Collection of Manually Curated Inferences of Regulons in Prokaryotic Genomes
-- version 4.0 --

Profile of regulator PerR in Lactobacillaceae

Properties
Regulator family: FUR
Regulation mode: repressor
Biological process: Manganese homeostasis; Oxidative stress response; Iron homeostasis
Effector: Iron ion, (Fe2+); Manganese ion, (Mn2+); Hydrogen peroxide
Regulog: PerR - Lactobacillaceae
Member of regulog collections
Transcription factor binding sites
Locus Tag Name Position Score Sequence
Lactobacillus brevis ATCC 367
LVIS_0392 cadA -52 4.6 CAATAATTGTTATAA
LVIS_B09 npr -90 5.9 TTAGAATGATTCTAA
LVIS_1881 pcl2 -98 5.6 TAAGAATTATTCTAA
LVIS_1917 ycnB -39 5.2 TAAGAATATTTCTAA
LVIS_1882 perR -186 5.5 TTAGAATAATTCTTA
LVIS_0086 ahpC -82 4.9 TTAGAATCATTCTTG
Lactobacillus casei ATCC 334
LSEI_2506 ahpC -31 5.5 TAATAATCATTCTAA
LSEI_0397 npr -74 4.7 TTGGAACTATTCTAA
LSEI_2799 cadA -46 5.2 TTGTAATGGTTATAA
LSEI_2799 cadA -80 5 TTATATTCGTTCTAA
LSEI_2417 cueO -192 5.3 TTAGATTAATTCTAA
LSEI_2588 ybbL -40 5.8 TTAGAATGATTATAA
Lactobacillus fermentum IFO 3956
LAF_0409 ahpC -32 5 TGATAATCGTTCTAA
LAF_1546 pcl2 -103 5.3 TTAGAATTCTTCTAA
LAF_1546 pcl2 -39 5.7 TTATAATGGTTCTAA
LAF_1361 ycnB -109 5.3 TTATAATCATTTTAA
LAF_1361 ycnB -30 4.8 TTATAAGTTTTCTAA
LAF_1362 perR -27 5.6 TTAAAATGATTATAA
Lactobacillus plantarum WCFS1
lp_2544 npr -95 5.1 TTAGAATAATTACAA
lp_3327 cadA -93 5.4 TTAGAATCATTCTTA
lp_3247 perR -63 4.8 TTGGAATCCTTCTAA
lp_3247 perR -79 5 TAGTAATGTTTCTAA
lp_3225 ybbL -36 6 TTATAATGATTCTAA
lp_3360 pcl2 -37 5.6 TAATAATGATTATAA
lp_0355 cueO -88 5.6 TTAAAATAATTCTAA
Lactobacillus reuteri JCM 1112
LAR_1232 perR -107 5.3 TTAGAATAATTATTA
LAR_1232 perR -31 5.5 TTATAATTATTTTAA
LAR_1019 ahpC -94 5.6 TTAGAATTGTTCTAA
LAR_1019 ahpC -33 5.7 TAAGAATGATTCTAA
LAR_1418 pcl2 -102 5.4 TTTTAATGATTCTAA
LAR_1418 pcl2 -38 6 TTATAATGATTCTAA
LAR_1231 ycnB -107 5.4 TTAAAATAATTATAA
LAR_1231 ycnB -31 5.6 TAATAATTATTCTAA
Lactobacillus rhamnosus GG
LGG_02803 cadA -80 5 TTATATTCGTTCTAA
LGG_02803 cadA -46 5.2 TTGTAATGGTTATAA
LGG_00491 npr -75 5.5 TTGTAATTATTCTAA
LGG_02565 ybbL -35 5 TTAGAATGGTTACAA
LGG_02415 cueO -72 4.8 TTAGATTAATTCCAA
Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K
LSA0466 perR -38 4.7 TGATAATGATTATCA
LSA1194 pcl2 -43 5.6 TTATAATGGTTATAA
LSA0969 cadA -65 5.3 TGATAATAATTCTAA
LSA0575 npr -61 5 TTGTAATAATTATTA
Lactobacillus salivarius subsp. salivarius UCC118
LSL_1367 perR -33 4.8 TTATAAAAGTTATAA
LSL_1578 ycnB -64 4.6 TTACAAAAATTCTAA
LSL_0409 pcl2 -38 5.5 TTATAATTTTTCTAA
LSL_1684 ybbL -38 5.5 TTATAATTTTTCTAA
LSL_0169 cadA -93 5.5 TTATAATTTTTCTAA
Pediococcus pentosaceus ATCC 25745
PEPE_0043 pcl2 -37 5.7 TTAAAATGATTCTAA
PEPE_0502 cueO -73 5.3 TTAGATTAATTCTAA
Export
Regulatory Sites [ FASTA format ] DOWNLOAD