Collection of Manually Curated Inferences of Regulons in Prokaryotic Genomes
-- version 4.0 --

Profile of regulator HexR in Shewanellaceae

Properties
Regulator family: RpiR
Regulation mode: repressor (activator)
Biological process: Central carbohydrate metabolism
Effector: 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate
Regulog: HexR - Shewanellaceae
Member of regulog collections
Transcription factor binding sites
Locus Tag Name Position Score Sequence
Shewanella oneidensis MR-1
SO_4557 mcp1 -78 4.7 CTGTAAATTTTTTACAG
SO_1218 deoA -85 4.9 TTGTAATATTGCTACAG
SO_3546 tal -104 5.3 TTGTAATTTTTTTACAT
SO_0779 gcvT -320 5.1 ATGTAAAAAAATTACAT
SO_1902 gnd -82 5 TGGTAATTAAGTTACAA
SO_1214 nupC -125 4.4 TTGAAATTAAACTCCAA
SO_2791 cdd -57 4.9 CTGTAACAAAATTACTA
SO_1483 aceB -351 4.7 TGGTAATTTAATTACGT
SO_0902 nqrA -181 5 TTGTTATAAAACTACAT
SO_3542 phk -73 5.4 TTGTAAGAAAATTACAA
SO_2644 ppsA -113 5.5 TAGTAATAAAATTACAA
SO_2347 gapB -182 5 CTCTAATAAAATTACAG
SO_2490 hexR -249 5 TTGTAATATAACAACAG
SO_2345 gapA2 -49 4.6 TGGTAATTTTACTACCA
SO_2489 zwf -78 5 CTGTTGTTATATTACAA
SO_2491 pykA -76 5 TTGTAACTTTACTACAT
Shewanella putrefaciens CN-32
Sputcn32_0323 mcp1 -78 4.8 ATGTAACTTTATTACCA
Sputcn32_1049 tal -103 5.3 TTGTAATTTTTTTACAT
Sputcn32_1811 adhE -135 5.5 TTGTAGTTTTATTACAA
Sputcn32_3211 gcvT -176 5.1 ATGTAAAAAAATTACAT
Sputcn32_2821 deoA -86 4.9 TTGTAATATTGCTACAG
Sputcn32_0956 SO1118 -176 5.3 GTGTAATTTAATTACAT
Sputcn32_1723 gnd -82 5 TGGTAATTAAGTTACAA
Sputcn32_0956 SO1118 -124 5.5 TTGTAATAAAACTACAA
Sputcn32_2824 nupC -125 4.4 TTGAAATTAAACTCCAA
Sputcn32_0849 nqrA -182 5 TTGTTATAAAACTACAT
Sputcn32_1568 cdd -57 5.1 TTGTAACAAAATTACTA
Sputcn32_1051 phk -73 5.5 TTGTAATAAAACTACAA
Sputcn32_1238 aceB -283 4 ATGTTTTTTAATTACGT
Sputcn32_1244 adhB -59 4.4 TGGTAGTTTAGTAACAA
Sputcn32_1889 gapA2 -49 4.6 TGGTAATTTTACTACCA
Sputcn32_1891 gapB -181 5.2 TTCTAATAAAATTACAT
Sputcn32_2243 ppsA -112 5.5 TAGTAATAAAATTACAA
Sputcn32_1865 hexR -249 5 TTGTAATATAACAACAG
Sputcn32_1865 hexR -252 4.8 TTGTTGTAATATAACAA
Sputcn32_1866 zwf -78 5 CTGTTGTTATATTACAA
Sputcn32_1864 pykA -75 5 TTGTAACTTTACTACAT
Shewanella sp W3-18-1
Sputw3181_3324 nqrA -182 5 TTGTTATAAAACTACAT
Sputw3181_1190 deoA -86 4.9 TTGTAATATTGCTACAG
Sputw3181_2117 gapB -181 5.2 TTCTAATAAAATTACAT
Sputw3181_0730 gcvT -176 5.1 ATGTAAAAAAATTACAT
Sputw3181_2302 gnd -82 5 TGGTAATTAAGTTACAA
Sputw3181_2214 adhE -135 5.5 TTGTAGTTTTATTACAA
Sputw3181_1187 nupC -125 4.4 TTGAAATTAAACTCCAA
Sputw3181_3220 SO1118 -124 5.5 TTGTAATAAAACTACAA
Sputw3181_2531 cdd -57 5.1 TTGTAACAAAATTACTA
Sputw3181_2144 pykA -75 5 TTGTAACTTTACTACAT
Sputw3181_3116 tal -103 5.3 TTGTAATTTTTTTACAT
Sputw3181_2119 gapA2 -49 4.6 TGGTAATTTTACTACCA
Sputw3181_2866 aceB -282 4 ATGTTTTTTAATTACGT
Sputw3181_3885 mcp1 -78 4.8 ATGTAACTTTATTACCA
Sputw3181_2860 adhB -59 4.4 TGGTAGTTTAGTAACAA
Sputw3181_3114 phk -73 5.5 TTGTAATAAAACTACAA
Sputw3181_3220 SO1118 -176 5.3 GTGTAATTTAATTACAT
Sputw3181_2143 hexR -249 5 TTGTAATATAACAACAG
Sputw3181_1765 ppsA -112 5.5 TAGTAATAAAATTACAA
Sputw3181_2142 zwf -78 5 CTGTTGTTATATTACAA
Shewanella sp ANA-3
Shewana3_3147 tal -104 5.3 TTGTAATTTTTTTACAT
Shewana3_1788 adhE -134 4.8 CTGTATTTTTATTACAT
Shewana3_1042 deoA -85 4.9 TTGTAATATTGCTACAG
Shewana3_3501 gcvT -320 5.1 ATGTAAAAAAATTACAT
Shewana3_1677 gnd -82 5 TGGTAATTAAGTTACAA
Shewana3_1039 nupC -125 4.4 TTGAAATTAAACTCCAA
Shewana3_3924 mcp2 -48 5 GTGTAATTTAATTACAC
Shewana3_2573 cdd -57 4.4 CCGTAACAAAATTACTA
Shewana3_3378 nqrA -181 5 TTGTTATAAAACTACAT
Shewana3_2943 aceB -351 4.7 TGGTAATTAAATTACGT
Shewana3_3950 mcp1 -77 5.1 CTGTAAATTTATTACAT
Shewana3_3145 phk -73 5.4 TTGTAAGAAAATTACAA
Shewana3_2124 gapA2 -49 4.6 TGGTAATTTTACTACCA
Shewana3_2152 hexR -250 5 TTGTAATATAACAACAG
Shewana3_1736 ppsA -112 5.5 TAGTAATAAAATTACAA
Shewana3_2122 gapB -183 5 CTCTAATAAAATTACAG
Shewana3_2151 zwf -79 5 CTGTTGTTATATTACAA
Shewana3_2153 pykA -76 5 TTGTAACTTTACTACAT
Shewanella sp MR-4
Shewmr4_0748 nqrA -181 5 TTGTTATAAAACTACAT
Shewmr4_2048 pykA -75 5 TTGTAACTTTACTACAT
Shewmr4_1683 adhE -134 4.8 CTGTATTTTTATTACAT
Shewmr4_1038 deoA -85 4.9 TTGTAATATTGCTACAG
Shewmr4_2967 tal -104 5.3 TTGTAATTTTTTTACAT
Shewmr4_2411 cdd -57 4.4 CCGTAACAAAATTACTA
Shewmr4_1609 gnd -82 5 TGGTAATTAAGTTACAA
Shewmr4_3331 gcvT -322 5.1 ATGTAAAAAAATTACAT
Shewmr4_1035 nupC -125 4.4 TTGAAATTAAACTCCAA
Shewmr4_3728 mcp2 -48 5.5 ATGTAATTTAATTACAT
Shewmr4_2046 zwf -79 5 CTGTTGTTATATTACAA
Shewmr4_2767 aceB -351 4.7 TGGTAATTAAATTACGT
Shewmr4_2965 phk -73 5.4 TTGTAAGAAAATTACAA
Shewmr4_1592 ppsA -112 5.5 TAGTAATAAAATTACAA
Shewmr4_2047 hexR -250 5 TTGTAATATAACAACAG
Shewmr4_2023 gapA2 -49 4.6 TGGTAATTTTACTACCA
Shewmr4_2021 gapB -183 5 CTCTAATAAAATTACAG
Shewanella sp MR-7
Shewmr7_3825 mcp1 -74 4.2 CTGTAAATTTATGACAC
Shewmr7_1952 gapA2 -49 4.6 TGGTAATTTTACTACCA
Shewmr7_3272 nqrA -181 5 TTGTTATAAAACTACAT
Shewmr7_1758 adhE -134 4.8 CTGTATTTTTATTACAT
Shewmr7_1103 deoA -85 4.9 TTGTAATATTGCTACAG
Shewmr7_3049 tal -104 5.3 TTGTAATTTTTTTACAT
Shewmr7_1100 nupC -125 4.4 TTGAAATTAAACTCCAA
Shewmr7_1684 gnd -82 5 TGGTAATTAAGTTACAA
Shewmr7_2481 cdd -57 4.9 CTGTAACAAAATTACTA
Shewmr7_0622 gcvT -321 5.1 ATGTAAAAAAATTACAT
Shewmr7_3799 mcp2 -48 5.5 ATGTAATTTAATTACAT
Shewmr7_1929 zwf -79 5 CTGTTGTTATATTACAA
Shewmr7_2845 aceB -351 4.7 TGGTAATTAAATTACGT
Shewmr7_3047 phk -73 5.4 TTGTAAGAAAATTACAA
Shewmr7_1928 hexR -250 5 TTGTAATATAACAACAG
Shewmr7_1954 gapB -183 5 CTCTAATAAAATTACAG
Shewmr7_1927 pykA -75 5 TTGTAACTTTACTACAT
Shewanella baltica OS155
Sbal_1046 phk -74 5.5 TTGTAATAAAACTACAA
Sbal_2488 ppsA -112 5.5 TAGTAATAAAATTACAA
Sbal_0193 mcp1 -23 4.4 TTGTTAATAAATTAGAC
Sbal_0942 SO1118 -124 5.5 TTGTAATAAAACTACAA
Sbal_1316 aceB -359 4.7 TGGTAATTTAATTACGT
Sbal_0942 SO1118 -148 4.3 AATTAAAAAAATTACAA
Sbal_0942 SO1118 -176 5.3 GTGTAATTTAATTACAT
Sbal_2216 gapB -181 5.2 TTCTAATAAAATTACAG
Sbal_1694 cdd -57 5.1 TTGTAACAAAATTACTA
Sbal_1922 adhE -135 5 GTGTAGTTTTATTACAT
Sbal_3229 nupC -125 4.4 TTGAAATTAAACTCCAA
Sbal_3226 deoA -86 4.9 TTGTAATATTGCTACAG
Sbal_2824 gnd -82 5 TGGTAATTAAGTTACAA
Sbal_0754 nqrA -182 5 TTGTTATAAAACTACAT
Sbal_0617 gcvT -372 5.1 ATGTAAAAAAATTACAT
Sbal_1044 tal -103 5.3 TTGTAATTTTTTTACAT
Sbal_2241 zwf -79 5 CTGTTGTTATATTACAA
Sbal_2243 pykA -77 5 TTGTAACTTTACTACAT
Sbal_2242 hexR -250 5 TTGTAATATAACAACAG
Sbal_2218 gapA2 -49 4.6 TGGTAATTTTACTACCA
Shewanella denitrificans OS217
Sden_1023 nupC -148 4.2 TTGCAATTATTTTTCAT
Sden_2000 adhE -136 5.4 CTGTAATTAAATTACAG
Sden_2288 cdd -150 4.2 ATGTAATCAAACTAGAG
Sden_2734 tal -94 5 TGGTAATTTATTTACAA
Sden_2081 pykA -163 5 TTGTAACTTTACTACAT
Sden_1245 aceB -303 4.5 TTGTAATTTTAGTACGG
Sden_2731 phk -72 5.3 TCGTAATTAAATTACAA
Sden_2080 hexR -249 5 TTGTAATATAACAACAG
Sden_2079 zwf -260 4.2 TAGTTGTTTTATTACCT
Sden_2079 zwf -88 5 CTGTTGTTATATTACAA
Sden_2009 ppsA -112 5.5 TAGTAATAAAATTACAA
Sden_1793 gapB -181 5.1 ATCTAATAAAATTACAT
Sden_1791 gapA2 -63 4.4 TGGTAATTTTACAACTA
Shewanella frigidimarina NCIMB 400
Sfri_1942 gapB -178 4.6 GTCTAATAAAATTACAC
Sfri_2900 tal -96 5 TCGTAATTTTTTTACAA
Sfri_1898 adhE -67 4.2 TTGTAATTTTATTTACA
Sfri_1898 adhE -131 5.4 CTGTAATAAAATTACAT
Sfri_3151 gcvT -154 5.3 ATGTAAAAAAATTACAA
Sfri_0964 SO1118 -116 5.6 TTGTAATTAAATTACAG
Sfri_2724 gnd -90 5 TGGTAATTTAGTTACAA
Sfri_0964 SO1118 -168 4.7 TTGTAATTAAATCACTT
Sfri_1101 aceB -436 4.3 TGGTTTTTATATTACAA
Sfri_2898 phk -73 5.6 TTGTAATTAAATTACAG
Sfri_3211 nqrA -67 4 TAGTTACTATATTAGTA
Sfri_2798 adhB -253 4.2 CGGTAATATTATTTGAA
Sfri_2798 adhB -127 4 TGGTAATAAAACAACCT
Sfri_2898 phk -167 4.5 TCGTTATTAAATTTCAA
Sfri_1940 gapA2 -136 4.7 ATGTAAAAAAAATACAA
Sfri_1940 gapA2 -62 4.2 TGGTAATTTTACAACCA
Sfri_1891 hexR -54 4.6 ATGATATAAAATTACAT
Sfri_1891 hexR -122 4.5 TTGAAAAATAACTACAG
Sfri_1891 hexR -266 5 TTGTAATATAACAACAG
Sfri_1892 zwf -88 5 CTGTTGTTATATTACAA
Sfri_1892 zwf -232 4.5 CTGTAGTTATTTTTCAA
Sfri_2297 ppsA -57 5.5 TAGTAATAAAATTACAA
Sfri_1890 pykA -134 4.5 TGGTAACTTTACTACAT
Shewanella amazonensis SB2B
Sama_1808 gapA2 -122 4.4 ATGTAAAAATATAACGA
Sama_2381 aceB -343 4.8 GTGTAATTAAATTACCT
Sama_2981 nqrA -109 4.9 TTGTAGTTAAATTTCAT
Sama_1693 adhE -142 4.3 CTGTTGTTTTATTTCAG
Sama_0971 nupC -125 4.3 TTGAAATTTAAGTTCAA
Sama_0974 deoA -85 5 CTGTAATATTTTTACAG
Sama_1365 gnd -74 4.2 CTGTAATTCAGTTACCA
Sama_2981 nqrA -180 4.6 ATGTAACTTTATGACAA
Sama_0913 tal -105 4.8 TTGTAATTTTTTTTCAT
Sama_0915 phk -77 5.5 TTGTAATAAATTTACAA
Sama_1808 gapA2 -48 4.6 TGGTAATTTTACTACCA
Sama_2072 ppsA -112 5.5 TAGTAATAAAATTACAA
Sama_1814 pykA -77 4.6 TTGTAACTTTCCTACAT
Sama_1806 gapB -181 5.2 CTCTAATAAAATTACAA
Sama_1813 hexR -251 5 TTGTAATATAACAACAG
Sama_1812 zwf -78 5 CTGTTGTTATATTACAA
Shewanella loihica PV-4
Shew_2850 SO1118 -240 5.2 ATGTAGTAAAATTACAG
Shew_2850 SO1118 -188 5.4 TTGTAATAAAACTACAT
Shew_1610 cdd -57 4.3 TGGTAACTTAGTTACTA
Shew_2814 deoA -85 4.6 TCGTAATTAAATTACGG
Shew_1910 adhE -72 4.1 GTGTAATTTTCCTTCAT
Shew_1089 tal -105 4.6 CTGTAATTTTTTTTCAT
Shew_1910 adhE -136 5.1 ATGTTATTTTATTACAT
Shew_2561 gnd -172 4.6 TAGTAATTAACTTACCA
Shew_3064 gcvT -395 4.9 ATGTAAAAAAACTACAT
Shew_2817 nupC -125 4.6 TTGAAATAAAACTTCAA
Shew_2048 zwf -174 4.8 TAGTAATTTAATCACAA
Shew_2048 zwf -76 5 CTGTTGTTATATTACAA
Shew_2709 nqrA -99 4.6 CTGTAGCTAAGTTACAA
Shew_2709 nqrA -171 5 TTGTTATAAAACTACAT
Shew_1166 adhB -168 4.8 TTGTCATAAATTTACAA
Shew_2002 gapA2 -175 4.3 TAGTATTTTTTTTACAG
Shew_2000 gapB -181 4.9 ATCTAATAAAATTACAC
Shew_1549 ppsA -114 5.5 TAGTAATAAAATTACAA
Shew_1091 phk -75 5.8 TTGTAATAAAATTACAA
Shew_2049 hexR -151 4.8 TTGTGATTAAATTACTA
Shew_2049 hexR -249 5 TTGTAATATAACAACAG
Shew_2050 pykA -75 5.1 TTGTAATTTTCCTACAA
Shew_2002 gapA2 -50 4.6 TGGTAATTTTACTACCA
Shewanella pealeana ATCC 700345
Spea_3089 SO1118 -179 5.6 TTGTAATAAAATTACAG
Spea_1573 nqrA -108 4.7 TTGTAGGTAACTTACAA
Spea_2106 gapB -182 5 ATCTAATAAAATTACAG
Spea_2763 nupC2 -346 4.4 TCGTAACTAAATTAGAT
Spea_1152 adhB -61 4.2 TGGTACTTTAATTACCA
Spea_1152 adhB -167 5 ATGTCATAAAATTACAA
Spea_1629 mcp1 -160 5.3 ATGTAATTTATTTACAA
Spea_2337 pykA -76 4.7 TCGTAAATTTACTACAA
Spea_3047 deoA -94 4.7 ATGTAACAATATTACGA
Spea_3089 SO1118 -232 4.5 TTGTTGTTAAATTACGT
Spea_2044 adhE -153 4.6 TGGTTATAAAATTACAC
Spea_1074 tal -109 4.4 GTGTAATTTTTTTTCAT
Spea_1074 tal -160 4.3 ACGTAGTTAGATTACAA
Spea_2794 gnd -127 4.6 TAGTAATTAAGTTACCA
Spea_2335 zwf -54 5 CTGTTGTTATATTACAA
Spea_1290 aceB -394 4.1 GTGAAATATAATAACGA
Spea_2104 gapA2 -51 4.2 TGGTAATTTTACAACCA
Spea_2549 ppsA -114 5.5 TAGTAATAAAATTACAA
Spea_1076 phk -74 5.3 TCGTAATAAAATTACAA
Spea_2104 gapA2 -126 4.6 ATGTAAAAAAATTACCT
Spea_2336 hexR -40 4.5 ATATAATAAAACTACAT
Spea_2336 hexR -157 4.3 TCGTGATAAAATTACTA
Spea_2336 hexR -254 5 TTGTAATATAACAACAG
Shewanella halifaxensis HAW-EB4
Shal_2855 nupC2 -361 5.1 cTGTAATTAAATTAgAt
Shal_3174 SO1118 -191 5.6 TTGTAATAAAATTACAG
Shal_3174 SO1118 -244 4.3 TTGTAGTTGAATTACCT
Shal_2076 gapA2 -53 4.6 TGGTAATTTTACTACCA
Shal_2632 mcp1 -164 4.9 GTGTAATTTATTTACAT
Shal_1196 adhB -166 4.2 ACGTCATAAAACTACAA
Shal_2076 gapA2 -128 4.4 GTGTAAAAAAATTACCG
Shal_2250 adhE -89 4.2 GTGTAATTTTTCTTCAT
Shal_1644 nqrA -108 4.4 TTGTTGGTAACTTACAA
Shal_2250 adhE -153 4.8 TGGTTATAAAATTACAG
Shal_3135 deoA -94 4.5 ATGTAACAATATTACGG
Shal_1122 tal -108 4.4 GTGTAATTTTTTTTCAT
Shal_2899 gnd -134 4.6 TAGTAATTAAGTTACCA
Shal_3375 gcvT -237 4.2 ATGTAAAAAGTTTACAT
Shal_2078 gapB -182 5.2 TTCTAATAAAATTACAT
Shal_1949 zwf -175 4.8 TAGTAATTTTATCACAA
Shal_1949 zwf -78 5 CTGTTGTTATATTACAA
Shal_1352 aceB -436 4.3 TTGAAATTTAATAACGG
Shal_1124 phk -74 5.8 TTGTAATAAAATTACAA
Shal_1705 ppsA -114 5.5 TAGTAATAAAATTACAA
Shal_1948 hexR -155 4.8 TTGTGATAAAATTACTA
Shal_1948 hexR -252 5 TTGTAATATAACAACAG
Shal_1947 pykA -76 4.7 TCGTAATTTTACTACAC
Shewanella piezotolerans WP3
swp_2889 nqrA -96 4.4 TTGTATGTAAGTTACAA
swp_2889 nqrA -178 4.5 TCGTTGTAAAATTACAT
swp_1311 adhB -60 4.2 TGGTACTTTAATTACCA
swp_1311 adhB -165 4.5 ATGTCGTAAAATTACAG
swp_1230 deoA -95 4.5 ATGTAACAATATTACGG
swp_2623 adhE -150 4.9 TAGTTATTTTATTACAG
swp_3741 tal -106 4.6 CTGTAATTTTTTTTCAT
swp_3037 cdd -57 4.3 ATGTAATAAGCTTACTA
swp_1230 deoA -103 4 CCGTTATTATGTAACAA
swp_0914 gcvH -48 4.5 GTCTTATAATATTACAG
swp_3741 tal -157 4.2 TGGTAGCAATATTACCA
swp_3432 gnd -177 4.6 TAGTAATTTAGTTACCA
swp_0913 gcvT -187 4.9 GTGTAAATAAATTACAT
swp_1227 nupC -125 4.6 TTGAAATAAAACTTCAA
swp_1851 ppsA -150 5.5 TAGTAATAAAATTACAA
swp_2388 pykA -76 4.9 TCGTAATTTTACTACAT
swp_2533 gapA2 -126 4.6 ATGTAAAAAAATTACCT
swp_2390 zwf -78 5 CTGTTGTTATATTACAA
swp_2390 zwf -175 4.3 TAGTAATTTTATCACGA
swp_1433 aceB -391 4.7 AGGTAATTAAATTACGA
swp_3738 phk -137 4.6 ATCTAGTTTTACTACAT
swp_2537 gapB -347 5.1 ATCTAATTAAATTACAT
swp_2533 gapA2 -51 4.6 TGGTAATTTTACTACCA
swp_3738 phk -74 5.8 TTGTAATAAAATTACAA
swp_2389 hexR -40 4.5 ATATAATAAAACTACAT
swp_2389 hexR -155 4.3 TCGTGATAAAATTACTA
swp_2389 hexR -252 5 TTGTAATATAACAACAG
Shewanella sediminis HAW-EB3
Ssed_3418 SO1118 -37 5.1 GAGTAATTTTATTACAA
Ssed_3418 SO1118 -202 5.6 TTGTAATAAAATTACAT
Ssed_1487 nupC2 -315 4.8 CTGTAATTTAACAACAT
Ssed_3418 SO1118 -254 4.6 GTGTTGTAAAATTACAG
Ssed_3419 SO1118 -38 5.1 GAGTAATTTTATTACAA
Ssed_3419 SO1118 -202 5.6 TTGTAATAAAATTACAT
Ssed_2068 pykA -76 5.1 TTGTAATTTTCCTACAA
Ssed_3582 nqrA -106 4.6 ATGTTACTAAGTTACAA
Ssed_2349 adhE -137 4.8 TCGTTATTTTATTACAT
Ssed_3582 nqrA -178 5 TTGTTATAAAACTACAT
Ssed_3377 deoA -85 5.2 TTGTAATTAAATTACGT
Ssed_1185 tal -105 4.6 CTGTAATTTTTTTTCAT
Ssed_1258 adhB -163 4.1 TGGTCATAAATTTACAG
Ssed_3675 gcvT -237 4.9 ATGTAAAAAAACTACAT
Ssed_2070 zwf -78 5 CTGTTGTTATATTACAA
Ssed_1414 aceB -337 4.2 TCGTAATTAAAAAACAT
Ssed_1186 phk -75 5.8 TTGTAATAAAATTACAA
Ssed_1871 ppsA -114 5.5 TAGTAATAAAATTACAA
Ssed_2228 gapA2 -51 4.6 TGGTAATTTTACTACCA
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