# TF - NrdR: TM1040_2136
3413424	TM1040_1151	nrdJ


# TF - Zur: TM1040_3615
3412463	TM1040_0201	zinT

3412101	TM1040_3616	znuA

3412334	TM1040_0080	yciC

3412100	TM1040_3615	zur
3412099	TM1040_3614	znuC
3412098	TM1040_3613	znuB


# TF - HutC: TM1040_3001, TM1040_3642
3415310	TM1040_3004	hutI
3415311	TM1040_3005	hutH
3415312	TM1040_3006	hutG
3415313	TM1040_3007	hutU

3412128	TM1040_3642	hutC

3415309	TM1040_3003	hutF


# TF - IscR: TM1040_1240
3414933	TM1040_2633	TM1040_2633

3412610	TM1040_0347	hmuR
3412611	TM1040_0348	Mlr1156
3412612	TM1040_0349	exbB
3412613	TM1040_0350	exbD1
3412614	TM1040_0351	exbD2
3412615	TM1040_0352	tonB

3412376	TM1040_0122	fbpB

3414495	TM1040_2200	bfd
3414496	TM1040_2201	bfr
3414497	TM1040_2202	COG3488
3414498	TM1040_2203	COG3489
3414499	TM1040_2204	COG3490

3414493	TM1040_2198	hemP
3414494	TM1040_2199	irpA

3413516	TM1040_1240	iscR
3413517	TM1040_1241	iscS
3413518	TM1040_1242	sufB
3413519	TM1040_1243	RSP_0439
3413520	TM1040_1244	Jann_2362
3413521	TM1040_1245	sufC
3413522	TM1040_1246	sufD
3413523	TM1040_1247	RSP_0433
3413524	TM1040_1248	null
3413525	TM1040_1249	sufS

3412378	TM1040_0124	fbpA


# TF - Irr: TM1040_0183
3413516	TM1040_1240	iscR
3413517	TM1040_1241	sufS
3413518	TM1040_1242	sufB
3413519	TM1040_1243	PF01906
3413520	TM1040_1244	PF02475
3413521	TM1040_1245	sufC
3413522	TM1040_1246	sufD
3413523	TM1040_1247	PF04893
3413524	TM1040_1248	PF04893
3413525	TM1040_1249	sufS2

3411557	TM1040_3091	fssA

3415092	TM1040_2791	katG


# TF - NagQ: TM1040_3150
3411619	TM1040_3152	murQ
3411620	TM1040_3153	nagT
3411621	TM1040_3154	nagU
3411622	TM1040_3155	nagV
3411623	TM1040_3156	nagD
3411624	TM1040_3157	nagW

3411618	TM1040_3151	nagK
3411617	TM1040_3150	nagQ
3411616	TM1040_3149	nagB2
3411615	TM1040_3148	nagA


# TF - NtrC: TM1040_1361
3414929	TM1040_2629	glnK
3414930	TM1040_2630	amtB

3412651	TM1040_0388	ureD
3412650	TM1040_0387	ureA
3412649	TM1040_0386	ureB
3412648	TM1040_0385	ureC
3412647	TM1040_0384	Jann_1753
3412646	TM1040_0383	TM1040_0383
3412645	TM1040_0382	ureE
3412644	TM1040_0381	ureF
3412643	TM1040_0380	ureG

3414443	TM1040_2150	gdhA

3413295	TM1040_1023	glnB
3413294	TM1040_1022	glnA

3413641	TM1040_1363	nifR3
3413640	TM1040_1362	ntrB
3413639	TM1040_1361	ntrC
3413638	TM1040_1360	ntrY
3413637	TM1040_1359	ntrX


# TF - Mur: TM1040_0928
3412445	TM1040_0183	irr

3412352	TM1040_0098	sitA
3412353	TM1040_0099	sitB
3412354	TM1040_0100	sitC
3412355	TM1040_0101	sitD


# TF - UxuR: TM1040_3872
3411491	TM1040_3870	uxuP
3411492	TM1040_3871	uidA
3411493	TM1040_3872	uxuR
3411494	TM1040_3873	uxuA

3411490	TM1040_3869	uxuQ
3411489	TM1040_3868	uxuM
3411488	TM1040_3867	lfaA
3411487	TM1040_3866	uxuB
3411486	TM1040_3865	uxaC
3411485	TM1040_3864	kdgK


# TF - LexA: TM1040_1135
3414310	TM1040_2024	uvrD

3413407	TM1040_1135	lexA

3414668	TM1040_2373	ruvC
3414667	TM1040_2372	ruvA
3414666	TM1040_2371	ruvB

3413370	TM1040_1098	uvrA

3413749	TM1040_1469	PF04055

3413506	TM1040_1230	recA

3414415	TM1040_2122	PF06319


# TF - LiuR: TM1040_1556
3413838	TM1040_1556	liuR
3413839	TM1040_1557	acdH
3413840	TM1040_1558	null
3413841	TM1040_1559	acdA3
3413842	TM1040_1560	PF04828
3413843	TM1040_1561	acdA
3413844	TM1040_1562	acdB


# TF - RutR: TM1040_1499
3412351	TM1040_0097	deoC
3412350	TM1040_0096	ald

3413781	TM1040_1499	rutR

3413854	TM1040_1572	cdd
3413853	TM1040_1571	deoA
3413852	TM1040_1570	deoB
3413851	TM1040_1569	upp

3411560	TM1040_3094	pntD
3411561	TM1040_3095	pntA
3411562	TM1040_3096	pntB
3411563	TM1040_3097	pntC

3413783	TM1040_1501	pydX
3413782	TM1040_1500	pydA

3413780	TM1040_1498	pydC
3413779	TM1040_1497	pydB
3413778	TM1040_1496	pytA
3413777	TM1040_1495	pytB
3413776	TM1040_1494	pytC


# TF - PhnF: TM1040_3704
3412190	TM1040_3703	phnG
3412189	TM1040_3702	phnH
3412188	TM1040_3701	phnI
3412187	TM1040_3700	phnJ
3412186	TM1040_3699	phnK
3412185	TM1040_3698	phnL
3412184	TM1040_3697	phnN


# TF - PaaR: TM1040_0441
3412701	TM1040_0437	paaZ
3412700	TM1040_0436	paaX

3412702	TM1040_0438	paaF
3412703	TM1040_0439	paaY
3412704	TM1040_0440	paaK
3412705	TM1040_0441	paaR


# TF - EutR: TM1040_1386
3413664	TM1040_1386	eutR


# TF - EutR: TM1040_2788
3415088	TM1040_2787	eutA
3415087	TM1040_2786	eutQ
3415086	TM1040_2785	eutM
3415085	TM1040_2784	eutP
3415084	TM1040_2783	eutB
3415083	TM1040_2782	eutX
3415082	TM1040_2781	eutY

3415089	TM1040_2788	eutR


# RNA - mini-ykkC
3414245	TM1040_1959	COG4125


# RNA - Cobalamin
3414503	TM1040_2208	cfrX
3414504	TM1040_2209	cobW
3414505	TM1040_2210	cobN
3414506	TM1040_2211	cobG
3414507	TM1040_2212	cbiC
3414508	TM1040_2213	cbiL
3414509	TM1040_2214	cbiH

3411692	TM1040_3219	ardX
3411691	TM1040_3218	frdX

3412785	TM1040_0521	nrdH
3412784	TM1040_0520	nrdI
3412783	TM1040_0519	nrdA
3412782	TM1040_0518	nrdB

3415239	TM1040_2933	cbiW
3415240	TM1040_2934	btuF
3415241	TM1040_2935	btuC
3415242	TM1040_2936	btuD

3412429	TM1040_0168	RSP_0787

3414517	TM1040_2222	cbtA


# RNA - S15
3412335	TM1040_0081	rpsO


# RNA - serC
3415326	TM1040_3020	serC
3415327	TM1040_3021	serA


# RNA - SAM_alpha
3414224	TM1040_1938	metY


# RNA - TPP
3415120	TM1040_2818	thiB
3415119	TM1040_2817	thiP
3415118	TM1040_2816	thiQ

3414346	TM1040_2054	thiC

3412136	TM1040_3649	thiD
3412137	TM1040_3650	thiO
3412138	TM1040_3651	thiS
3412139	TM1040_3652	thiG
3412140	TM1040_3653	thiE
3412141	TM1040_3654	thiF
3412142	TM1040_3655	thiY
3412143	TM1040_3656	tenA
3412144	TM1040_3657	thiZ
3412145	TM1040_3658	thiX


# RNA - FMN
3411783	TM1040_3310	ribH2

3414796	TM1040_2496	ribN


# RNA - Glycine
3414688	TM1040_2393	gcvT
3414687	TM1040_2392	gcvH
3414686	TM1040_2391	gcvP


# RNA - SAM-SAH
3412455	TM1040_0193	metK


# TF - AglR: TM1040_3308
3411780	TM1040_3307	aglE
3411779	TM1040_3306	aglF
3411778	TM1040_3305	aglG
3411777	TM1040_3304	aglA
3411776	TM1040_3303	aglK

3411781	TM1040_3308	aglR
3411782	TM1040_3309	RSP_2874


# TF - HrcA: TM1040_2873
3412861	TM1040_0596	groS
3412862	TM1040_0597	groL


# TF - SmoR: TM1040_0432
3412695	TM1040_0432	smoR

3412694	TM1040_0431	smoE
3412693	TM1040_0430	smoF
3412692	TM1040_0429	smoG
3412691	TM1040_0428	smoK
3412690	TM1040_0427	smoS
3412689	TM1040_0426	mtlK


# TF - SoxR: TM1040_3746
3414148	TM1040_1863	PF00903

3412234	TM1040_3747	PF00903

3412233	TM1040_3746	soxR


# TF - CadR-PbrR: TM1040_2931
3415236	TM1040_2930	czcD


# TF - BioR: TM1040_3010
3412148	TM1040_3661	bioM
3412147	TM1040_3660	bioN
3412146	TM1040_3659	bioY


# TF - IolR: TM1040_3344
3411821	TM1040_3347	null
3411820	TM1040_3346	iolE
3411819	TM1040_3345	null

3411822	TM1040_3348	iolD
3411823	TM1040_3349	iolC
3411824	TM1040_3350	iolB
3411825	TM1040_3351	iolJ
3411826	TM1040_3352	iolG

3411818	TM1040_3344	iolR

3411817	TM1040_3343	iolK
3411816	TM1040_3342	iolL
3411815	TM1040_3341	iolM


# TF - CceR (GapR): TM1040_3128
3414674	TM1040_2379	tal

3414314	TM1040_2028	pycA

3414816	TM1040_2516	pykA

3412680	TM1040_0417	gapB

3413383	TM1040_1111	gapA

3414741	TM1040_2442	pckA

3411507	TM1040_3042	scrK

3412641	TM1040_0378	pgi
3412640	TM1040_0377	zwf
3412639	TM1040_0376	edd
3412638	TM1040_0375	eda

3413202	TM1040_0931	eno

3414262	TM1040_1976	fba

3413384	TM1040_1112	yedI


# TF - Chvl: TM1040_2441
3414740	TM1040_2441	chvI
3414739	TM1040_2440	chvG
3414738	TM1040_2439	Jann_0538
3414737	TM1040_2438	manX
3414736	TM1040_2437	null
3414735	TM1040_2436	phbH
3414734	TM1040_2435	null


# TF - HypR2: TM1040_3324
3411797	TM1040_3323	hypS

3411799	TM1040_3325	hypH

3411671	TM1040_3198	hypD
3411672	TM1040_3199	hypE
3411673	TM1040_3200	hypO
3411674	TM1040_3201	hypY

3411798	TM1040_3324	hypR2


# TF - MetR: TM1040_1699
3413982	TM1040_1699	metR

3412102	TM1040_3617	metH2
3412103	TM1040_3618	metH

3413983	TM1040_1700	metF


# TF - TauR: TM1040_0156
3412416	TM1040_0155	xsc
3412415	TM1040_0154	tauE
3412414	TM1040_0153	tauZ
3412413	TM1040_0152	COG2128

3412420	TM1040_0159	null


# TF - FnrN: TM1040_2547
3414846	TM1040_2546	uspA

3413130	TM1040_0860	hemA

3414845	TM1040_2545	ccoN
3414844	TM1040_2544	ccoO
3414843	TM1040_2543	ccoQ
3414842	TM1040_2542	ccoP

3414840	TM1040_2540	ccoG
3414839	TM1040_2539	ccoH
3414838	TM1040_2538	ccoI
3414837	TM1040_2537	ccoS

3414631	TM1040_2336	ctaC
3414630	TM1040_2335	ctaB
3414629	TM1040_2334	ctaX
3414628	TM1040_2333	ctaG
3414627	TM1040_2332	ctaE

3412999	TM1040_0734	ompW

3414848	TM1040_2548	hemN

3414586	TM1040_2291	ctaD

3414847	TM1040_2547	fnrN