# TF - NsrR: Caul_0854
7041304	Caul_0855	PF09313
7041305	Caul_0856	hmp

7041303	Caul_0854	nsrR


# TF - NadQ: Caul_2899
7045215	Caul_4717	proA
7045216	Caul_4718	nadD

7044804	Caul_4308	nadA
7044805	Caul_4309	nadB
7044806	Caul_4310	null
7044807	Caul_4311	nadC

7045413	Caul_4914	nadE


# TF - NrdR: Caul_3046
7045159	Caul_4661	nrdA

7045207	Caul_4709	nrdB

7043022	Caul_2560	nrdJ


# TF - SahR: Caul_3410
7045121	Caul_4623	ahcY

7043887	Caul_3410	sahR
7043886	Caul_3409	metF
7043885	Caul_3408	null
7043884	Caul_3407	metH2
7043883	Caul_3406	Caul_3406
7043882	Caul_3405	Caul_3405
7043881	Caul_3404	ddl
7043880	Caul_3403	null
7043879	Caul_3402	metH

7040473	Caul_0027	metK


# TF - Zur: Caul_0255
7040642	Caul_0194	rplU
7040641	Caul_0193	rpmA

7045192	Caul_4694	znuL

7040643	Caul_0195	zrpW
7040644	Caul_0196	yciC


# TF - HutC: Caul_2358, Caul_1300
7042817	Caul_2355	omp
7042818	Caul_2356	Caul_2357
7042819	Caul_2357	Caul_2357
7042820	Caul_2358	hutC

7041752	Caul_1299	hutF
7041753	Caul_1300	hutC

7041751	Caul_1298	hutI
7041750	Caul_1297	hutH
7041749	Caul_1296	hutG
7041748	Caul_1295	hutU
7041747	Caul_1294	hutD


# TF - IscR: Caul_2586
7043048	Caul_2586	iscR
7043049	Caul_2587	iscS
7043050	Caul_2588	sufB
7043051	Caul_2589	Caul_2589
7043052	Caul_2590	Caul_2590
7043053	Caul_2591	sufC
7043054	Caul_2592	sufD
7043055	Caul_2593	sufS
7043056	Caul_2594	sufT
7043057	Caul_2595	sufA


# TF - NagQ: Caul_0291
7040739	Caul_0291	nagQ
7040738	Caul_0290	nagB2
7040737	Caul_0289	nagA

7040740	Caul_0292	omp_nag


# TF - NtrC: Caul_2606
7043425	Caul_2957	narK
7043424	Caul_2956	nasD
7043423	Caul_2955	nasE
7043422	Caul_2954	nasA
7043421	Caul_2953	cysG

7043320	Caul_2852	glnB
7043321	Caul_2853	glnA

7042632	Caul_2171	glnK
7042631	Caul_2170	amtB

7043066	Caul_2604	nifR3
7043067	Caul_2605	ntrB
7043068	Caul_2606	ntrC
7043069	Caul_2607	ntrY
7043070	Caul_2608	ntrX
7043071	Caul_2609	dat


# TF - Fur: Caul_0013
7043192	Caul_2729	null

7044483	Caul_3988	PF03929
7044484	Caul_3989	null
7044485	Caul_3990	null

7044535	Caul_4040	feoA
7044534	Caul_4039	feoB

7041198	Caul_0751	bfd
7041199	Caul_0752	bfr

7041561	Caul_1111	omp4

7043299	Caul_2836	nuoA
7043298	Caul_2835	nuoB
7043297	Caul_2834	nuoC
7043296	Caul_2833	nuoD
7043295	Caul_2832	null
7043294	Caul_2831	nuoE
7043293	Caul_2830	null
7043292	Caul_2829	null
7043291	Caul_2828	nuoF
7043290	Caul_2827	nuoG
7043289	Caul_2826	nuoH
7043288	Caul_2825	null
7043287	Caul_2824	nuoI
7043286	Caul_2823	nuoJ
7043285	Caul_2822	nuoK
7043284	Caul_2821	nuoL
7043283	Caul_2820	nuoM
7043282	Caul_2819	nuoN
7043281	Caul_2818	birA
7043280	Caul_2817	coaX
7043279	Caul_2816	rnj
7043278	Caul_2815	null

7041562	Caul_1112	null
7041563	Caul_1113	null
7041564	Caul_1114	null


# TF - ModE: Caul_2731
7043195	Caul_2732	modB

7043194	Caul_2731	modE

7042296	Caul_1837	modA


# TF - LexA: Caul_2782
7041909	Caul_1454	lhr
7041908	Caul_1453	PF00149

7043271	Caul_2808	dnaE

7040627	Caul_0179	PF01078

7045571	Caul_5071	COG5529

7043245	Caul_2782	lexA

7044180	Caul_3697	uvrA

7041847	Caul_1392	recA

7041867	Caul_1412	nth

7044705	Caul_4208	PF06319

7044960	Caul_4463	imuA
7044959	Caul_4462	imuB
7044958	Caul_4461	dnaE2


# TF - LiuR: Caul_0132
7041497	Caul_1047	etfB
7041496	Caul_1046	etfA

7042507	Caul_2048	acdL2
7042508	Caul_2049	acdH2

7040580	Caul_0132	liuR
7040579	Caul_0131	acdH
7040578	Caul_0130	acdL
7040577	Caul_0129	null
7040576	Caul_0128	null


# TF - PsrA: Caul_3323
7045250	Caul_4752	fadA

7041261	Caul_0813	fadB
7041262	Caul_0814	fadD

7044757	Caul_4261	null

7042155	Caul_1696	null

7041300	Caul_0851	null

7042613	Caul_2153	fadD2

7043798	Caul_3321	null

7041902	Caul_1447	null
7041901	Caul_1446	null
7041900	Caul_1445	null

7041804	Caul_1349	echH

7045145	Caul_4647	null
7045146	Caul_4648	phhB

7045147	Caul_4649	null

7041337	Caul_0887	paaI
7041338	Caul_0888	null

7041801	Caul_1346	null

7041509	Caul_1059	null

7044566	Caul_4071	acdH

7042507	Caul_2048	null
7042508	Caul_2049	null

7040722	Caul_0274	null

7043539	Caul_3066	null
7043538	Caul_3065	null
7043537	Caul_3064	fabL

7044908	Caul_4412	null

7043818	Caul_3341	null
7043819	Caul_3342	fadL

7045396	Caul_4897	paaI2


# TF - VanR: Caul_1138
7041587	Caul_1137	vanA
7041588	Caul_1138	vanR
7041589	Caul_1139	vanB


# TF - PhnR: Caul_2986
7043455	Caul_2987	COG3511
7043456	Caul_2988	COG4341

7043453	Caul_2985	Cseg_3202

7043454	Caul_2986	phnR

7043463	Caul_2995	omp
7043462	Caul_2994	Cseg_3211
7043461	Caul_2993	Cseg_3210
7043460	Caul_2992	Cseg_3209
7043459	Caul_2991	Cseg_3208
7043458	Caul_2990	Cseg_3207
7043457	Caul_2989	phnX


# RNA - serC
7044965	Caul_4468	serC
7044964	Caul_4467	serA


# RNA - Glycine
7043005	Caul_2543	omp
7043004	Caul_2542	COG2355

7044883	Caul_4387	gcvT
7044882	Caul_4386	gcvH
7044881	Caul_4385	null
7044880	Caul_4384	gcvP1
7044879	Caul_4383	gcvP2


# RNA - yybP-ykoY
7044108	Caul_3626	COG2119


# RNA - MOCO_RNA_motif
7044355	Caul_3860	moaA


# RNA - mini-ykkC
7045230	Caul_4732	ykkC


# RNA - TPP
7043650	Caul_3175	thiC


# RNA - Cobalamin
7043198	Caul_2735	btuB
7043199	Caul_2736	cobD
7043200	Caul_2737	btuR
7043201	Caul_2738	btuF
7043202	Caul_2739	btuC
7043203	Caul_2740	btuD
7043204	Caul_2741	cbiB
7043205	Caul_2742	cobT
7043206	Caul_2743	cobS


# TF - HrcA: Caul_0166
7044647	Caul_4151	groS
7044646	Caul_4150	groL


# TF - ZntR: Caul_2331
7042793	Caul_2331	zntR


# TF - CueR: Caul_2318
7042779	Caul_2317	copA
7042780	Caul_2318	cueR

7042773	Caul_2311	cueO

7042783	Caul_2321	copZ


# TF - CadR-PbrR: Caul_2300, Caul_2322
7042763	Caul_2301	czcD
7042764	Caul_2302	pbrT


# TF - BglR1: Caul_2062
7042522	Caul_2063	omp(Bgl)1
7042523	Caul_2064	thl1


# TF - BglR2: Caul_2141
7042602	Caul_2142	omp(Bgl)2
7042603	Caul_2143	thl2
7042604	Caul_2144	thl3

7042601	Caul_2141	bglR2
7042600	Caul_2140	bglX2

7041875	Caul_1420	glcT


# TF - GluR: Caul_1442
7042640	Caul_2179	ppdK

7041897	Caul_1442	gluR

7041898	Caul_1443	pykA

7040677	Caul_0229	sucC
7040678	Caul_0230	sucD
7040679	Caul_0231	sucA
7040680	Caul_0232	sucB

7041893	Caul_1438	zwf
7041894	Caul_1439	pgl
7041895	Caul_1440	edd
7041896	Caul_1441	glk


# TF - CC1627: Caul_4613
7045105	Caul_4607	PF06439

7040876	Caul_0426	null
7040877	Caul_0427	null

7045111	Caul_4613	null

7045104	Caul_4606	null
7045103	Caul_4605	null

7045110	Caul_4612	null
7045109	Caul_4611	null
7045108	Caul_4610	null
7045107	Caul_4609	null
7045106	Caul_4608	cyc


# TF - BglR3: Caul_3555
7044033	Caul_3554	bglT

7044034	Caul_3555	bglR3


# TF - PdxQ2: Caul_0975
7044970	Caul_4473	phzF

7041426	Caul_0976	PF01810

7041425	Caul_0975	pdxQ2


# TF - YrdX3: Caul_2483
7042946	Caul_2484	COG5349


# TF - FixJ: Caul_0630, Caul_2344, Caul_2968
7041077	Caul_0629	fixK


# TF - FixK: Caul_0629, Caul_2457, Caul_2975
7045003	Caul_4506	ctaC
7045002	Caul_4505	ctaD
7045001	Caul_4504	ctaB
7045000	Caul_4503	ctaX
7044999	Caul_4502	ctaG
7044998	Caul_4501	ctaE

7041082	Caul_0634	cydA
7041083	Caul_0635	cydB
7041084	Caul_0636	cydX

7044367	Caul_3872	hemN

7042899	Caul_2437	ccoN
7042900	Caul_2438	ccoO
7042901	Caul_2439	ccoQ
7042902	Caul_2440	ccoP
7042903	Caul_2441	ccoG
7042904	Caul_2442	ccoH
7042905	Caul_2443	ccoI
7042906	Caul_2444	ccoS

7041081	Caul_0633	cydD
7041080	Caul_0632	cydC
7041079	Caul_0631	fixL
7041078	Caul_0630	fixJ
7041077	Caul_0629	fixK