# TF - RpoH: Ddes_1443
8503215	Ddes_0691	clpP
8503216	Ddes_0692	clpX

8504727	Ddes_2161	rpoZ


# TF - PhoB: Ddes_0567
8503088	Ddes_0566	pstS
8503087	Ddes_0565	pstC-2
8503086	Ddes_0564	pstA-2

8503089	Ddes_0567	phoB
8503090	Ddes_0568	null
8503091	Ddes_0569	pstB-1
8503092	Ddes_0570	null
8503093	Ddes_0571	null


# TF - PerR: Ddes_1388
8504265	Ddes_1704	null

8504576	Ddes_2010	rbO
8504577	Ddes_2011	null
8504578	Ddes_2012	roO

8503933	Ddes_1388	perR

8503423	Ddes_0897	rbr2


# TF - NikR: Ddes_1765
8503563	Ddes_1032	nikA
8503562	Ddes_1031	nikB
8503561	Ddes_1030	nikC
8503560	Ddes_1029	nikD

8504018	Ddes_1470	nikK


# TF - TunR: Ddes_0167
8502591	Ddes_0089	null

8504220	Ddes_1667	phsA
8504219	Ddes_1666	phsB

8502671	Ddes_0167	TunR

8502672	Ddes_0168	modA
8502673	Ddes_0169	modB
8502674	Ddes_0170	modC


# TF - ArsR3: Ddes_1925
8504491	Ddes_1925	arsR3

8504492	Ddes_1926	arsM


# TF - Ddes_0528, DESPIG_03026: Ddes_0528
8503045	Ddes_0528	hcpR2

8503696	Ddes_1164	null


# TF - Fur: Ddes_0603
8504007	Ddes_1459	null
8504008	Ddes_1460	null
8504009	Ddes_1461	null

8504517	Ddes_1951	fld

8504312	Ddes_1750	feoA

8504134	Ddes_1586	null

8503780	Ddes_1247	null
8503781	Ddes_1248	null

8504205	Ddes_1652	null

8502992	Ddes_0477	null

8503170	Ddes_0648	null

8504441	Ddes_1876	copA

8504291	Ddes_1729	null
8504290	Ddes_1728	null
8504289	Ddes_1727	null

8502944	Ddes_0430	null


# TF - FliA: Ddes_0325
8504745	Ddes_2179	null

8503047	Ddes_0530	null
8503046	Ddes_0529	fliS

8504572	Ddes_2006	null
8504571	Ddes_2005	flgM

8503479	Ddes_0949	null
8503478	Ddes_0948	null
8503477	Ddes_0947	null

8503817	Ddes_1275	null
8503818	Ddes_1276	null

8503928	Ddes_1383	null


# TF - DVU2802: Ddes_1719
8504281	Ddes_1719	null
8504282	Ddes_1720	null
8504283	Ddes_1721	null
8504284	Ddes_1722	null
8504285	Ddes_1723	null


# TF - DVU2644: Ddes_0341
8502846	Ddes_0339	null
8502847	Ddes_0340	null


# TF - CooA: Ddes_0383
8502895	Ddes_0382	cooS
8502894	Ddes_0381	cooC


# TF - SahR: Ddes_0040
8504574	Ddes_2008	metF

8504854	Ddes_2286	panC
8504855	Ddes_2287	metK

8502541	Ddes_0040	sahR
8502540	Ddes_0039	ahcY


# TF - Ddes_1411/Ddes_2092: Ddes_2092, Ddes_1411
8503958	Ddes_1413	null

8504659	Ddes_2093	null
8504660	Ddes_2094	null
8504661	Ddes_2095	null

8503957	Ddes_1412	null

8504658	Ddes_2092	Ddes_1411/Ddes_2092

8503959	Ddes_1414	null

8503956	Ddes_1411	Ddes_1411/Ddes_2092


# TF - Ddes_1827: Ddes_1827
8504390	Ddes_1827	null
8504391	Ddes_1828	null
8504392	Ddes_1829	null


# TF - Ddes_1264: Ddes_1264
8503806	Ddes_1264	null
8503807	Ddes_1265	zntA


# RNA - FMN
8504858	Ddes_2290	ribB


# RNA - TPP
8503150	Ddes_0628	thiC

8504731	Ddes_2165	thiS
8504732	Ddes_2166	thiG
8504733	Ddes_2167	thiH
8504734	Ddes_2168	thiF


# RNA - Cobalamin
8503603	Ddes_1071	null

8504902	Ddes_2334	cbiK2

8503321	Ddes_0796	btuC
8503322	Ddes_0797	btuD
8503323	Ddes_0798	btuF
8503324	Ddes_0799	cbiL


# RNA - Glycine
8502614	Ddes_0112	grdB
8502615	Ddes_0113	grdE

8503514	Ddes_0984	Ddes_0984
8503513	Ddes_0983	cycA


# RNA - yybP-ykoY
8503116	Ddes_0594	COG0530


# TF - DVU1964/DVU1967: Ddes_0843, Ddes_0842
8504411	Ddes_1846	null
8504412	Ddes_1847	null

8503368	Ddes_0843	DVU1967
8503369	Ddes_0844	null


# RNA - mini-ykkC
8504724	Ddes_2158	ykkC


# TF - Rex: Ddes_2257
8503448	Ddes_0921	dsrA
8503447	Ddes_0920	dsrB
8503446	Ddes_0919	dsrD

8504749	Ddes_2183	atpF1
8504750	Ddes_2184	atpF2
8504751	Ddes_2185	atpH
8504752	Ddes_2186	atpA
8504753	Ddes_2187	atpG
8504754	Ddes_2188	atpD
8504755	Ddes_2189	atpC

8503498	Ddes_0968	ppaC

8504445	Ddes_1880	cooM
8504446	Ddes_1881	cooK
8504447	Ddes_1882	cooL
8504448	Ddes_1883	cooX
8504449	Ddes_1884	cooU
8504450	Ddes_1885	cooH
8504451	Ddes_1886	hypA
8504452	Ddes_1887	cooF

8503770	Ddes_1237	dhcA
8503771	Ddes_1238	rnfC
8503772	Ddes_1239	rnfD
8503773	Ddes_1240	rnfG
8503774	Ddes_1241	rnfE
8503775	Ddes_1242	rnfA
8503776	Ddes_1243	rnfB
8503777	Ddes_1244	null

8504696	Ddes_2130	apsB
8504695	Ddes_2129	apsA

8504522	Ddes_1956	adk

8502969	Ddes_0454	sat


# TF - DVU2827: Ddes_1434
8503983	Ddes_1437	null
8503984	Ddes_1438	null

8503982	Ddes_1436	null
8503981	Ddes_1435	null
8503980	Ddes_1434	null
8503979	Ddes_1433	null


# TF - DvMF_1994
8504943	Ddes_2374	null
8504944	Ddes_2375	DvMF_2005


# TF - DVU0151: Ddes_1643
8504195	Ddes_1642	null
8504194	Ddes_1641	null
8504193	Ddes_1640	null


# TF - DVU2894: Ddes_1305
8504850	Ddes_2282	null

8504399	Ddes_1836	null

8504570	Ddes_2004	null
8504569	Ddes_2003	null

8502819	Ddes_0313	null
8502820	Ddes_0314	null

8503847	Ddes_1305	null


# TF - DVU0621: Ddes_0084
8503136	Ddes_0614	null
8503137	Ddes_0615	null
8503138	Ddes_0616	null
8503139	Ddes_0617	null
8503140	Ddes_0618	null
8503141	Ddes_0619	null

8502583	Ddes_0082	nrfH
8502582	Ddes_0081	nrfA


# TF - ZraR: Ddes_0187
8504265	Ddes_1704	LI1080


# TF - RpoN: Ddes_0974
8503336	Ddes_0811	null
8503337	Ddes_0812	null
8503338	Ddes_0813	null
8503339	Ddes_0814	null
8503340	Ddes_0815	null
8503341	Ddes_0816	null
8503342	Ddes_0817	null

8503983	Ddes_1437	null

8502724	Ddes_0220	null
8502725	Ddes_0221	null

8503982	Ddes_1436	null
8503981	Ddes_1435	null
8503980	Ddes_1434	null
8503979	Ddes_1433	null

8504943	Ddes_2374	null
8504944	Ddes_2375	null

8502819	Ddes_0313	null
8502820	Ddes_0314	null

8502817	Ddes_0311	null

8504657	Ddes_2091	flgE

8503763	Ddes_1230	null

8502690	Ddes_0186	zraS
8502691	Ddes_0187	zraR

8502834	Ddes_0327	flhF
8502833	Ddes_0326	fleN
8502832	Ddes_0325	fliA
8502831	Ddes_0324	cheY
8502830	Ddes_0323	fliL
8502829	Ddes_0322	null
8502828	Ddes_0321	null

8502838	Ddes_0331	flhA

8503794	Ddes_1259	fliK

8503795	Ddes_1260	flgD
8503796	Ddes_1261	flgE

8504568	Ddes_2002	DVU0518
8504567	Ddes_2001	flgK
8504566	Ddes_2000	flgL
8504565	Ddes_1999	csrA
8504564	Ddes_1998	fliW

8503274	Ddes_0750	nudF
8503275	Ddes_0751	null
8503276	Ddes_0752	nadE

8502689	Ddes_0185	zraP

8503679	Ddes_1147	amt
8503680	Ddes_1148	glnB
8503681	Ddes_1149	null

8503559	Ddes_1028	fliC

8503291	Ddes_0767	null

8504645	Ddes_2079	mltC

8504195	Ddes_1642	null
8504194	Ddes_1641	null
8504193	Ddes_1640	null
8504192	Ddes_1639	null
8504191	Ddes_1638	null

8502583	Ddes_0082	nrfH
8502582	Ddes_0081	nrfA

8504107	Ddes_1559	null

8504911	Ddes_2343	null
8504912	Ddes_2344	null

8502658	Ddes_0154	null
8502657	Ddes_0153	null
8502656	Ddes_0152	null
8502655	Ddes_0151	null

8504910	Ddes_2342	null

8504914	Ddes_2346	null
8504915	Ddes_2347	null
8504916	Ddes_2348	null
8504917	Ddes_2349	null
8504918	Ddes_2350	null

8504913	Ddes_2345	null

8503219	Ddes_0695	null

8504432	Ddes_1867	DVU2108
8504431	Ddes_1866	null
8504430	Ddes_1865	null
8504429	Ddes_1864	null

8504570	Ddes_2004	flgI
8504569	Ddes_2003	flgJ

8502880	Ddes_0373	fliL
8502881	Ddes_0374	null
8502882	Ddes_0375	fliN
8502883	Ddes_0376	fliO
8502884	Ddes_0377	fliP

8502885	Ddes_0378	fliQ

8502839	Ddes_0332	flhB
8502838	Ddes_0331	flhA

8502697	Ddes_0193	fliR

8502904	Ddes_0391	flgF
8502905	Ddes_0392	flgG
8502906	Ddes_0393	flgA
8502907	Ddes_0394	flgH

8504399	Ddes_1836	fliM

8503222	Ddes_0698	fliJ
8503221	Ddes_0697	flbB
8503220	Ddes_0696	truA

8504121	Ddes_1573	fliF
8504119	Ddes_1571	fliG
8504118	Ddes_1570	fliH
8504117	Ddes_1569	fliI

8504124	Ddes_1576	flgB
8504123	Ddes_1575	flgC
8504122	Ddes_1574	fliE

8503287	Ddes_0763	null

8503047	Ddes_0530	fliD
8503046	Ddes_0529	fliS

8503118	Ddes_0596	null

8504850	Ddes_2282	flaB3


# TF - DVU1063: Ddes_2381
8503559	Ddes_1028	null

8504107	Ddes_1559	null

8504657	Ddes_2091	flgE

8503287	Ddes_0763	null

8503795	Ddes_1260	flgD
8503796	Ddes_1261	flgE

8503794	Ddes_1259	fliK

8504568	Ddes_2002	null
8504567	Ddes_2001	flgK
8504566	Ddes_2000	flgL
8504565	Ddes_1999	csrA
8504564	Ddes_1998	fliW

8503047	Ddes_0530	fliD
8503046	Ddes_0529	fliS


# TF - PdxQ: Ddes_1162
8503695	Ddes_1163	pdxO