bxe_B0960 liuA 3365113 Bxe_B0961 liuB 3365112 Bxe_B0962 liuC 3365111 Bxe_B0963 liuD 3362947 Bxe_A0042 aacS # TF - PsrA: Bxe_A2773 3361893 Bxe_A1072 fabH 3361892 Bxe_A1073 fabD 3361891 Bxe_A1074 fabG 3361890 Bxe_A1075 acpP 3361889 Bxe_A1076 fabF 3360137 Bxe_A2773 psrA 3360136 Bxe_A2774 fadE 3360135 Bxe_A2775 fabG 3360134 Bxe_A2776 null 3360133 Bxe_A2777 fadA 3360132 Bxe_A2778 fadD # TF - RutR: Bxe_A1426 3361530 Bxe_A1427 pydC 3361529 Bxe_A1428 pydX 3361528 Bxe_A1429 pydA 3361527 Bxe_A1430 pydP 3361526 Bxe_A1431 pydB 3361531 Bxe_A1426 rutR # TF - FadP: Bxe_A4039 3361597 Bxe_A1362 etfD 3362500 Bxe_A0474 fadD1 3362221 Bxe_A0751 fadD2 3358857 Bxe_A4039 fadP 3358858 Bxe_A4038 acdH 3358859 Bxe_A4037 acdB 3358860 Bxe_A4036 acdA 3358861 Bxe_A4035 echH 3360679 Bxe_A2274 fadB 3360680 Bxe_A2273 fadA 3358618 Bxe_A4276 nppD 3361970 Bxe_A0998 etfB 3361969 Bxe_A0999 etfA 3361968 Bxe_A1000 acdH2 3359719 Bxe_A3184 paaH1 3359718 Bxe_A3185 paaG4 3359717 Bxe_A3186 null 3359716 Bxe_A3187 null 3359715 Bxe_A3188 acdH4 3359710 Bxe_A3193 null 3359711 Bxe_A3192 acdQ 3359712 Bxe_A3191 acdP 3359713 Bxe_A3190 maoC 3359714 Bxe_A3189 echI # TF - LiuQ: Bxe_A1393, Bxe_B0959 3365115 Bxe_B0959 liuQ1 3361564 Bxe_A1394 atuB 3361563 Bxe_A1395 acsA 3361562 Bxe_A1396 null 3365114 Bxe_B0960 liuA 3365113 Bxe_B0961 liuB 3365112 Bxe_B0962 liuC 3365111 Bxe_B0963 liuD 3361565 Bxe_A1393 liuQ2 # TF - PhnF: Bxe_B2178 3363888 Bxe_B2179 phnG 3363887 Bxe_B2180 phnH 3363886 Bxe_B2181 phnI 3363885 Bxe_B2182 phnJ 3363884 Bxe_B2183 phnK 3363883 Bxe_B2184 phnL 3363882 Bxe_B2185 phnM 3363889 Bxe_B2178 phnF 3363890 Bxe_B2177 rcsF 3363891 Bxe_B2176 phnN 3365235 Bxe_B0839 phnC 3365236 Bxe_B0838 phnD 3365237 Bxe_B0837 phnE # TF - PaaR: Bxe_A0289 3362509 Bxe_A0470 paaZ 3362510 Bxe_A0469 paaJ 3362511 Bxe_A0468 paaF 3362512 Bxe_A0467 paaY 3362513 Bxe_A0466 paaK 3362508 Bxe_A0471 paaG 3362694 Bxe_A0295 paaA 3362695 Bxe_A0294 paaB 3362696 Bxe_A0293 paaC 3362697 Bxe_A0292 paaD 3362698 Bxe_A0291 paaE 3362699 Bxe_A0290 paaW 3362700 Bxe_A0289 paaR # RNA - FMN 3362338 Bxe_A0635 ribB # RNA - TPP 3362597 Bxe_A0383 thiO 3362596 Bxe_A0384 thiS 3362595 Bxe_A0385 thiG 3362594 Bxe_A0386 thiE 3361508 Bxe_A1449 thiC # RNA - Cobalamin 3364829 Bxe_B1245 cobG 3364830 Bxe_B1244 cbiC 3364831 Bxe_B1243 cbiL 3364832 Bxe_B1242 cbiGH 3363459 Bxe_B2601 bglu_2g19320 3363460 Bxe_B2600 cbtA 3364422 Bxe_B1647 cobW 3364423 Bxe_B1646 cobN 3364424 Bxe_B1645 chlI 3364425 Bxe_B1644 chlD 3359397 Bxe_A3502 btuB 3359398 Bxe_A3501 btuC 3359399 Bxe_A3500 btuD 3359400 Bxe_A3499 cobT 3359401 Bxe_A3498 cobS 3359402 Bxe_A3497 cobC 3364420 Bxe_B1649 cysG # RNA - SAH_riboswitch 3362811 Bxe_A0178 ahcY 3362810 Bxe_A0179 PF04020 3362809 Bxe_A0180 metF # RNA - ykkC-yxkD 3364697 Bxe_B1377 uctB 3364692 Bxe_B1382 amt1 3364691 Bxe_B1383 amt2 3364690 Bxe_B1384 ucaA 3364689 Bxe_B1385 ucaB 3364688 Bxe_B1386 uctP 3364687 Bxe_B1387 uctA # RNA - Glycine 3362933 Bxe_A0056 gcvT 3362934 Bxe_A0055 gcvH 3362935 Bxe_A0054 gcvP 3362936 Bxe_A0053 null 3362937 Bxe_A0052 sdaA 3364726 Bxe_B1348 dadA 3366481 Bxe_C0404 dadA # RNA - yybP-ykoY 3362043 Bxe_A0925 COG2119 3362900 Bxe_A0089 COG0530 # RNA - mini-ykkC 3359655 Bxe_A3247 ykkC # RNA - sucA 3360098 Bxe_A2812 sucA 3360099 Bxe_A2811 sucB 3360100 Bxe_A2810 lpdA # TF - YrdX: Bxe_A1406 3361551 Bxe_A1407 PF02635 3361550 Bxe_A1408 COG388 3361549 Bxe_A1409 COG2516 3361548 Bxe_A1410 COG3153 3361547 Bxe_A1411 COG2144 3361546 Bxe_A1412 COG438 (RfaG) # TF - HrcA: Bxe_A3966 3359082 Bxe_A3816 groS 3359083 Bxe_A3815 groL 3358749 Bxe_A4146 rpoH # TF - NmlR: Bxe_A2371 3360578 Bxe_A2371 nmlR 3360579 Bxe_A2370 pcaC # TF - CueR: Bxe_A3161 3359746 Bxe_A3162 copZ 3359747 Bxe_A3161 cueR 3363769 Bxe_B2298 copZ # TF - MerR: Bxe_A0237, Bxe_C1217 3367291 Bxe_C1216 merT 3367290 Bxe_C1215 merP 3367289 Bxe_C1214 merC 3367288 Bxe_C1213 merA 3367287 Bxe_C1212 merD 3367286 Bxe_C1211 merE 3362751 Bxe_A0238 merT 3362750 Bxe_A0239 merP # TF - CadR-PbrR: Bxe_A4438, Bxe_B2912, Bxe_B1604, Bxe_C0392, Bxe_C0882, Bxe_A2902, Bxe_A1117, Bxe_A1103 3358452 Bxe_A4439 cadA 3366468 Bxe_C0391 czcD 3366467 Bxe_C0390 lspA 3366466 Bxe_C0389 tnpA 3361860 Bxe_A1104 czcD 3361859 Bxe_A1105 lspA 3361858 Bxe_A1106 tnpA 3360006 Bxe_A2903 czcD 3360005 Bxe_A2904 lspA 3360004 Bxe_A2905 tnpA 3361846 Bxe_A1118 czcD 3361845 Bxe_A1119 lspA 3363149 Bxe_B2911 czcD 3363150 Bxe_B2910 lspA 3363151 Bxe_B2909 tnpA 3366959 Bxe_C0883 czcD 3366960 Bxe_C0884 lspA 3366961 Bxe_C0885 tnpA 3364469 Bxe_B1605 czcD 3364468 Bxe_B1606 lspA 3364467 Bxe_B1607 tnpA # TF - Bxe_A4089: Bxe_A4089, Bxe_A4101 3358806 Bxe_A4090 null 3358805 Bxe_A4091 null 3358804 Bxe_A4092 null 3358803 Bxe_A4093 Bxe_A4093 3358802 Bxe_A4094 null 3358801 Bxe_A4095 null 3358800 Bxe_A4096 null 3358795 Bxe_A4101 null 3358794 Bxe_A4102 null 3358807 Bxe_A4089 null 3358796 Bxe_A4100 null 3358797 Bxe_A4099 null 3358798 Bxe_A4098 null # TF - BglR: Bxe_B2079 3363984 Bxe_B2084 bglB 3363985 Bxe_B2083 bglE 3363986 Bxe_B2082 bglF 3363987 Bxe_B2081 bglG 3363988 Bxe_B2080 bglK 3363989 Bxe_B2079 bglR # TF - PtxS: Bxe_A1983 3360973 Bxe_A1979 kguE 3360972 Bxe_A1980 kguK 3360971 Bxe_A1981 kguT 3360970 Bxe_A1982 kguD 3360969 Bxe_A1983 ptxS 3360968 Bxe_A1984 kguM 3360967 Bxe_A1985 kguX # TF - Bphy_2245: Bxe_A3676 3359222 Bxe_A3676 Bphy_2245 3359223 Bxe_A3675 Bphy_2244 3359224 Bxe_A3674 Bphy_2243 3359225 Bxe_A3673 Bphy_2242 3359226 Bxe_A3672 Bphy_2241 3359227 Bxe_A3671 Bphy_2240 # TF - GabR: Bxe_B0835, Bxe_B2934 3363127 Bxe_B2933 gbtA 3363128 Bxe_B2932 gbtD 3363129 Bxe_B2931 gbtB 3363130 Bxe_B2930 gbtC 3365240 Bxe_B0834 gabT 3365241 Bxe_B0833 gabD # TF - BPSL1304: Bxe_A1469 3361489 Bxe_A1468 RSc1791 3361490 Bxe_A1467 RSc1792 3361491 Bxe_A1466 RSc1793 3361492 Bxe_A1465 RSc1794 3361493 Bxe_A1464 RSc1795 3361488 Bxe_A1469 BPSL1304 # TF - FdsR: Bxe_A0967 3362002 Bxe_A0966 fdsG 3362003 Bxe_A0965 fdsB 3362004 Bxe_A0964 fdsA 3362005 Bxe_A0963 fdsD 3362001 Bxe_A0967 fdsR # TF - PhnR2: Bxe_B1871 3364190 Bxe_B1875 phnS2 3364191 Bxe_B1874 phnT2 3364192 Bxe_B1873 phnU2 3364193 Bxe_B1872 phnV 3364194 Bxe_B1871 phnR2 3364195 Bxe_B1870 phnA2 3364196 Bxe_B1869 gap 3364197 Bxe_B1868 COG4341 3364189 Bxe_B1876 null # TF - Bxe_B1375: Bxe_B1375 3364707 Bxe_B1367 null 3364706 Bxe_B1368 null 3364705 Bxe_B1369 null 3364704 Bxe_B1370 null 3364703 Bxe_B1371 null 3364702 Bxe_B1372 null 3364701 Bxe_B1373 null 3364700 Bxe_B1374 null 3364699 Bxe_B1375 Bxe_B1375 # TF - UraR: Bxe_A1922 3361030 Bxe_A1922 uraR # TF - UreR: Bxe_A0567 3362406 Bxe_A0567 ureR 3362405 Bxe_A0568 dctA 3362404 Bxe_A0569 allH 3362403 Bxe_A0570 ureH # TF - EutR: Bxe_C0055 3366134 Bxe_C0056 eutB 3366135 Bxe_C0057 eutC 3366136 Bxe_C0058 eutE 3366137 Bxe_C0059 doeX 3366138 Bxe_C0060 doeC 3366139 Bxe_C0061 doeD 3366141 Bxe_C0063 eutD 3366133 Bxe_C0055 eutR 3366142 Bxe_C0064 ehuA 3366143 Bxe_C0065 ehuB 3366144 Bxe_C0066 ehuC 3366145 Bxe_C0067 ehuD 3366146 Bxe_C0068 eutA # TF - TauR: Bxe_B0695 3365383 Bxe_B0691 xsc 3365384 Bxe_B0690 pta 3365385 Bxe_B0689 tauE 3365380 Bxe_B0694 tauA 3365381 Bxe_B0693 tauB 3365382 Bxe_B0692 tauC 3365390 Bxe_B0684 tauX 3365389 Bxe_B0685 tauY # TF - PdxW: Bxe_B0246 3365829 Bxe_B0245 PF00583 3365881 Bxe_B0193 PF00583 # TF - BPSL1086: Bxe_A3330 3359571 Bxe_A3331 BMA1950 3359570 Bxe_A3332 aspB 3359569 Bxe_A3333 COG251 (TdcF) 3359568 Bxe_A3334 COG384 (PhzF) 3365402 Bxe_B0672 PF01810 # TF - ModE2: Bxe_B1193 3364882 Bxe_B1192 Bxe_B1193 3364881 Bxe_B1193 modE2 3364884 Bxe_B1190 modA2 3364885 Bxe_B1189 modCB2 # TF - SdhR: Bxe_B2896 3364541 Bxe_B1533 acnB 3365542 Bxe_B0532 icd2 3362175 Bxe_A0797 icd 3363164 Bxe_B2896 sdhR 3363165 Bxe_B2895 sdhC 3363166 Bxe_B2894 sdhD 3363167 Bxe_B2893 sdhA 3363168 Bxe_B2892 sdhB 3363169 Bxe_B2891 COG2938 3363170 Bxe_B2890 gltA 3363163 Bxe_B2897 null 3363162 Bxe_B2898 mdh # TF - BPSS1200: Bxe_B0760 3364647 Bxe_B1427 PF02627 3364648 Bxe_B1426 PF02525 3364649 Bxe_B1425 PF07883 # TF - OapR: Bxe_B0671 3365404 Bxe_B0670 oapT # TF - BPSS0970: Bxe_A1487 3361470 Bxe_A1486 fdhA2 # TF - YdcR: Bxe_B0924 3365151 Bxe_B0923 PF11174 3365152 Bxe_B0922 cysI 3365153 Bxe_B0921 COG3749 # TF - Bphy_4252: Bxe_B3002, Bxe_A4449 3358440 Bxe_A4451 Bphy_4542 3363058 Bxe_B3002 Bphy_4252 3358442 Bxe_A4449 Bphy_4252 3363059 Bxe_B3001 sgaA # TF - Bxe_A4302: Bxe_A4302 3358591 Bxe_A4303 COG0235 3358590 Bxe_A4304 COG0329 # TF - GguR: Bxe_B1804 3364268 Bxe_B1802 kdgD 3364267 Bxe_B1803 gudP 3364269 Bxe_B1801 garD 3364270 Bxe_B1800 udh 3364271 Bxe_B1799 uxuL 3364265 Bxe_B1805 kgsD 3364266 Bxe_B1804 gguR 3364272 Bxe_B1798 uxuP 3364273 Bxe_B1797 uxuQ 3364274 Bxe_B1796 uxuM 3364275 Bxe_B1795 omp 3365535 Bxe_B0539 gudD