# TF - FabR: AHA_0367
2033897	AHA_2144	fadL

2035196	AHA_3493	hyIII

2032153	AHA_0366	OLE1

2034032	AHA_2280	fabA

2032509	AHA_0722	lcfH

2032154	AHA_0367	fabR

2035417	AHA_3740	plsC


# TF - HexR: AHA_1350
2034869	AHA_3140	tal

2034872	AHA_3143	grcA

2032378	AHA_0591	ppc

2034770	AHA_3039	ptsH
2034771	AHA_3040	ptsI
2034772	AHA_3041	crr

2035797	AHA_4145	ldhA

2035753	AHA_4100	mglB
2035752	AHA_4099	mglA
2035751	AHA_4098	mglC

2034549	AHA_2816	aceB
2034550	AHA_2817	aceA

2034440	AHA_2703	gltB
2034441	AHA_2704	gltD

2033454	AHA_1689	pflA

2033702	AHA_1942	focA
2033701	AHA_1941	pflB

2033415	AHA_1650	glpT

2033119	AHA_1351	glk

2033118	AHA_1350	hexR

2033117	AHA_1349	pykA

2032668	AHA_0891	ackA
2032667	AHA_0890	pta

2032603	AHA_0821	eno

2035734	AHA_4080	pntA
2035733	AHA_4079	pntB

2035317	AHA_3618	gapA
2035318	AHA_3619	aldE


# TF - BirA: AHA_4040
2033255	AHA_1488	bioA

2033256	AHA_1489	bioB
2033257	AHA_1490	bioF
2033258	AHA_1491	bioC
2033259	AHA_1492	bioD


# TF - NrtR: AHA_4210
2035862	AHA_4210	nrtR

2035863	AHA_4211	pncA
2035864	AHA_4212	pncB


# TF - NrdR: AHA_3334
2033001	AHA_1231	nrdD
2033002	AHA_1232	nrdG

2032647	AHA_0870	nrdJa
2032648	AHA_0871	nrdJb

2034085	AHA_2333	nrdA
2034086	AHA_2334	nrdB
2034087	AHA_2335	yfaE


# TF - Zur: AHA_3674
2033671	AHA_1911	rpmE
2033670	AHA_1910	rpmJ

2035406	AHA_3729	znuC
2035407	AHA_3730	znuB

2035405	AHA_3728	znuA


# TF - PdhR: AHA_3864
2035532	AHA_3864	pdhR
2035531	AHA_3863	aceE
2035530	AHA_3862	aceF
2035529	AHA_3861	lpdA


# TF - FadR: AHA_2443
2033906	AHA_2153	fadI
2033907	AHA_2154	fadJ

2033338	AHA_1573	fadE

2033898	AHA_2145	fadL


# TF - NorR: AHA_0118
2031921	AHA_0119	norV
2031922	AHA_0120	norW
2031923	AHA_0121	tehB

2031920	AHA_0118	norR


# TF - HutC: AHA_0376
2032164	AHA_0377	hutI
2032165	AHA_0378	hutG2
2032166	AHA_0379	hutU
2032167	AHA_0380	hutH


# TF - HypR: AHA_0564
2032558	AHA_0776	putA

2032351	AHA_0564	hypR
2032350	AHA_0563	ampP


# TF - IscR: AHA_1746
2035216	AHA_3517	erpA

2033511	AHA_1746	iscR
2033512	AHA_1747	iscS
2033513	AHA_1748	iscU
2033514	AHA_1749	iscA
2033515	AHA_1750	hscB
2033516	AHA_1751	hscA
2033517	AHA_1752	fdx


# TF - NagC: AHA_1524
2033294	AHA_1527	nagE
2033295	AHA_1528	hex

2034770	AHA_3039	ptsH
2034771	AHA_3040	ptsI
2034772	AHA_3041	crr

2033293	AHA_1526	nagB
2033292	AHA_1525	nagA
2033291	AHA_1524	nagC


# TF - NtrC: AHA_0274
2035379	AHA_3695	amtB2

2032069	AHA_0277	glnA

2032436	AHA_0649	glnK2

2032067	AHA_0275	ntrB
2032066	AHA_0274	ntrC


# TF - Fur: AHA_1530
2033730	AHA_1970	AHA_1970
2033729	AHA_1969	fstC
2033728	AHA_1968	AHA_1968
2033727	AHA_1967	AHA_1967
2033726	AHA_1966	fecE

2032747	AHA_0971	Ping_1736
2032746	AHA_0970	null
2032745	AHA_0969	null

2035626	AHA_3963	null

2033747	AHA_1987	tonB1
2033746	AHA_1986	exbB1
2033745	AHA_1985	exbD1

2033742	AHA_1982	null

2034481	AHA_2744	feoA
2034480	AHA_2743	feoB
2034479	AHA_2742	feoC

2033724	AHA_1964	null

2033725	AHA_1965	null

2032248	AHA_0461	null

2034725	AHA_2992	null

2034222	AHA_2479	null
2034221	AHA_2478	null
2034220	AHA_2477	null
2034219	AHA_2476	null
2034218	AHA_2475	null

2032496	AHA_0709	mntH

2032742	AHA_0966	hutB
2032741	AHA_0965	hutC
2032740	AHA_0964	hutD

2032743	AHA_0967	hutX
2032744	AHA_0968	hutZ

2035921	AHA_4275	null
2035922	AHA_4276	fhuB
2035923	AHA_4277	fhuC
2035924	AHA_4278	fhuD
2035925	AHA_4279	fhuE

2035277	AHA_3578	COG3205

2034283	AHA_2544	null

2034224	AHA_2481	null

2035898	AHA_4252	PE36_02307
2035897	AHA_4251	AHA_4251
2035896	AHA_4250	exbB2
2035895	AHA_4249	exbD2
2035894	AHA_4248	tonB2
2035893	AHA_4247	PE36_02282

2032256	AHA_0469	hemC
2032255	AHA_0468	hemD
2032254	AHA_0467	hemX
2032253	AHA_0466	hemY

2033713	AHA_1953	null
2033714	AHA_1954	null

2032748	AHA_0972	hutR

2033428	AHA_1663	hutR

2032301	AHA_0514	null


# TF - TyrR: AHA_1886
2033419	AHA_1654	aroF
2033420	AHA_1655	tyrA

2034401	AHA_2663	hpd
2034400	AHA_2662	hmgA
2034399	AHA_2661	hmgC
2034398	AHA_2660	hmgB

2033643	AHA_1883	phhA
2033644	AHA_1884	phhB

2033740	AHA_1980	aroG


# TF - FruR: AHA_2349
2034100	AHA_2348	fruB
2034099	AHA_2347	fruK
2034098	AHA_2346	fruA

2034101	AHA_2349	fruR


# TF - RbsR: AHA_2314
2034061	AHA_2309	rbsD
2034062	AHA_2310	rbsA
2034063	AHA_2311	rbsC
2034064	AHA_2312	rbsB
2034065	AHA_2313	rbsK
2034066	AHA_2314	rbsR


# TF - ArgR: AHA_0654
2034308	AHA_2569	argA

2032442	AHA_0655	artP
2032443	AHA_0656	artI
2032444	AHA_0657	artQ
2032445	AHA_0658	artM

2032379	AHA_0592	argE

2032441	AHA_0654	argR

2032380	AHA_0593	argC
2032381	AHA_0594	argB
2032382	AHA_0595	argF
2032383	AHA_0596	argG
2032384	AHA_0597	argH

2035094	AHA_3376	proV
2035093	AHA_3375	proW
2035092	AHA_3374	proX

2034461	AHA_2724	carA
2034460	AHA_2723	carB


# TF - AgaR: AHA_0813
2032595	AHA_0813	agaR

2032594	AHA_0812	agaZ
2032593	AHA_0811	agaS
2032592	AHA_0810	agaV
2032591	AHA_0809	agaW
2032590	AHA_0808	agaE
2032589	AHA_0807	agaF
2032588	AHA_0806	agaA
2032587	AHA_0805	agaY
2032586	AHA_0804	agaH


# TF - LexA: AHA_0183
2035393	AHA_3716	recA
2035392	AHA_3715	recX

2035618	AHA_3955	uvrA

2035333	AHA_3648	ruvA
2035332	AHA_3647	ruvB

2032076	AHA_0284	recG

2035701	AHA_4047	topB

2031981	AHA_0183	lexA

2033866	AHA_2107	polB

2032012	AHA_0220	uvrD

2034719	AHA_2986	recN

2034029	AHA_2277	yebG

2032915	AHA_1145	dinB


# TF - LiuR: AHA_2073, AHA_2141
2033895	AHA_2143	ivdA

2034017	AHA_2265	prpB
2034018	AHA_2266	prpC
2034019	AHA_2267	prpD

2033838	AHA_2079	ivdB
2033839	AHA_2080	ivdC
2033840	AHA_2081	ivdD
2033841	AHA_2082	ivdE
2033842	AHA_2083	ivdF
2033843	AHA_2084	ivdG

2033736	AHA_1976	etfB
2033737	AHA_1977	etfA

2033735	AHA_1975	etfD
2033734	AHA_1974	etfD

2033837	AHA_2078	liuA
2033836	AHA_2077	liuB
2033835	AHA_2076	liuC
2033834	AHA_2075	liuD
2033833	AHA_2074	liuE
2033832	AHA_2073	liuR1
2033831	AHA_2072	null
2033830	AHA_2071	null

2033894	AHA_2141	liuR2


# TF - PsrA: AHA_1345
2031941	AHA_0139	fadB
2031940	AHA_0138	fadA

2035075	AHA_3357	fadH

2033906	AHA_2153	fadI
2033907	AHA_2154	fadJ

2033113	AHA_1345	psrA
2033114	AHA_1346	fadE1


# TF - PhnR: AHA_1937
2033698	AHA_1938	phnW
2033699	AHA_1939	COG0160
2033700	AHA_1940	phnX

2033695	AHA_1935	phnT
2033694	AHA_1934	phnU

2033696	AHA_1936	phnS

2033697	AHA_1937	phnR


# TF - NarP: AHA_1581
2034207	AHA_2464	nrfA
2034208	AHA_2465	nrfB
2034209	AHA_2466	nrfC
2034210	AHA_2467	nrfD
2034211	AHA_2468	nrfE
2034212	AHA_2469	nrfF
2034213	AHA_2470	nrfG

2035702	AHA_4048	torY
2035703	AHA_4049	torZ

2033702	AHA_1942	focA
2033701	AHA_1941	pflB

2033252	AHA_1485	dcuB

2035616	AHA_3953	ompW

2035771	AHA_4118	nirB
2035772	AHA_4119	nirD
2035773	AHA_4120	nirC
2035774	AHA_4121	cysG

2032043	AHA_0251	napF2

2032218	AHA_0431	nhaP

2033349	AHA_1584	napF
2033350	AHA_1585	napD
2033351	AHA_1586	napA
2033352	AHA_1587	napG
2033353	AHA_1588	napH
2033354	AHA_1589	napB
2033355	AHA_1590	napC

2033230	AHA_1463	adhB

2032352	AHA_0565	pckA

2033677	AHA_1917	dcuC

2035532	AHA_3864	pdhR
2035531	AHA_3863	aceE
2035530	AHA_3862	aceF
2035529	AHA_3861	lpdA

2032906	AHA_1136	nqrA
2032907	AHA_1137	nqrB
2032908	AHA_1138	nqrC
2032909	AHA_1139	nqrD
2032910	AHA_1140	nqrE
2032911	AHA_1141	nqrF

2034268	AHA_2526	hybO
2034267	AHA_2525	hybA
2034266	AHA_2524	hybB
2034265	AHA_2523	hybC
2034264	AHA_2522	hybD
2034263	AHA_2521	hybE

2034928	AHA_3208	frdA
2034929	AHA_3209	frdB
2034930	AHA_3210	frdC
2034931	AHA_3211	frdD


# TF - Tola_2750: AHA_3592
2035291	AHA_3592	AHA_3592

2035290	AHA_3591	PF01810


# RNA - TPP
2032653	AHA_0876	thiB
2032652	AHA_0875	thiP
2032651	AHA_0874	thiQ

2032226	AHA_0439	thiC
2032227	AHA_0440	thiDE
2032228	AHA_0441	thiF
2032229	AHA_0442	thiS
2032230	AHA_0443	thiG
2032231	AHA_0444	thiH


# RNA - FMN
2033081	AHA_1311	ribB


# TF - GntR: AHA_0290
2032078	AHA_0286	gntT

2032079	AHA_0287	gntK
2032080	AHA_0288	edd
2032081	AHA_0289	eda

2032082	AHA_0290	gntR


# TF - SoxR: AHA_2710
2034448	AHA_2711	null


# TF - ZntR: AHA_0842
2032416	AHA_0629	zntA


# TF - CueR: AHA_4221
2035874	AHA_4222	copA
2035873	AHA_4221	cueR


# TF - EbgR: AHA_0204
2031997	AHA_0205	ebgA
2031998	AHA_0206	ebgC
2031999	AHA_0207	ygjI

2031996	AHA_0204	ebgR


# TF - ScrR: AHA_2977
2034714	AHA_2981	scrY

2034713	AHA_2980	scrK
2034712	AHA_2979	scrA
2034711	AHA_2978	scrB
2034710	AHA_2977	scrR


# TF - SgaR: AHA_0174
2031972	AHA_0174	sgaR

2031971	AHA_0173	sgaA
2031970	AHA_0172	sgaB
2031969	AHA_0171	sgaT


# TF - TreR: AHA_3825
2035496	AHA_3824	treB
2035495	AHA_3823	treC
2035494	AHA_3822	maa


# RNA - MOCO_RNA_motif
2033348	AHA_1583	moaA


# TF - PhnR1: AHA_3982
2035646	AHA_3983	phnS
2035647	AHA_3984	AHA_3984
2035648	AHA_3985	phnU
2035649	AHA_3986	phnV
2035650	AHA_3987	phnT
2035651	AHA_3988	COG0560

2035645	AHA_3982	null


# TF - MetJ: AHA_0588
2034853	AHA_3124	metK

2032276	AHA_0489	metA

2032219	AHA_0432	metH

2035612	AHA_3949	metF

2031881	AHA_0074	btuB

2032692	AHA_0915	metN
2032691	AHA_0914	metI
2032690	AHA_0913	metQ

2034541	AHA_2807	mmuM
2034540	AHA_2806	mmuP

2032375	AHA_0588	metJ

2032376	AHA_0589	metB
2032377	AHA_0590	metL

2033716	AHA_1956	metE

2033715	AHA_1955	metR

2034422	AHA_2685	metQ2

2032293	AHA_0506	metY

2034463	AHA_2726	metT


# TF - ManR: AHA_2344
2034097	AHA_2345	pgiA

2034095	AHA_2343	manA1
2034094	AHA_2342	manW
2034093	AHA_2341	manX
2034092	AHA_2340	manY
2034091	AHA_2339	manZ
2034090	AHA_2338	manA

2034096	AHA_2344	manR


# TF - MetR: AHA_1955
2033716	AHA_1956	metE

2033715	AHA_1955	metR


# TF - YdcR: AHA_1639
2033405	AHA_1640	PF01654
2033406	AHA_1641	PF02322


# TF - AHA_3778: AHA_3778
2035454	AHA_3777	PF02566
2035453	AHA_3776	PF00581
2035452	AHA_3775	PF00583


# TF - PhrR: AHA_1100
2032870	AHA_1099	COG3272
2032871	AHA_1100	phrR
2032872	AHA_1101	phr
2032873	AHA_1102	PF10184
2032874	AHA_1103	PF00106
2032875	AHA_1104	PF01593
2032876	AHA_1105	PF07103
2032877	AHA_1106	PF02353