# TF - TrpR: VS_0553
5238940	VS_1966	trpE
5238941	VS_1967	trpD_a
5238942	VS_1968	trpD_b
5238943	VS_1969	trpC
5238944	VS_1970	trpB
5238945	VS_1971	trpA

5237688	VS_0706	COG0733


# TF - FabR: VS_0065
5236626	VS_II1142	COG2030

5237617	VS_0635	plsC

5237839	VS_0860	fadL

5238407	VS_1429	fabA

5240068	VS_3133	hyIII

5237377	VS_0387	lcfH


# TF - NsrR: VS_0945
5237923	VS_0945	nsrR
5237924	VS_0946	nnrS


# TF - BirA: VS_2979
5239015	VS_2041	bioA

5239014	VS_2040	bioB
5239013	VS_2039	bioF
5239012	VS_2038	bioC
5239011	VS_2037	bioD


# TF - HexR: VS_1834
5237234	VS_0235	gpmM

5239847	VS_2890	ppc

5236155	VS_II0668	nirB
5236156	VS_II0669	nirD

5237131	VS_0131	pckA

5238108	VS_1130	ygaW

5239389	VS_2422	pepD

5237464	VS_0474	gltB
5237463	VS_0473	gltD

5238060	VS_1082	glgC
5238061	VS_1083	glgA

5237285	VS_0288	pgi

5237488	VS_0498	grcA

5238010	VS_1032	ptsG

5239869	VS_2912	tpiA


# TF - ArgR: VS_0357
5239881	VS_2924	arcA
5239882	VS_2925	arcC
5239883	VS_2926	arcB

5239698	VS_2739	argF

5239842	VS_2885	argH

5239845	VS_2888	argC
5239844	VS_2887	argB
5239843	VS_2886	argG

5239846	VS_2889	argE

5239818	VS_2861	argD
5239817	VS_2860	astA
5239816	VS_2859	astD

5237660	VS_0678	argA

5237451	VS_0461	carA
5237452	VS_0462	carB


# TF - NrdR: VS_2414
5236197	VS_II0710	nrdD
5236199	VS_II0712	nrdG

5238914	VS_1939	nrdA
5238915	VS_1940	nrdB
5238916	VS_1941	yfaE


# TF - Zur: VS_0290
5239333	VS_2366	rpmE2

5238899	VS_1924	ribA

5239207	VS_2237	znuA

5239737	VS_2780	VC2551
5239738	VS_2781	zbp

5239208	VS_2238	znuC
5239209	VS_2239	znuB

5239738	VS_2781	zbp
5239739	VS_2782	VV1_0719
5239740	VS_2783	VC2554
5239741	VS_2784	VC2555


# TF - PdhR: VS_2543
5239510	VS_2543	pdhR
5239509	VS_2542	aceE
5239508	VS_2541	aceF
5239507	VS_2540	lpdA


# TF - FadR: VS_1007
5237843	VS_0864	fadI
5237844	VS_0865	fadJ

5237840	VS_0861	fadL

5237916	VS_0938	fadH

5239290	VS_2322	fadE2

5239958	VS_3009	plsB

5237049	VS_0041	fadB
5237048	VS_0040	fadA

5238407	VS_1429	fabA


# TF - NorR
5235643	VS_II0152	fpr
5235642	VS_II0151	tehB

5239393	VS_2426	nnrS

5236052	VS_II0564	hmp

5236051	VS_II0563	norR2

5236916	VS_II1439	norV
5236917	VS_II1440	norW


# TF - PrpR: VS_1342
5238320	VS_1342	prpR
5238321	VS_1343	prpB
5238322	VS_1344	prpC
5238323	VS_1345	acnD
5238324	VS_1346	prpF
5238325	VS_1347	prpE


# TF - HutC: VS_1220
5238197	VS_1219	hutI
5238196	VS_1218	hutG2
5238195	VS_1217	hutU
5238194	VS_1216	hutH
5238193	VS_1215	hutH2

5238198	VS_1220	hutC


# TF - IscR: VS_0606
5237588	VS_0606	iscR
5237589	VS_0607	iscS
5237590	VS_0608	iscU
5237591	VS_0609	iscA
5237592	VS_0610	hscB
5237593	VS_0611	hscA
5237594	VS_0612	fdx
5237595	VS_0613	yfhJ

5239468	VS_2501	erpA


# TF - NagC: VS_2262
5238805	VS_1829	tfoX1

5235836	VS_II0346	gapB

5237936	VS_0958	adh

5239158	VS_2186	nagE2

5239229	VS_2260	nagE1

5237746	VS_0765	hex

5238010	VS_1032	ptsG

5239575	VS_2609	pyrG
5239574	VS_2607	eno

5238705	VS_1728	mcp2

5239669	VS_2703	mcp

5238065	VS_1087	tfoX

5239259	VS_2290	ptsH
5239260	VS_2291	ptsI
5239261	VS_2292	crr

5239254	VS_2285	chiP

5236891	VS_II1414	chiA

5239612	VS_2646	pgk
5239611	VS_2645	fbaA

5239614	VS_2648	epd

5236912	VS_II1435	nagB

5239230	VS_2261	nagA
5239231	VS_2262	nagC


# TF - NtrC: VS_0118
5238459	VS_1481	amtB2

5237119	VS_0119	ntrB
5237118	VS_0118	ntrC

5239487	VS_2520	glnK
5239486	VS_2519	amtB

5237121	VS_0121	glnA


# TF - Fur: VS_2258
5237917	VS_0939	COG0778

5235780	VS_II0290	hutW
5235781	VS_II0291	huvX
5235782	VS_II0292	hutZ

5238876	VS_1901	iscA
5238877	VS_1902	sufB
5238878	VS_1903	sufC
5238879	VS_1904	sufD
5238880	VS_1905	sufS
5238881	VS_1906	sufE

5236172	VS_II0685	PF03929
5236173	VS_II0686	PF10029
5236174	VS_II0687	cbiM
5236175	VS_II0688	VIBHAR_06747
5236176	VS_II0689	VIBHAR_06746
5236177	VS_II0690	PF01297
5236178	VS_II0691	COG1121
5236179	VS_II0692	COG1108
5236180	VS_II0693	COG0803

5240042	VS_3101	COG2132

5238908	VS_1933	nrfA

5237920	VS_0942	PF00106

5239875	VS_2918	sodA

5237947	VS_0969	PF10952

5239085	VS_2112	fhuC
5239086	VS_2113	fhuD
5239087	VS_2114	fhuB

5236853	VS_II1376	VV20793
5236854	VS_II1377	VV20794

5235854	VS_II0364	VCA1041

5235779	VS_II0289	tonB-hmu
5235778	VS_II0288	exbB-hmu
5235777	VS_II0287	exbD-hmu
5235776	VS_II0286	hmuT
5235775	VS_II0285	hmuU
5235774	VS_II0284	hmuV

5235988	VS_II0500	VV21338

5238976	VS_2002	PF11449

5236036	VS_II0548	VCA0743

5239084	VS_2111	PF07690

5236148	VS_II0661	azu1

5239204	VS_2234	feoA
5239203	VS_2233	feoB
5239202	VS_2232	feoC

5235989	VS_II0501	fhuA
5235990	VS_II0502	fhuD
5235991	VS_II0503	fhuB

5236612	VS_II1128	fepA

5239485	VS_2518	fbpA

5236165	VS_II0678	PF11932
5236166	VS_II0679	exbB1
5236167	VS_II0680	exbB2
5236168	VS_II0681	exbD2
5236169	VS_II0682	tonB
5236170	VS_II0683	VC1543

5238898	VS_1923	irpA

5238907	VS_1932	nrfB
5238906	VS_1931	nfrC
5238905	VS_1930	nrfD

5238975	VS_2001	ppaC

5237004	VS_II1528	VV21178
5237005	VS_II1529	VV21177
5237006	VS_II1530	VCA0003

5239334	VS_2367	null

5235901	VS_II0412	viuB

5236555	VS_II1071	vctP
5236554	VS_II1070	vctD
5236552	VS_II1068	vctB
5236551	VS_II1067	vctC

5237088	VS_0088	VC0074

5239089	VS_2116	iutA

5235901	VS_II0412	VIBHAR_06920

5238392	VS_1414	VV1_2646
5238391	VS_1413	pqiA
5238390	VS_1412	pqiB

5239892	VS_2936	VC1572
5239893	VS_2937	fumC

5236164	VS_II0677	fhuE

5239362	VS_2395	COG4771

5236613	VS_II1129	VPA1658
5236614	VS_II1130	VPA1659
5236615	VS_II1131	VPA1660
5236616	VS_II1132	VPA1661
5236617	VS_II1133	VPA1662

5238101	VS_1123	viuP
5238102	VS_1124	viuD
5238103	VS_1125	viuG

5236016	VS_II0528	null

5238610	VS_1633	VSAK1_18187

5239954	VS_3005	COG3315


# TF - FruR: VS_II1031
5236515	VS_II1031	fruR

5236516	VS_II1032	fruB
5236517	VS_II1033	fruK
5236518	VS_II1034	fruA


# TF - PurR: VS_1088
5237611	VS_0629	guaA

5238183	VS_1205	purC

5240056	VS_3120	purE
5240057	VS_3121	purK

5239286	VS_2318	purM
5239287	VS_2319	purN

5239008	VS_2034	purB

5236295	VS_II0809	fhs

5239004	VS_2030	gsk

5239907	VS_2951	purH
5239908	VS_2952	purD

5237738	VS_0757	ushA

5237646	VS_0664	purL

5238694	VS_1717	purT

5238400	VS_1422	pyrD

5239285	VS_2317	upp

5237868	VS_0889	folD

5237886	VS_0907	cvpA
5237887	VS_0908	purF

5239340	VS_2373	glyA


# TF - RbsR: VS_II0945
5236424	VS_II0940	rbsD
5236425	VS_II0941	rbsA
5236426	VS_II0942	rbsC
5236427	VS_II0943	rbsB
5236428	VS_II0944	rbsK
5236429	VS_II0945	rbsR


# TF - LexA: VS_3006
5237652	VS_0670	yebG

5237918	VS_0940	topB

5239563	VS_2596	recA

5239955	VS_3006	lexA

5237628	VS_0646	recN

5238184	VS_1206	VC1191

5237958	VS_0980	uvrB

5238020	VS_1042	imuA
5238019	VS_1041	imuB
5238018	VS_1040	dnaE2

5238865	VS_1890	intIA

5237158	VS_0158	recG

5237511	VS_0522	mutH

5237684	VS_0702	dinB

5237097	VS_0097	rmuC

5238085	VS_1107	ruvA
5238086	VS_1108	ruvB

5237310	VS_0320	uvrA

5240025	VS_3084	uvrD


# TF - PsrA: VS_1841
5237916	VS_0938	fadH

5237049	VS_0041	fadB
5237048	VS_0040	fadA

5237843	VS_0864	fadI
5237844	VS_0865	fadJ

5238816	VS_1841	psrA
5238815	VS_1840	fadE

5239190	VS_2220	fadD


# TF - PhnR: VS_II0403
5235887	VS_II0398	phnW
5235886	VS_II0397	COG0160
5235885	VS_II0396	phnX

5235890	VS_II0401	phnT
5235891	VS_II0402	phnU
5235892	VS_II0403	phnR
5235893	VS_II0404	VCA0599

5235888	VS_II0399	phnS
5235889	VS_II0400	null


# RNA - MOCO_RNA_motif
5237963	VS_0985	moaA
5237964	VS_0986	null
5237965	VS_0987	moaC
5237966	VS_0988	moaD
5237967	VS_0989	null


# RNA - FMN
5236741	VS_II1263	ribB


# RNA - Trp_leader
5238940	VS_1966	trpE
5238941	VS_1967	trpG
5238942	VS_1968	trpD
5238943	VS_1969	trpC
5238944	VS_1970	trpB
5238945	VS_1971	trpA


# RNA - yybP-ykoY
5237043	VS_0035	COG2119

5236265	VS_II0779	ykoY


# RNA - Purine
5237162	VS_0162	pbuG


# RNA - L10_leader
5239921	VS_2965	rplJ
5239920	VS_2964	rplL


# RNA - Lysine
5237306	VS_0316	lysC

5239001	VS_2027	lysW


# RNA - Leu_leader
5237370	VS_0380	leuA
5237369	VS_0379	leuB
5237368	VS_0378	leuC
5237367	VS_0377	leuD


# RNA - TPP
5240039	VS_3098	thiC
5240038	VS_3097	thiE
5240037	VS_3096	thiF
5240036	VS_3095	thiS
5240035	VS_3094	thiG
5240034	VS_3093	thiH

5236574	VS_II1090	thiD
5236573	VS_II1089	thiZ
5236572	VS_II1088	thiX
5236571	VS_II1087	thiY
5236570	VS_II1086	tenA
5236569	VS_II1085	thiM

5239726	VS_2767	thiB
5239725	VS_2766	thiP
5239724	VS_2765	thiQ


# RNA - GEMM_RNA_motif
5238065	VS_1087	tfoX


# RNA - S15
5239446	VS_2479	rpsO


# RNA - Glycine
5238269	VS_1291	glyP


# RNA - Thr_leader
5237473	VS_0483	thrA
5237474	VS_0484	thrB
5237475	VS_0485	thrC


# RNA - Cobalamin
5239627	VS_2661	cbiD
5239628	VS_2662	cbiC
5239629	VS_2663	cbiET
5239630	VS_2664	cbiL
5239631	VS_2665	cbiG
5239632	VS_2666	cbiK
5239633	VS_2667	cbiH
5239634	VS_2668	cbiF
5239635	VS_2669	cbiB
5239636	VS_2670	cobD
5239637	VS_2671	cbiA

5239947	VS_2998	btuB
5239946	VS_2997	COG2102
5239945	VS_2996	COG0796


# RNA - His_leader
5239000	VS_2026	hisG
5238999	VS_2025	hisD
5238998	VS_2024	hisC
5238997	VS_2023	hisB
5238996	VS_2022	hisH
5238995	VS_2021	hisA
5238994	VS_2020	hisF
5238993	VS_2019	hisI


# TF - NarP: VS_II0602
5236155	VS_II0668	nirB
5236156	VS_II0669	nirD
5236157	VS_II0670	nirC
5236158	VS_II0671	cysG

5238979	VS_2005	torE
5238978	VS_2004	torC
5238977	VS_2003	torA

5235934	VS_II0445	adhB

5237247	VS_0248	frdA
5237246	VS_0247	frdB
5237245	VS_0246	frdC
5237244	VS_0245	frdD

5236510	VS_II1026	nirB3

5236088	VS_II0600	napF
5236087	VS_II0599	napD
5236086	VS_II0598	napA
5236085	VS_II0597	napB
5236084	VS_II0596	napC

5237936	VS_0958	adhE

5238907	VS_1932	nrfB
5238906	VS_1931	nfrC
5238905	VS_1930	nrfD
5238904	VS_1929	VS_1929
5238903	VS_1928	nrfE
5238902	VS_1927	nrfX
5238901	VS_1926	nrfF

5238030	VS_1052	pflB

5238908	VS_1933	nrfA

5236089	VS_II0601	narQ
5236090	VS_II0602	narP

5236511	VS_II1027	nirB2
5236512	VS_II1028	nirD2
5236513	VS_II1029	narK2


# TF - GntR: VS_II0411
5235894	VS_II0405	gntX
5235895	VS_II0406	gntY
5235896	VS_II0407	gntZ
5235897	VS_II0408	gntK2
5235898	VS_II0409	gnd

5235900	VS_II0411	gntR


# TF - SoxR: VS_2133
5236601	VS_II1117	PF00903


# TF - ZntR: VS_2950
5239057	VS_2083	zntA


# TF - CueR: VS_2283
5236001	VS_II0513	VCA0262
5236002	VS_II0514	cusC
5236003	VS_II0515	cusB
5236004	VS_II0516	cusA
5236005	VS_II0517	cusF


# TF - BglR: VS_II1392
5236870	VS_II1393	bglP

5236869	VS_II1392	bglR
5236868	VS_II1391	bglE
5236867	VS_II1390	bglF
5236866	VS_II1389	bglG
5236865	VS_II1388	bglB
5236864	VS_II1387	bglK
5236863	VS_II1386	VS_II1386


# TF - TreR: VS_2379
5239345	VS_2378	treB
5239344	VS_2377	treC


# TF - VIBHAR_07005: VS_II1187
5236671	VS_II1187	VIBHAR_07005
5236672	VS_II1188	XAC1547
5236673	VS_II1189	XAC1546


# TF - MetJ: VS_2895
5238122	VS_1144	metR

5236686	VS_II1202	metT

5239851	VS_2894	metB
5239850	VS_2893	metL

5239349	VS_2382	metN
5239350	VS_2383	metI
5239351	VS_2384	metQ

5238654	VS_1677	metA

5239621	VS_2655	metK

5235680	VS_II0189	mtsA
5235679	VS_II0188	mtsB
5235678	VS_II0187	mtsC

5239947	VS_2998	btuB

5237305	VS_0315	metH

5239852	VS_2895	metJ

5238123	VS_1145	metE


# TF - MetR: VS_1144
5239340	VS_2373	glyA

5238122	VS_1144	metR

5238123	VS_1145	metE

5238261	VS_1283	PF08908
5238260	VS_1282	metE2


# TF - TyrR: VS_1793
5236288	VS_II0802	tyrP

5237536	VS_0547	aroF
5237537	VS_0548	tyrA

5236986	VS_II1510	acsA

5236985	VS_II1509	phhA
5236984	VS_II1508	phhB

5236997	VS_II1521	hpd
5236996	VS_II1520	hmgA
5236995	VS_II1519	hmgC
5236994	VS_II1518	hmgB

5238954	VS_1980	COG0733

5235876	VS_II0387	aroG

5238769	VS_1793	tyrR


# TF - YdcR: VS_1691, VS_1814
5238789	VS_1813	null

5240073	VS_3138	COG0348

5238667	VS_1690	PF01654
5238666	VS_1689	PF02322


# TF - VEA_000881: VS_II1306
5236783	VS_II1305	PF00892


# TF - VV21354: VS_1723
5238699	VS_1722	PF00892


# TF - PdxW: VS_II0337
5235826	VS_II0336	pdxO