# TF - NagR: CJA_1165
5708228	CJA_0287	hex

5710125	CJA_2191	cbp

5709097	CJA_1157	omp_nag
5709098	CJA_1159	trpX

5711005	CJA_3072	omp_nag

5709009	CJA_1069	omp_nag
5709010	CJA_1070	trpX

5709100	CJA_1160	nagK
5709101	CJA_1161	nagP
5709102	CJA_1162	nagX
5709103	CJA_1163	nagA
5709104	CJA_1164	nagB

5708928	CJA_0988	chiD


# TF - NsrR: CJA_1549
5709483	CJA_1547	DUF454
5709484	CJA_1548	nnrS
5709485	CJA_1549	nsrR

5709482	CJA_1546	norB


# TF - BirA: CJA_0677
5708367	CJA_0426	bioB
5708368	CJA_0427	bioF
5708369	CJA_0428	bioHC
5708370	CJA_0429	bioD

5708366	CJA_0425	COG1040


# TF - NrdR: CJA_2699
5709505	CJA_1569	nrdA
5709504	CJA_1568	nrdB


# TF - SahR: CJA_0208
5710475	CJA_2542	metH

5708149	CJA_0208	sahR
5708148	CJA_0207	metK
5708147	CJA_0206	ahcY
5708146	CJA_0205	metF


# TF - Zur: CJA_3482
5711414	CJA_3480	znuA

5711415	CJA_3482	zur
5711416	CJA_3483	znuC
5711417	CJA_3484	znuB

5711398	CJA_3465	yciC


# TF - IscR: CJA_1465
5710776	CJA_2843	ydhD

5708829	CJA_0888	erpA

5710474	CJA_2541	nfuA

5709401	CJA_1465	iscR
5709402	CJA_1466	iscS
5709403	CJA_1467	sufB
5709404	CJA_1468	sufC
5709405	CJA_1469	sufD
5709406	CJA_1470	sufS
5709407	CJA_1471	sufA
5709408	CJA_1472	sufT


# TF - NtrC: CJA_3537
5711325	CJA_3392	glnK
5711324	CJA_3391	amtB

5711467	CJA_3534	glnA

5711469	CJA_3536	ntrB
5711470	CJA_3537	ntrC


# TF - LexA: CJA_1697
5710164	CJA_2230	recA
5710162	CJA_2228	recX

5709632	CJA_1697	lexA
5709631	CJA_1696	sulA

5711284	CJA_3351	recN

5711639	CJA_3708	PF04055


# TF - RutR: CJA_0541
5708487	CJA_0546	xdhA
5708488	CJA_0547	xdhB
5708489	CJA_0548	xdhC
5708490	CJA_0549	pucL
5708491	CJA_0550	pucM
5708492	CJA_0551	guaD
5708493	CJA_0552	COG3748

5708486	CJA_0545	ppuA
5708485	CJA_0544	ppuC
5708484	CJA_0543	ppuD
5708483	CJA_0542	ppuB
5708482	CJA_0541	rutR
5708481	CJA_0540	ssnA

5708524	CJA_0583	nupP


# RNA - TPP
5710040	CJA_2106	thiO
5710041	CJA_2107	thiS
5710042	CJA_2108	thiG

5710843	CJA_2910	thiD
5710842	CJA_2909	thiC


# TF - CueR: CJA_1837, CJA_2025
5709771	CJA_1836	copA
5709772	CJA_1837	cueR

5709770	CJA_1835	copZ

5709958	CJA_2024	copA
5709959	CJA_2025	cueR

5709957	CJA_2023	copZ


# TF - CadR-PbrR: CJA_1838
5709774	CJA_1839	czcD
5709775	CJA_1840	null
5709776	CJA_1841	czcC
5709777	CJA_1842	czcB
5709778	CJA_1843	czcA


# TF - CJA_2253: CJA_2253
5710187	CJA_2253	CJA_2253
5710188	CJA_2254	PA2298
5710189	CJA_2255	PA2297
5710190	CJA_2256	PA2296
5710191	CJA_2257	PA2295
5710192	CJA_2258	PA2294
5710193	CJA_2259	PA2293
5710194	CJA_2260	PA2292


# TF - CJA_1242: CJA_1242
5709182	CJA_1244	uahA
5709181	CJA_1243	ureA
5709180	CJA_1242	CJA_1242


# TF - MetR: CJA_2446
5710380	CJA_2446	metR

5710381	CJA_2448	metE


# TF - YdcR: CJA_3711
5711643	CJA_3712	COG0348
5711642	CJA_3711	ydcR


# TF - CJA_0601: CJA_0601
5708539	CJA_0598	HCH_01828
5708540	CJA_0599	null
5708541	CJA_0600	CJA_0600
5708542	CJA_0601	CJA_0601
5708543	CJA_0602	PF0561
5708544	CJA_0603	COG4555
5708545	CJA_0604	COG1668


# TF - YjiR2: CJA_1192
5709133	CJA_1193	null