# TF - TrpR: VS_0553 5238940 VS_1966 trpE 5238941 VS_1967 trpD_a 5238942 VS_1968 trpD_b 5238943 VS_1969 trpC 5238944 VS_1970 trpB 5238945 VS_1971 trpA 5237688 VS_0706 COG0733 # TF - FabR: VS_0065 5236626 VS_II1142 COG2030 5237617 VS_0635 plsC 5237839 VS_0860 fadL 5238407 VS_1429 fabA 5240068 VS_3133 hyIII 5237377 VS_0387 lcfH # TF - NsrR: VS_0945 5237923 VS_0945 nsrR 5237924 VS_0946 nnrS # TF - BirA: VS_2979 5239015 VS_2041 bioA 5239014 VS_2040 bioB 5239013 VS_2039 bioF 5239012 VS_2038 bioC 5239011 VS_2037 bioD # TF - HexR: VS_1834 5237234 VS_0235 gpmM 5239847 VS_2890 ppc 5236155 VS_II0668 nirB 5236156 VS_II0669 nirD 5237131 VS_0131 pckA 5238108 VS_1130 ygaW 5239389 VS_2422 pepD 5237464 VS_0474 gltB 5237463 VS_0473 gltD 5238060 VS_1082 glgC 5238061 VS_1083 glgA 5237285 VS_0288 pgi 5237488 VS_0498 grcA 5238010 VS_1032 ptsG 5239869 VS_2912 tpiA # TF - ArgR: VS_0357 5239881 VS_2924 arcA 5239882 VS_2925 arcC 5239883 VS_2926 arcB 5239698 VS_2739 argF 5239842 VS_2885 argH 5239845 VS_2888 argC 5239844 VS_2887 argB 5239843 VS_2886 argG 5239846 VS_2889 argE 5239818 VS_2861 argD 5239817 VS_2860 astA 5239816 VS_2859 astD 5237660 VS_0678 argA 5237451 VS_0461 carA 5237452 VS_0462 carB # TF - NrdR: VS_2414 5236197 VS_II0710 nrdD 5236199 VS_II0712 nrdG 5238914 VS_1939 nrdA 5238915 VS_1940 nrdB 5238916 VS_1941 yfaE # TF - Zur: VS_0290 5239333 VS_2366 rpmE2 5238899 VS_1924 ribA 5239207 VS_2237 znuA 5239737 VS_2780 VC2551 5239738 VS_2781 zbp 5239208 VS_2238 znuC 5239209 VS_2239 znuB 5239738 VS_2781 zbp 5239739 VS_2782 VV1_0719 5239740 VS_2783 VC2554 5239741 VS_2784 VC2555 # TF - PdhR: VS_2543 5239510 VS_2543 pdhR 5239509 VS_2542 aceE 5239508 VS_2541 aceF 5239507 VS_2540 lpdA # TF - FadR: VS_1007 5237843 VS_0864 fadI 5237844 VS_0865 fadJ 5237840 VS_0861 fadL 5237916 VS_0938 fadH 5239290 VS_2322 fadE2 5239958 VS_3009 plsB 5237049 VS_0041 fadB 5237048 VS_0040 fadA 5238407 VS_1429 fabA # TF - NorR 5235643 VS_II0152 fpr 5235642 VS_II0151 tehB 5239393 VS_2426 nnrS 5236052 VS_II0564 hmp 5236051 VS_II0563 norR2 5236916 VS_II1439 norV 5236917 VS_II1440 norW # TF - PrpR: VS_1342 5238320 VS_1342 prpR 5238321 VS_1343 prpB 5238322 VS_1344 prpC 5238323 VS_1345 acnD 5238324 VS_1346 prpF 5238325 VS_1347 prpE # TF - HutC: VS_1220 5238197 VS_1219 hutI 5238196 VS_1218 hutG2 5238195 VS_1217 hutU 5238194 VS_1216 hutH 5238193 VS_1215 hutH2 5238198 VS_1220 hutC # TF - IscR: VS_0606 5237588 VS_0606 iscR 5237589 VS_0607 iscS 5237590 VS_0608 iscU 5237591 VS_0609 iscA 5237592 VS_0610 hscB 5237593 VS_0611 hscA 5237594 VS_0612 fdx 5237595 VS_0613 yfhJ 5239468 VS_2501 erpA # TF - NagC: VS_2262 5238805 VS_1829 tfoX1 5235836 VS_II0346 gapB 5237936 VS_0958 adh 5239158 VS_2186 nagE2 5239229 VS_2260 nagE1 5237746 VS_0765 hex 5238010 VS_1032 ptsG 5239575 VS_2609 pyrG 5239574 VS_2607 eno 5238705 VS_1728 mcp2 5239669 VS_2703 mcp 5238065 VS_1087 tfoX 5239259 VS_2290 ptsH 5239260 VS_2291 ptsI 5239261 VS_2292 crr 5239254 VS_2285 chiP 5236891 VS_II1414 chiA 5239612 VS_2646 pgk 5239611 VS_2645 fbaA 5239614 VS_2648 epd 5236912 VS_II1435 nagB 5239230 VS_2261 nagA 5239231 VS_2262 nagC # TF - NtrC: VS_0118 5238459 VS_1481 amtB2 5237119 VS_0119 ntrB 5237118 VS_0118 ntrC 5239487 VS_2520 glnK 5239486 VS_2519 amtB 5237121 VS_0121 glnA # TF - Fur: VS_2258 5237917 VS_0939 COG0778 5235780 VS_II0290 hutW 5235781 VS_II0291 huvX 5235782 VS_II0292 hutZ 5238876 VS_1901 iscA 5238877 VS_1902 sufB 5238878 VS_1903 sufC 5238879 VS_1904 sufD 5238880 VS_1905 sufS 5238881 VS_1906 sufE 5236172 VS_II0685 PF03929 5236173 VS_II0686 PF10029 5236174 VS_II0687 cbiM 5236175 VS_II0688 VIBHAR_06747 5236176 VS_II0689 VIBHAR_06746 5236177 VS_II0690 PF01297 5236178 VS_II0691 COG1121 5236179 VS_II0692 COG1108 5236180 VS_II0693 COG0803 5240042 VS_3101 COG2132 5238908 VS_1933 nrfA 5237920 VS_0942 PF00106 5239875 VS_2918 sodA 5237947 VS_0969 PF10952 5239085 VS_2112 fhuC 5239086 VS_2113 fhuD 5239087 VS_2114 fhuB 5236853 VS_II1376 VV20793 5236854 VS_II1377 VV20794 5235854 VS_II0364 VCA1041 5235779 VS_II0289 tonB-hmu 5235778 VS_II0288 exbB-hmu 5235777 VS_II0287 exbD-hmu 5235776 VS_II0286 hmuT 5235775 VS_II0285 hmuU 5235774 VS_II0284 hmuV 5235988 VS_II0500 VV21338 5238976 VS_2002 PF11449 5236036 VS_II0548 VCA0743 5239084 VS_2111 PF07690 5236148 VS_II0661 azu1 5239204 VS_2234 feoA 5239203 VS_2233 feoB 5239202 VS_2232 feoC 5235989 VS_II0501 fhuA 5235990 VS_II0502 fhuD 5235991 VS_II0503 fhuB 5236612 VS_II1128 fepA 5239485 VS_2518 fbpA 5236165 VS_II0678 PF11932 5236166 VS_II0679 exbB1 5236167 VS_II0680 exbB2 5236168 VS_II0681 exbD2 5236169 VS_II0682 tonB 5236170 VS_II0683 VC1543 5238898 VS_1923 irpA 5238907 VS_1932 nrfB 5238906 VS_1931 nfrC 5238905 VS_1930 nrfD 5238975 VS_2001 ppaC 5237004 VS_II1528 VV21178 5237005 VS_II1529 VV21177 5237006 VS_II1530 VCA0003 5239334 VS_2367 null 5235901 VS_II0412 viuB 5236555 VS_II1071 vctP 5236554 VS_II1070 vctD 5236552 VS_II1068 vctB 5236551 VS_II1067 vctC 5237088 VS_0088 VC0074 5239089 VS_2116 iutA 5235901 VS_II0412 VIBHAR_06920 5238392 VS_1414 VV1_2646 5238391 VS_1413 pqiA 5238390 VS_1412 pqiB 5239892 VS_2936 VC1572 5239893 VS_2937 fumC 5236164 VS_II0677 fhuE 5239362 VS_2395 COG4771 5236613 VS_II1129 VPA1658 5236614 VS_II1130 VPA1659 5236615 VS_II1131 VPA1660 5236616 VS_II1132 VPA1661 5236617 VS_II1133 VPA1662 5238101 VS_1123 viuP 5238102 VS_1124 viuD 5238103 VS_1125 viuG 5236016 VS_II0528 null 5238610 VS_1633 VSAK1_18187 5239954 VS_3005 COG3315 # TF - FruR: VS_II1031 5236515 VS_II1031 fruR 5236516 VS_II1032 fruB 5236517 VS_II1033 fruK 5236518 VS_II1034 fruA # TF - PurR: VS_1088 5237611 VS_0629 guaA 5238183 VS_1205 purC 5240056 VS_3120 purE 5240057 VS_3121 purK 5239286 VS_2318 purM 5239287 VS_2319 purN 5239008 VS_2034 purB 5236295 VS_II0809 fhs 5239004 VS_2030 gsk 5239907 VS_2951 purH 5239908 VS_2952 purD 5237738 VS_0757 ushA 5237646 VS_0664 purL 5238694 VS_1717 purT 5238400 VS_1422 pyrD 5239285 VS_2317 upp 5237868 VS_0889 folD 5237886 VS_0907 cvpA 5237887 VS_0908 purF 5239340 VS_2373 glyA # TF - RbsR: VS_II0945 5236424 VS_II0940 rbsD 5236425 VS_II0941 rbsA 5236426 VS_II0942 rbsC 5236427 VS_II0943 rbsB 5236428 VS_II0944 rbsK 5236429 VS_II0945 rbsR # TF - LexA: VS_3006 5237652 VS_0670 yebG 5237918 VS_0940 topB 5239563 VS_2596 recA 5239955 VS_3006 lexA 5237628 VS_0646 recN 5238184 VS_1206 VC1191 5237958 VS_0980 uvrB 5238020 VS_1042 imuA 5238019 VS_1041 imuB 5238018 VS_1040 dnaE2 5238865 VS_1890 intIA 5237158 VS_0158 recG 5237511 VS_0522 mutH 5237684 VS_0702 dinB 5237097 VS_0097 rmuC 5238085 VS_1107 ruvA 5238086 VS_1108 ruvB 5237310 VS_0320 uvrA 5240025 VS_3084 uvrD # TF - PsrA: VS_1841 5237916 VS_0938 fadH 5237049 VS_0041 fadB 5237048 VS_0040 fadA 5237843 VS_0864 fadI 5237844 VS_0865 fadJ 5238816 VS_1841 psrA 5238815 VS_1840 fadE 5239190 VS_2220 fadD # TF - PhnR: VS_II0403 5235887 VS_II0398 phnW 5235886 VS_II0397 COG0160 5235885 VS_II0396 phnX 5235890 VS_II0401 phnT 5235891 VS_II0402 phnU 5235892 VS_II0403 phnR 5235893 VS_II0404 VCA0599 5235888 VS_II0399 phnS 5235889 VS_II0400 null # RNA - MOCO_RNA_motif 5237963 VS_0985 moaA 5237964 VS_0986 null 5237965 VS_0987 moaC 5237966 VS_0988 moaD 5237967 VS_0989 null # RNA - FMN 5236741 VS_II1263 ribB # RNA - Trp_leader 5238940 VS_1966 trpE 5238941 VS_1967 trpG 5238942 VS_1968 trpD 5238943 VS_1969 trpC 5238944 VS_1970 trpB 5238945 VS_1971 trpA # RNA - yybP-ykoY 5237043 VS_0035 COG2119 5236265 VS_II0779 ykoY # RNA - Purine 5237162 VS_0162 pbuG # RNA - L10_leader 5239921 VS_2965 rplJ 5239920 VS_2964 rplL # RNA - Lysine 5237306 VS_0316 lysC 5239001 VS_2027 lysW # RNA - Leu_leader 5237370 VS_0380 leuA 5237369 VS_0379 leuB 5237368 VS_0378 leuC 5237367 VS_0377 leuD # RNA - TPP 5240039 VS_3098 thiC 5240038 VS_3097 thiE 5240037 VS_3096 thiF 5240036 VS_3095 thiS 5240035 VS_3094 thiG 5240034 VS_3093 thiH 5236574 VS_II1090 thiD 5236573 VS_II1089 thiZ 5236572 VS_II1088 thiX 5236571 VS_II1087 thiY 5236570 VS_II1086 tenA 5236569 VS_II1085 thiM 5239726 VS_2767 thiB 5239725 VS_2766 thiP 5239724 VS_2765 thiQ # RNA - GEMM_RNA_motif 5238065 VS_1087 tfoX # RNA - S15 5239446 VS_2479 rpsO # RNA - Glycine 5238269 VS_1291 glyP # RNA - Thr_leader 5237473 VS_0483 thrA 5237474 VS_0484 thrB 5237475 VS_0485 thrC # RNA - Cobalamin 5239627 VS_2661 cbiD 5239628 VS_2662 cbiC 5239629 VS_2663 cbiET 5239630 VS_2664 cbiL 5239631 VS_2665 cbiG 5239632 VS_2666 cbiK 5239633 VS_2667 cbiH 5239634 VS_2668 cbiF 5239635 VS_2669 cbiB 5239636 VS_2670 cobD 5239637 VS_2671 cbiA 5239947 VS_2998 btuB 5239946 VS_2997 COG2102 5239945 VS_2996 COG0796 # RNA - His_leader 5239000 VS_2026 hisG 5238999 VS_2025 hisD 5238998 VS_2024 hisC 5238997 VS_2023 hisB 5238996 VS_2022 hisH 5238995 VS_2021 hisA 5238994 VS_2020 hisF 5238993 VS_2019 hisI # TF - NarP: VS_II0602 5236155 VS_II0668 nirB 5236156 VS_II0669 nirD 5236157 VS_II0670 nirC 5236158 VS_II0671 cysG 5238979 VS_2005 torE 5238978 VS_2004 torC 5238977 VS_2003 torA 5235934 VS_II0445 adhB 5237247 VS_0248 frdA 5237246 VS_0247 frdB 5237245 VS_0246 frdC 5237244 VS_0245 frdD 5236510 VS_II1026 nirB3 5236088 VS_II0600 napF 5236087 VS_II0599 napD 5236086 VS_II0598 napA 5236085 VS_II0597 napB 5236084 VS_II0596 napC 5237936 VS_0958 adhE 5238907 VS_1932 nrfB 5238906 VS_1931 nfrC 5238905 VS_1930 nrfD 5238904 VS_1929 VS_1929 5238903 VS_1928 nrfE 5238902 VS_1927 nrfX 5238901 VS_1926 nrfF 5238030 VS_1052 pflB 5238908 VS_1933 nrfA 5236089 VS_II0601 narQ 5236090 VS_II0602 narP 5236511 VS_II1027 nirB2 5236512 VS_II1028 nirD2 5236513 VS_II1029 narK2 # TF - GntR: VS_II0411 5235894 VS_II0405 gntX 5235895 VS_II0406 gntY 5235896 VS_II0407 gntZ 5235897 VS_II0408 gntK2 5235898 VS_II0409 gnd 5235900 VS_II0411 gntR # TF - SoxR: VS_2133 5236601 VS_II1117 PF00903 # TF - ZntR: VS_2950 5239057 VS_2083 zntA # TF - CueR: VS_2283 5236001 VS_II0513 VCA0262 5236002 VS_II0514 cusC 5236003 VS_II0515 cusB 5236004 VS_II0516 cusA 5236005 VS_II0517 cusF # TF - BglR: VS_II1392 5236870 VS_II1393 bglP 5236869 VS_II1392 bglR 5236868 VS_II1391 bglE 5236867 VS_II1390 bglF 5236866 VS_II1389 bglG 5236865 VS_II1388 bglB 5236864 VS_II1387 bglK 5236863 VS_II1386 VS_II1386 # TF - TreR: VS_2379 5239345 VS_2378 treB 5239344 VS_2377 treC # TF - VIBHAR_07005: VS_II1187 5236671 VS_II1187 VIBHAR_07005 5236672 VS_II1188 XAC1547 5236673 VS_II1189 XAC1546 # TF - MetJ: VS_2895 5238122 VS_1144 metR 5236686 VS_II1202 metT 5239851 VS_2894 metB 5239850 VS_2893 metL 5239349 VS_2382 metN 5239350 VS_2383 metI 5239351 VS_2384 metQ 5238654 VS_1677 metA 5239621 VS_2655 metK 5235680 VS_II0189 mtsA 5235679 VS_II0188 mtsB 5235678 VS_II0187 mtsC 5239947 VS_2998 btuB 5237305 VS_0315 metH 5239852 VS_2895 metJ 5238123 VS_1145 metE # TF - MetR: VS_1144 5239340 VS_2373 glyA 5238122 VS_1144 metR 5238123 VS_1145 metE 5238261 VS_1283 PF08908 5238260 VS_1282 metE2 # TF - TyrR: VS_1793 5236288 VS_II0802 tyrP 5237536 VS_0547 aroF 5237537 VS_0548 tyrA 5236986 VS_II1510 acsA 5236985 VS_II1509 phhA 5236984 VS_II1508 phhB 5236997 VS_II1521 hpd 5236996 VS_II1520 hmgA 5236995 VS_II1519 hmgC 5236994 VS_II1518 hmgB 5238954 VS_1980 COG0733 5235876 VS_II0387 aroG 5238769 VS_1793 tyrR # TF - YdcR: VS_1691, VS_1814 5238789 VS_1813 null 5240073 VS_3138 COG0348 5238667 VS_1690 PF01654 5238666 VS_1689 PF02322 # TF - VEA_000881: VS_II1306 5236783 VS_II1305 PF00892 # TF - VV21354: VS_1723 5238699 VS_1722 PF00892 # TF - PdxW: VS_II0337 5235826 VS_II0336 pdxO