# TF - LexA: CD1931 3373746 CD1328 recA 3374063 CD1630 null 3375292 CD2807 ruvC 3375291 CD2806 ruvA 3375290 CD2805 ruvB 3374385 CD1931 lexA # TF - HrcA: CD2463 3374937 CD2463 hrcA 3374936 CD2462 grpE 3374935 CD2461 dnaK 3372548 CD0193 groES 3372549 CD0194 groEL # RNA - Cobalamin 3372684 CD0324 cbiM 3372685 CD0325 cbiN 3372686 CD0326 cbiQ 3372687 CD0327 cbiO 3375490 CD2999 btuF1 3375489 CD2998 btuC1 3375488 CD2997 btuD1 3375945 CD3435 cbiP 3375944 CD3434 cbiA 3375943 CD3433 cbiB 3375942 CD3432 cobD 3375941 CD3431 pduX 3375940 CD3430 cbiC 3375939 CD3429 cbiD 3375938 CD3428 cbiE 3375937 CD3427 cbiT 3375936 CD3426 cbiF 3375935 CD3425 cbiG 3375934 CD3424 cbiH 3375933 CD3423 cbiJ 3375932 CD3422 cbiKL 3375931 CD3421 hemC 3375930 CD3420 cobA-hemD 3375929 CD3419 hemB 3375928 CD3418 cysG3 # RNA - FMN 3374139 CD1700 ribD 3374138 CD1699 ribE 3374137 CD1698 ribBA 3374136 CD1697 ribH 3375800 CD3299 ribZ 3372500 CD0147 ribU # RNA - GEMM_RNA_motif 3374446 CD1990 null 3374782 CD2309 CD2309 3373849 CD1424 CD2309 3375315 CD2830 null 3372600 CD0245 flgB 3372601 CD0246 flgC 3372602 CD0247 fliE 3372603 CD0248 fliF 3372604 CD0249 fliG 3372605 CD0250 fliH 3372606 CD0251 fliI 3372607 CD0252 fliJ 3372608 CD0253 fliK 3372609 CD0254 flgD 3372610 CD0255 flgE 3372611 CD0255A flbD 3372612 CD0256 motA 3372613 CD0257 motB 3372614 CD0258 fliL 3372615 CD0259 fliZ 3372616 CD0260 fliP 3372617 CD0261 fliQ 3372618 CD0262 fliR/flhB 3372619 CD0263 flhA 3372620 CD0264 flhF 3372621 CD0265 fleN 3372622 CD0266 fliA 3372623 CD0267 Cbei_4248 3372624 CD0268 flgF 3372625 CD0269 flgG 3372626 CD0270 fliM 3372627 CD0271 fliN 3375282 CD2797 CD2797 # RNA - Glycine 3374093 CD1657 gcv(T/H/P1) 3374094 CD1658 gcvP2 3374746 CD2276 glyP 3374829 CD2357 grdX 3374828 CD2356 trxB 3374827 CD2355 trxA 3374826 CD2354 grdE 3374825 CD2352 grdA # RNA - L10_leader 3372363 CD0063 rplJ 3372364 CD0064 rplL # RNA - L19_leader 3373671 CD1257 rplS # RNA - L20_leader 3373065 CD0685 infC 3373066 CD0686 rpmI 3373067 CD0687 rplT # RNA - L21_leader 3373571 CD1161 rplU 3373572 CD1162 ysxB 3373573 CD1163 rpmA # RNA - Lysine 3375590 CD3100 COG1288 3374090 CD1655 lysW 3375723 CD3224 asd 3375724 CD3225 dapA 3375725 CD3226 dapB 3375726 CD3227 dapD 3374521 CD2054 lysC 3374520 CD2053 lysA # RNA - PreQ1 3374121 CD1682 iunH 3374122 CD1683 qrtT # RNA - Purine 3374575 CD2107 pbuO 3375183 CD2704 pbuO 3375184 CD2705 guaD 3374803 CD2330 xpt 3372553 CD0198 guaA # RNA - PyrR 3376111 CD3592 pyrF 3376110 CD3591 carA 3376109 CD3590 carB 3376108 CD3589 carA 3376107 CD3588 carB 3372539 CD0184 pyrB 3372540 CD0185 pyrK 3372541 CD0186 pyrD 3372542 CD0187 pyrE # RNA - SAM 3374086 CD1653 metQ2 3373915 CD1489 metN 3373916 CD1490 metP 3373917 CD1491 metQ 3376117 CD3598 rhc 3376116 CD3597 msd 3376115 CD3596 metH 3374274 CD1825 metY 3374275 CD1826 metA 3373577 CD1166 hom 3372482 CD0130 metK # RNA - T-box(Ala) 3373697 CD1282 alaS # RNA - T-box(Arg) 3374500 CD2034 argC 3374499 CD2033 argJ 3374498 CD2032 argB 3374497 CD2031 argD 3374496 CD2030 argF 3374232 CD1785 argG 3374973 CD2500 argH 3373134 CD0750 artP 3373135 CD0751 artQ 3373136 CD0752 artM # RNA - T-box(Asn) 3375173 CD2695 asnA 3374715 CD2245 asnS # RNA - T-box(His) 3374220 CD1774 hisX 3374221 CD1775 hisY 3374222 CD1776 hisZ # RNA - T-box(Ile) 3375095 CD2618 ileS # RNA - T-box(Leu) 3374996 CD2521 leuS 3373382 CD0989 leuA 3373383 CD0990 leuC 3373384 CD0991 leuD 3373385 CD0992 leuB # RNA - T-box(Met) 3376052 CD3540 metS # RNA - T-box(Phe) 3373080 CD0699 pheS 3373081 CD0700 pheT # RNA - T-box(Pro) 3372348 CD0049 proS 3372349 CD0050 proS2 # RNA - T-box(Ser) 3372264 CD0014 serS # RNA - T-box(Thr) 3372952 CD0574 thrZ # RNA - T-box(Trp) 3375087 CD2611 mtnN 3375086 CD2610 trpS 3374443 CD1988 trpP # RNA - T-box(Tyr) 3373949 CD1521 tyrZ # RNA - T-box(Val) 3375756 CD3256 valS # RNA - glmS 3372471 CD0120 glmS # RNA - TPP 3374143 CD1702 thiC 3374144 CD1702A thiS 3374145 CD1703 thiF 3374146 CD1704 thiG 3374147 CD1705 thiH 3374148 CD1706 thiE 3374032 CD1599 thiD 3374033 CD1600 thiM 3374034 CD1601 thiE 3374434 CD1980 thiX 3374433 CD1979 thiY 3374432 CD1978 thiZ # TF - NiaR: CD0012 3374728 CD2256 niaY 3374844 CD2372 nadA 3374843 CD2371 nadB 3374842 CD2370 nadC # TF - Rex: CD0171 3374826 CD2354 grdE 3374818 CD2344 CD2344 3374817 CD2343 cat1 3374816 CD2342 sucD 3374815 CD2341 abfD 3374814 CD2340 CD2340 3374813 CD2339 abfT 3374812 CD2338 4hbd 3372525 CD0171 rex 3375456 CD2966 adhE 3373451 CD1054 bcd2 3373452 CD1055 etfB2 3373453 CD1056 etfA2 3373454 CD1057 crt2 3373455 CD1058 hbd 3373456 CD1059 thlA1 3374056 CD1623 fprA 3373581 CD1170 PF09861 3373582 CD1171 etfB 3373583 CD1172 etfA 3373584 CD1173 glcD 3375186 CD2707 CD2707 3375016 CD2540 noxE # RNA - ykkC-yxkD 3372855 CD0488 ykkD 3374864 CD2392 COG3382 # RNA - yybP-ykoY 3374977 CD2503 atcL # TF - CcpA: CD1064 3374018 CD1586 null 3374019 CD1587 null 3374020 CD1588 null 3374213 CD1768 CD1768 3375103 CD2625 CD2625 3375280 CD2795 CD2795 3374959 CD2485 CD2385 3374988 CD2514 tdcB 3372654 CD0298 rbsR 3372655 CD0299 rbsK 3372656 CD0300 rbsB 3372657 CD0301 rbsA 3372658 CD0302 rbsC 3372908 CD0530 null 3372907 CD0529 null 3372906 CD0528 null 3375171 CD2693 CD2693 3372754 CD0395 hadA 3372755 CD0396 hadI 3372756 CD0397 hadB 3372757 CD0398 hadC 3372758 CD0399 acdB 3372759 CD0400 etfB1 3372760 CD0401 etfA1 3375715 CD3218 CD3218 3375080 CD2600 cstA 3372556 CD0201 null 3375742 CD3244 prdA 3375741 CD3243 null 3375740 CD3241 prdB 3375739 CD3240 prdC 3375738 CD3239 null 3375737 CD3238 null 3375736 CD3237 prdF 3372636 CD0279A null 3375369 CD2884 licB 3375368 CD2883 celB 3375367 CD2882 celF 3375366 CD2881 CD2881 3375365 CD2880 celC 3376169 CD3649 rlmH 3376189 CD3664 CD3664 3372564 CD0209 CD0209 3373964 CD1536 CD1536 3373965 CD1537 aspB 3373902 CD1477 null 3373903 CD1478 feoA1 3373904 CD1479 feoB1 3375181 CD2702 brnQ 3374829 CD2357 grdX 3374828 CD2356 trxB3 3374826 CD2354 grdE 3374827 CD2355 trxA2 3374093 CD1657 gcvPB 3374094 CD1658 gcvPB 3373546 CD1137 rnfC 3373547 CD1138 rnfD 3373548 CD1139 rnfG 3373549 CD1140 rnfE 3373550 CD1141 rnfA 3373551 CD1142 rnfB 3373235 CD0850 null 3372753 CD0394 ldhA 3375566 CD3076 tagK 3375565 CD3075 tagT 3375564 CD3074 gatY 3372538 CD0183 CD0183 3373154 CD0770 spoIIAA 3373155 CD0771 spoIIAB 3373156 CD0772 sigF 3372532 CD0177 CD0177 3375276 CD2791 CD2791 3374580 CD2111 null 3375339 CD2854 dltD 3375338 CD2853 dltA 3375337 CD2852 dltB 3375336 CD2851 dltC 3373215 CD0830 null 3375241 CD2756 ptsH 3374818 CD2344 null 3374817 CD2343 cat1 3374816 CD2342 sucD 3374800 CD2327 gatA 3374799 CD2326 gatB 3374798 CD2325 gatC 3374797 CD2324 gatD 3374796 CD2323 gatD2 3374955 CD2481 ung 3374901 CD2429 porA 3374900 CD2428 porB 3374899 CD2427 vorA 3374821 CD2347 CD2347 3374753 CD2283 null 3374752 CD2282 null 3374751 CD2281 null 3374750 CD2280 null 3374711 CD2241 nanE 3374710 CD2240 nanA 3374709 CD2239 nanP 3374389 CD1935 spoVS 3373124 CD0742 eutH 3373059 CD0679 null 3373060 CD0680 null 3372958 CD0580 gapN 3372954 CD0576 virS 3373739 CD1321 null 3373740 CD1322 dapG 3373626 CD1214 spo0A 3374642 CD2173 null 3374641 CD2172 null 3373807 CD1385 null 3373808 CD1386 null 3373809 CD1387 null 3374347 CD1893 null 3375364 CD2879 null 3375672 CD3175 cggR 3373754 CD1336 malX 3373755 CD1337 null 3373756 CD1338 glvG 3373238 CD0853 oppB 3373239 CD0854 oppC 3373240 CD0855 oppA 3373241 CD0856 oppD # TF - AgaR: CD3452 3375962 CD3451 agaZ 3375963 CD3452 agaR 3375964 CD3453 agaA 3375960 CD3449 agaS 3375959 CD3448 agaY # TF - TreR: CD3090 3375580 CD3090 treR 3375581 CD3091 treA # TF - CD1503: CD1503 3373929 CD1503 CD1503 3373930 CD1504 lp_2743 3373931 CD1505 lp_2744 # TF - CD0652: CD0652, CD2023 3373031 CD0652 CD0652 3373032 CD0653 BH0652 3373033 CD0654 BH0653 3374489 CD2023 CD0652 3374490 CD2024 BH0652 3374491 CD2025 BH0653 # RNA - FMN 3375800 CD3299 ribZ 3372500 CD0147 ribU 3374139 CD1700 ribD 3374138 CD1699 ribE 3374137 CD1698 ribBA 3374136 CD1697 ribH # TF - CD0683: CD0683 3373060 CD0680 CD0680 3373061 CD0681 CD0681 3373062 CD0682 CD0682 3373063 CD0683 CD0683 3373059 CD0679 CD0679 # TF - BirA: CD3558 3375462 CD2971 bioY 3375461 CD2970 yhfS 3375460 CD2969 yhfT 3372653 CD0297 bioB # TF - XylR: CD3066 3375556 CD3066 xylR 3375555 CD3065 xylB 3375554 CD3064 xylA 3375561 CD3071 xylS 3375560 CD3070 CD3070 3375559 CD3069 CD3069 3375558 CD3068 CD3068 3375557 CD3067 CD3067 # TF - IscR: CD1278 3373692 CD1278 iscR 3373693 CD1279 iscS 3373694 CD1280 iscU # TF - CD2285: CD2285, CD2253 3374756 CD2286 azlC 3374757 CD2287 CD2287 3374726 CD2254 racX 3374725 CD2253 CD2285 # TF - YhcF: CD1617, CD1606 3374039 CD1606 yhcF2 3374040 CD1607 yhcG 3374041 CD1608 yhcI 3374042 CD1609 null 3374043 CD1610 yhcI 3374044 CD1611 null 3374050 CD1617 yhcF 3374051 CD1618 yhcG 3374052 CD1619 yhcI 3373653 CD1240 vanZ # TF - CD3353: CD3353 3375857 CD3354 COG3382 # TF - NagR: CD1009 3373402 CD1009 nagR 3373403 CD1010 nagA 3373404 CD1011 nagB # TF - Fur: CD1287 3374266 CD1819 PF11449 3373702 CD1287 fur 3374080 CD1647 null 3374081 CD1648 null 3374082 CD1649 null 3374083 CD1650 null 3375363 CD2878 fhuD 3375362 CD2877 fhuB 3375361 CD2876 fhuG 3375360 CD2875 fhuC 3373487 CD1087 zupT 3373910 CD1485 null 3374972 CD2499 PF10087 3374188 CD1745A feoA 3375773 CD3273 feoA 3375774 CD3274 feoB # TF - HcpR: CD2170 3374638 CD2169 frdX 3374637 CD2168 hcp 3374639 CD2170 hcpR # TF - NrdR: CD2640 3372438 CD0108 nrdD 3372439 CD0109 nrdG 3375486 CD2995 nrdE 3375485 CD2994 nrdF