# TF - CymR: Cbei_1748
6846026	Cbei_4193	sbpA

6842425	Cbei_0629	mccB
6842426	Cbei_0630	null

6846177	Cbei_4344	tcyP

6846027	Cbei_4194	sbpA


# TF - ArgR: Cbei_1709
6846614	Cbei_4781	artP

6846348	Cbei_4515	argG
6846349	Cbei_4516	argH


# TF - LexA: Cbei_2561
6843019	Cbei_1216	recA

6844380	Cbei_2561	lexA

6841771	Cbei_0030	Cbei_0030

6846697	Cbei_4864	uvrB
6846696	Cbei_4863	uvrA

6842682	Cbei_0879	PF06114
6842681	Cbei_0878	null


# TF - HrcA: Cbei_0828
6842630	Cbei_0828	hrcA
6842631	Cbei_0829	grpE
6842632	Cbei_0830	dnaK
6842633	Cbei_0831	dnaJ

6842092	Cbei_0328	groES
6842093	Cbei_0329	groEL


# RNA - Cobalamin
6844129	Cbei_2309	cbiK
6844130	Cbei_2310	cbiA
6844131	Cbei_2311	cbiC
6844132	Cbei_2312	cbiD
6844133	Cbei_2313	cbiE
6844134	Cbei_2314	cbiT
6844135	Cbei_2315	cbiL
6844136	Cbei_2316	cbiF
6844137	Cbei_2317	cbiG


# RNA - FMN
6843027	Cbei_1224	ribD
6843028	Cbei_1225	ribE
6843029	Cbei_1226	ribBA
6843030	Cbei_1227	ribH

6842258	Cbei_0464	ribU


# TF - NrtR: Cbei_2075
6843894	Cbei_2075	nrtR
6843895	Cbei_2076	prs


# TF - CzrA: Cbei_1448
6843251	Cbei_1448	czrA
6843252	Cbei_1449	cadA


# RNA - GEMM_RNA_motif
6842677	Cbei_0874	Cbei_0874
6842678	Cbei_0875	tlpA

6846106	Cbei_4273	motA
6846105	Cbei_4272	motB

6842333	Cbei_0537	cheY

6845866	Cbei_4033	null
6845865	Cbei_4032	fabH


# RNA - Glycine
6844348	Cbei_2529	COG2860

6845805	Cbei_3972	aroP


# RNA - L10_leader
6841904	Cbei_0142	rplJ
6841905	Cbei_0143	rplL


# RNA - L19_leader
6842983	Cbei_1180	rplS


# RNA - L20_leader
6843376	Cbei_1569	infC
6843377	Cbei_1570	rpmI
6843378	Cbei_1571	rplT


# RNA - Lysine
6842589	Cbei_0788	lysP

6846620	Cbei_4787	lysA


# RNA - PreQ1
6842538	Cbei_0741	queT

6844357	Cbei_2538	queD
6844358	Cbei_2539	queE
6844359	Cbei_2540	folE
6844360	Cbei_2541	queC
6844361	Cbei_2542	queF


# RNA - Purine
6844245	Cbei_2426	pbuX
6844246	Cbei_2427	xpt

6843720	Cbei_1910	COG2509

6845900	Cbei_4067	pbuO

6842095	Cbei_0331	guaB
6842096	Cbei_0332	guaA


# RNA - PyrR
6843522	Cbei_1715	pyrP

6842803	Cbei_1000	pyrB
6842804	Cbei_1001	pyrI
6842805	Cbei_1002	pyrC
6842806	Cbei_1003	pyrF
6842807	Cbei_1004	pyrK
6842808	Cbei_1005	pyrD
6842809	Cbei_1006	pyrE

6841769	Cbei_0028	carA
6841770	Cbei_0029	carB


# RNA - SAM
6842222	Cbei_0428	metK

6842567	Cbei_0766	metY

6842001	Cbei_0239	metI
6842002	Cbei_0240	metC

6843204	Cbei_1401	msd
6843205	Cbei_1402	metH

6842432	Cbei_0636	metN
6842433	Cbei_0637	metP
6842434	Cbei_0638	metQ


# RNA - T-box(Ala)
6845983	Cbei_4150	alaR
6845982	Cbei_4149	alaT

6842907	Cbei_1104	alaS


# RNA - T-box(Arg)
6842822	Cbei_1019	argS


# RNA - T-box(Asn)
6843945	Cbei_2126	aspS2


# RNA - T-box(Cys)
6842373	Cbei_0577	cysK
6842374	Cbei_0578	cysE


# RNA - T-box(Gly)
6841860	Cbei_0106	glyS


# RNA - T-box(Ile)
6841787	Cbei_0046	ileS

6841974	Cbei_0212	ilvH
6841975	Cbei_0213	leuA
6841976	Cbei_0214	leuC
6841977	Cbei_0215	leuD
6841978	Cbei_0216	leuB
6841979	Cbei_0217	ilvB
6841980	Cbei_0218	ilvC


# RNA - T-box(Leu)
6846423	Cbei_4590	leuS


# RNA - T-box(Lys)
6845421	Cbei_3591	lysU


# RNA - T-box(Met)
6845011	Cbei_3185	metS3


# RNA - T-box(Phe)
6843380	Cbei_1573	pheS
6843381	Cbei_1574	pheT


# RNA - T-box(Pro)
6841891	Cbei_0130	proS


# RNA - T-box(Ser)
6843234	Cbei_1431	serS


# RNA - T-box(Thr)
6845032	Cbei_3206	thrZ

6842055	Cbei_0293	thrS


# RNA - T-box(Trp)
6843556	Cbei_1749	trpE
6843557	Cbei_1750	trpG
6843558	Cbei_1751	trpD
6843559	Cbei_1752	trpC
6843560	Cbei_1753	trpF
6843561	Cbei_1754	trpB
6843562	Cbei_1755	trpA

6842448	Cbei_0652	trpP


# RNA - T-box(Tyr)
6844235	Cbei_2416	tyrZ


# RNA - T-box(Val)
6844465	Cbei_2646	ilvB
6844466	Cbei_2647	ilvH1

6843592	Cbei_1782	valS


# RNA - glmS
6842008	Cbei_0246	glmS


# RNA - TPP
6841807	Cbei_0066	thiT

6846324	Cbei_4491	thiW
6846323	Cbei_4490	thiD
6846322	Cbei_4489	thiC
6846321	Cbei_4488	thiM
6846320	Cbei_4487	thiE

6842443	Cbei_0647	thiF
6842444	Cbei_0648	thiE

6843907	Cbei_2088	tenA
6843908	Cbei_2089	thiZ
6843909	Cbei_2090	thiX
6843910	Cbei_2091	thiY


# TF - Zur: Cbei_1336
6845087	Cbei_3261	CAC1592

6842273	Cbei_0477	znuA

6846501	Cbei_4668	znuA

6846167	Cbei_4334	znuC
6846168	Cbei_4335	znuB

6844229	Cbei_2410	fld
6844230	Cbei_2411	CAC0588

6846031	Cbei_4198	feoA
6846030	Cbei_4197	feoA2
6846029	Cbei_4196	feoB


# TF - NiaR: Cbei_0009
6843207	Cbei_1404	niaX

6842593	Cbei_0792	nadA
6842594	Cbei_0793	nadB
6842595	Cbei_0794	nadC


# RNA - ydaO-yuaA
6843256	Cbei_1453	COG1246

6844759	Cbei_2934	dapB
6844761	Cbei_2936	COG1246


# RNA - ykkC-yxkD
6845277	Cbei_3447	COG3382
6845276	Cbei_3446	COG731
6845275	Cbei_3445	ykkD


# RNA - ykoK
6845189	Cbei_3363	mgtE
6845190	Cbei_3364	mntH


# RNA - yybP-ykoY
6844863	Cbei_3038	Cbei_1147

6844032	Cbei_2213	htpX

6844031	Cbei_2212	ykoY

6842070	Cbei_0306	atcL


# TF - CcpA: Cbei_0047
6846516	Cbei_4683	null

6846410	Cbei_4577	aroF
6846409	Cbei_4576	aroB
6846408	Cbei_4575	aroA
6846407	Cbei_4574	aroC
6846406	Cbei_4573	pheA
6846405	Cbei_4572	aroE
6846404	Cbei_4571	aroK

6846839	Cbei_4985	Cbei_4985

6846473	Cbei_4640	null
6846472	Cbei_4639	null

6844206	Cbei_2386	tal

6842441	Cbei_0645	clpB

6846639	Cbei_4806	null
6846638	Cbei_4805	glvA2
6846637	Cbei_4804	null

6843207	Cbei_1404	niaX

6842249	Cbei_0455	fucO

6845175	Cbei_3349	htd2

6846343	Cbei_4510	glpP

6846341	Cbei_4508	glpA
6846340	Cbei_4507	null
6846339	Cbei_4506	null

6846342	Cbei_4509	glpK

6846344	Cbei_4511	glpF

6843967	Cbei_2148	dhaK
6843968	Cbei_2149	dhaM
6843969	Cbei_2150	dhaL

6845099	Cbei_3273	bglP

6845098	Cbei_3272	Cbei_3272
6845097	Cbei_3271	bglH2

6842004	Cbei_0242	mtlA

6845161	Cbei_3335	null

6845959	Cbei_4126	xynD

6845958	Cbei_4125	xynT

6846469	Cbei_4636	null
6846468	Cbei_4635	null
6846467	Cbei_4634	null

6843281	Cbei_1475	null
6843282	Cbei_1476	null
6843283	Cbei_1477	bglC
6843284	Cbei_1478	null

6844140	Cbei_2320	treB
6844141	Cbei_2321	treA

6846158	Cbei_4325	null

6844242	Cbei_2423	Cbei_2423

6846298	Cbei_4465	galM

6843786	Cbei_1967	ygeY
6843787	Cbei_1968	ygeW
6843788	Cbei_1969	yqeA

6843994	Cbei_2175	leuA1

6846285	Cbei_4452	xylB

6842459	Cbei_0663	null

6845819	Cbei_3986	null

6845331	Cbei_3501	Cbei_3501
6845330	Cbei_3500	Cbei_3500
6845329	Cbei_3499	Cbei_3499
6845328	Cbei_3498	null

6845989	Cbei_4156	null
6845988	Cbei_4155	ltaE

6845702	Cbei_3872	null
6845701	Cbei_3871	null

6846765	Cbei_4912	null
6846764	Cbei_4911	null

6846494	Cbei_4661	null

6846813	Cbei_4959	cheY
6846812	Cbei_4958	cheX

6846283	Cbei_4450	araF
6846282	Cbei_4449	araG
6846281	Cbei_4448	araH

6846901	Cbei_5042	livK
6846902	Cbei_5043	livH
6846903	Cbei_5044	livM
6846904	Cbei_5045	livG
6846905	Cbei_5046	livF

6844588	Cbei_2769	livK
6844587	Cbei_2768	livH
6844586	Cbei_2767	livM
6844585	Cbei_2766	livF
6844584	Cbei_2765	livF

6841992	Cbei_0230	malH
6841993	Cbei_0231	malF
6841994	Cbei_0232	malG
6841995	Cbei_0233	malQ

6843845	Cbei_2026	kdpX

6843081	Cbei_1278	YkgB

6842508	Cbei_0711	ptnA
6842509	Cbei_0712	manY
6842510	Cbei_0713	ptnD

6843859	Cbei_2040	ydiF
6843860	Cbei_2041	yxjC

6845651	Cbei_3821	atoE
6845650	Cbei_3820	hbd2
6845649	Cbei_3819	ydiF

6845177	Cbei_3351	ydiF
6845176	Cbei_3350	yxjC

6843857	Cbei_2038	Cbei_2038

6846718	Cbei_4885	abrB

6846874	Cbei_5019	null
6846873	Cbei_5018	glvA2
6846872	Cbei_5017	null

6846838	Cbei_4984	pagL
6846837	Cbei_4983	glcB
6846836	Cbei_4982	ypqE

6846680	Cbei_4847	licH
6846679	Cbei_4846	bglP
6846678	Cbei_4845	null

6846771	Cbei_4918	null

6844737	Cbei_2912	null

6844314	Cbei_2495	null

6846287	Cbei_4454	tal

6846290	Cbei_4457	araA

6844651	Cbei_2832	bglH

6843642	Cbei_1832	uxaC
6843643	Cbei_1833	uxaB

6843025	Cbei_1222	CAC2689

6843663	Cbei_1853	nifJ2

6843648	Cbei_1838	uxaB
6843649	Cbei_1839	uxaA

6846490	Cbei_4657	uxaC
6846489	Cbei_4656	uxuT

6845915	Cbei_4082	uxaC
6845914	Cbei_4081	uxuT

6846514	Cbei_4681	null

6844209	Cbei_2389	null

6846866	Cbei_5011	scrR
6846865	Cbei_5010	scrB
6846864	Cbei_5009	scrK

6846538	Cbei_4705	null

6844208	Cbei_2388	null

6844204	Cbei_2384	xylB
6844205	Cbei_2385	xylR

6844594	Cbei_2775	mutT1

6842238	Cbei_0444	glnN

6845065	Cbei_3239	null


# TF - Rex: Cbei_0320
6844000	Cbei_2181	bdh

6843529	Cbei_1722	bdh

6842198	Cbei_0411	thlA

6841965	Cbei_0203	ptb
6841966	Cbei_0204	buk

6842089	Cbei_0325	hbd

6842085	Cbei_0321	crt
6842086	Cbei_0322	bcd
6842087	Cbei_0323	etfB
6842088	Cbei_0324	etfA

6842091	Cbei_0327	hyd

6843267	Cbei_1464	butA

6842812	Cbei_1009	pflB

6845460	Cbei_3630	thl

6846152	Cbei_4319	fld
6846151	Cbei_4318	por


# TF - AgaR: Cbei_4563
6846397	Cbei_4564	agaA

6846396	Cbei_4563	agaR
6846395	Cbei_4562	nagB

6846372	Cbei_4539	Cbei_4539
6846371	Cbei_4538	Cbei_4538
6846370	Cbei_4537	Cbei_4537
6846369	Cbei_4536	agaK
6846368	Cbei_4535	Cbei_4535


# TF - YcxD: Cbei_4035
6845869	Cbei_4036	null


# TF - YhcF: Cbei_0791
6842592	Cbei_0791	yhcF
6842591	Cbei_0790	yhcG
6842590	Cbei_0789	yhcI


# TF - MalR1: Cbei_0863
6842666	Cbei_0863	malR1
6842667	Cbei_0864	malQ
6842668	Cbei_0865	glgP


# TF - MalR2: Cbei_0234
6841992	Cbei_0230	malE
6841993	Cbei_0231	malF
6841994	Cbei_0232	malG

6841995	Cbei_0233	malM

6842460	Cbei_0664	amyE


# TF - ScrR: Cbei_5011
6846867	Cbei_5012	scrA
6846866	Cbei_5011	scrR
6846865	Cbei_5010	scrB
6846864	Cbei_5009	scrK


# TF - YtrA: Cbei_1885
6843694	Cbei_1884	Cbei_1884
6843695	Cbei_1885	ytrA
6843696	Cbei_1886	ytrB
6843697	Cbei_1887	ytrC


# TF - ExuR: Cbei_1831
6843642	Cbei_1832	uxaC
6843643	Cbei_1833	uxaB
6843644	Cbei_1834	null
6843645	Cbei_1835	uxaT


# TF - TreR: Cbei_2319
6844140	Cbei_2320	treP
6844141	Cbei_2321	treA


# TF - Cbei_4343: Cbei_4343
6846176	Cbei_4343	Cbei_4343
6846175	Cbei_4342	BH0652
6846174	Cbei_4341	BH0653


# TF - NrdR: Cbei_1123
6841956	Cbei_0194	nrdA
6841957	Cbei_0195	nrdB

6841809	Cbei_0068	nrdD


# TF - BirA: Cbei_1015
6843563	Cbei_1756	CAC3455

6843724	Cbei_1914	bioB
6843723	Cbei_1913	bioY2


# TF - IscR: Cbei_1097
6842900	Cbei_1097	iscR
6842901	Cbei_1098	iscS
6842902	Cbei_1099	iscU
6842903	Cbei_1100	trmU

6846189	Cbei_4356	cysK


# TF - YdfD/YisV: Cbei_2083
6843903	Cbei_2084	yisU


# TF - PdxQ: Cbei_2205
6844025	Cbei_2206	pdxO


# TF - AraR: Cbei_4456
6846290	Cbei_4457	araA

6846294	Cbei_4461	Cbei_4461
6846293	Cbei_4460	Cbei_4460
6846292	Cbei_4459	Cbei_4459

6846297	Cbei_4464	araJ
6846296	Cbei_4463	araI

6846284	Cbei_4451	Cbei_4451
6846283	Cbei_4450	araF
6846282	Cbei_4449	araG
6846281	Cbei_4448	araH

6846298	Cbei_4465	epiA

6846289	Cbei_4456	null
6846288	Cbei_4455	araD
6846287	Cbei_4454	null


# TF - XylR: Cbei_2385
6845959	Cbei_4126	xynB

6844197	Cbei_2377	xylF1
6844198	Cbei_2378	Cbei_2378
6844199	Cbei_2379	Cbei_2379
6844200	Cbei_2380	xylF
6844201	Cbei_2381	xylG
6844202	Cbei_2382	xylH

6846514	Cbei_4681	xylA-II

6844208	Cbei_2388	CAC2611

6841870	Cbei_0109	xylT

6844203	Cbei_2383	xylA

6844206	Cbei_2386	tal

6844204	Cbei_2384	xylB
6844205	Cbei_2385	xylR

6844209	Cbei_2389	xylA-II


# TF - SdaR: Cbei_4476
6846313	Cbei_4480	grtP
6846312	Cbei_4479	garK


# TF - MntR: Cbei_4069
6845903	Cbei_4070	mntH

6845902	Cbei_4069	mntR


# TF - HcpR: Cbei_0780
6843237	Cbei_1434	hcp

6846188	Cbei_4355	Cbei_4355

6843655	Cbei_1845	null
6843656	Cbei_1846	null

6844095	Cbei_2276	hcp