Collection of Manually Curated Inferences of Regulons in Prokaryotic Genomes
-- version 4.0 --

Profile of regulator HexR in Vibrionales

Properties
Regulator family: RpiR
Regulation mode: repressor (activator)
Biological process: Central carbohydrate metabolism
Effector: 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate
Regulog: HexR - Vibrionales
Member of regulog collections
Transcription factor binding sites
Locus Tag Name Position Score Sequence
Vibrio cholerae O1 biovar eltor str. N16961
VC2000 gapA -55 5.1 TGTAATTTTACTACC
VC2646 ppc -28 4.7 TGTAATTTTTTTTCA
VC2646 ppc -172 4.1 TGTAAGAAATTTTCA
VC0336 gpmM -60 5.2 TGTAGTAAAATTACG
VC1828 ygaW -246 5.3 TGTAATAAAATTACC
VC0734 aceB -256 5.5 TGTAATTAAATTACG
VC2279 pepD -211 4.6 AGAAATTAAATTACA
VC2279 pepD -136 5.1 AGTAATTTAATTACA
VCA1045 mtlA -422 5 TGTAGCTTAATTACA
VCA0563 pntA -85 5.1 CGTAATTGAATTACA
VC0374 pgi -138 4.9 TGAAAATTAATTACA
VC1869 pflA -42 4.7 TGTAATAAAATAACG
VCA1029 glgX -99 5.1 TGAAATAAAATTACA
VC2361 grcA -247 5.4 TGTAGTAAAATTACA
VC2013 ptsG -249 4.5 TGTAATTTTGTTACT
VC2013 ptsG -98 4.1 TGAAACTTAATTTCG
VC1148 hexR -282 4.1 AGAAATAAAATTTCA
VC2373 gltB -487 5.7 TGTAATTTAATTACA
Vibrio vulnificus CMCP6
VV20370 nirB -82 4.7 CGTAATTGATTTACA
VV1_1369 ppc -28 5 TGTAATTTTTTTACG
VV1_1369 ppc -175 4.7 TGTAATAAATTTTCA
VV20370 nirB -231 4.6 TGAAAAAATATTACA
VV1_1281 gpmM -90 5.2 TGTAGTAAAATTACG
VV1_2181 ygaW -154 4.3 GGTTATTAATTTACA
VV1_2181 ygaW -237 5.4 TGTAGTTTAATTACG
VV1_0450 aceB -310 5.5 TGTAATTAAATTACG
VV1_0450 aceB -187 4.4 TGTAAGTTAATTAAA
VV1_3140 gapA -55 5.1 TGTAATTTTACTACC
VV1_0638 mtlA -260 4.4 TGTTATTAACTTACA
VV20317 pntA -86 5.1 TGTATTTTAACTACA
VV1_1396 pgi -141 4.7 TGAAAAAAAATTACA
VV1_2095 pflA -46 4.9 TGTAATAAAATAACA
VV1_0542 grcA -247 5 TGTAGTAAATTTACA
VV1_1343 tpiA -78 4.4 CGTAGATTTTTTACA
VV1_2999 ptsG -321 4.5 TGTAATTTTGTTACT
VV1_0881 pckA -239 4.5 CGTAATTAAATAACC
VV1_0333 pepD -257 5.4 GGTAATTAAATTACA
VV1_0333 pepD -331 4.5 AGAAATTTTATTACA
VV1_0553 gltB -504 5.3 TGTAAATTAATTACA
Vibrio harveyi ATCC BAA-1116
VIBHAR_03049 gapA -55 5.1 TGTAATTTTACTACC
VIBHAR_00045 ppc -142 4.9 TGTAATTAATTTTCA
VIBHAR_00045 ppc 5 4.8 TGTAGTTTTTTTACG
VIBHAR_00121 gpmM -91 5.2 TGTAGTAAAATTACG
VIBHAR_01621 ygaW -150 4.3 GGTTATTAATTTACA
VIBHAR_01621 ygaW -244 4.5 AGTAAATAAATTACG
VIBHAR_01157 pepD -256 5.7 TGTAATTAAATTACA
VIBHAR_01157 pepD -330 4.6 AGAAATTTAATTACA
VIBHAR_01041 aceB -305 5.5 TGTAATTTAATTACG
VIBHAR_00834 mtlA -212 4.5 TGTTATTAAGTTACA
VIBHAR_05733 pntA -290 4.4 CGTAGTTATTTTTCA
VIBHAR_05733 pntA -225 4.5 AGTATTTTTATTACA
VIBHAR_00012 pgi -138 4.7 TGAAAAAAAATTACA
VIBHAR_01544 pflA -138 4.9 TGTAATAAAATAACA
VIBHAR_04820 glgX -35 5.1 AGTAATTTAATTACA
VIBHAR_01575 glgC -251 4.5 TGTAATTTAGTTCCA
VIBHAR_00943 grcA -249 5 TGTAGTAAATTTACA
VIBHAR_00709 tpiA -73 4.4 CGTAGATTTTTTACA
VIBHAR_02900 ptsG -322 4.5 TGTAATTTTGTTACT
VIBHAR_02900 ptsG -171 4.1 TGAAACTAAATTTCG
VIBHAR_00928 gltB -509 5.3 TGTAAATAAATTACA
Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633
VP2157 gapA -55 5.1 TGTAATTTTACTACC
VP2829 gpmM -91 5.2 TGTAGTAAAATTACG
VP2761 ppc -174 4.9 TGTAATTAATTTTCA
VP2761 ppc -28 4.8 TGTAGTTTTTTTACG
VP1070 ygaW -150 4.3 GGTTATTAATTTACA
VPA0987 nirB -84 4.9 TGTAATTGATTTACA
VP0671 pepD -329 4.6 AGAAATTTAATTACA
VP0671 pepD -255 5.7 TGTAATTAAATTACA
VP0583 aceB -305 5.5 TGTAATTAAATTACG
VP0370 mtlA -211 4.5 TGTTATTAAGTTACA
VPA0922 pntA -227 4.6 AGTATTTAAATTACA
VP2731 pgi -138 4.7 TGAAAAAAAATTACA
VP0992 pflA -45 4.9 TGTAATAAAATAACA
VPA1645 glgX -114 5.1 AGTAATTAAATTACA
VP0239 tpiA -55 4.4 CGTAGATTTTTTACA
VP0497 grcA -249 5 TGTAGTAAATTTACA
VP2046 ptsG -322 4.5 TGTAATTTTGTTACT
VP2046 ptsG -291 4.6 TGTATTTTATTTACG
VP0484 gltB -308 5.2 TGTAACTAAATTACA
Vibrio shilonii AK1
VSAK1_09453 ppc -140 5.1 TGTAATAAAATTTCA
VSAK1_09453 ppc 5 5.6 TGTAGTTAAATTACA
VSAK1_12617 gpmM -63 5.2 TGTAGTAAAATTACG
VSAK1_05765 nirB -84 4.9 TGTAATTGATTTACA
VSAK1_05765 nirB -265 4.9 TGTAGGTAAATTACA
VSAK1_00485 ygaW -157 5.1 TGTAATCAAATTACA
VSAK1_20779 mtlA -390 5.6 TGTAATAAAATTACA
VSAK1_20779 mtlA -193 4.3 TGTAATTTATCAACG
VSAK1_14807 pntA -85 4.4 TGTTTTTTTATTACA
VSAK1_09208 pgi -183 4.4 TGAAAAATTATTACG
VSAK1_00270 pflA -44 4.7 TGTAATAAAATGACG
VSAK1_18594 glgX -112 5.3 TGAAATTAAATTACA
VSAK1_04037 glgC -237 4.5 TGTAATCTTATTTCA
VSAK1_04037 glgC -57 5.3 TGTAATTTAACTACC
VSAK1_26880 ptsG -321 4.9 TGTAATTATGTTACG
VSAK1_26880 ptsG -170 4.1 TGAAACTAAATTTCG
VSAK1_13982 gltB -483 4.7 TGAAACTAAATTACA
Vibrio splendidus LGP32
VS_2890 ppc -28 5 TGTAATTTTTTTACG
VS_2890 ppc -173 5.3 TGTAATTAAATTTCA
VS_II0668 nirB -85 4.7 CGTAATTGATTTACA
VS_0235 gpmM -64 5.2 TGTAGTAAAATTACG
VS_1130 ygaW -247 4.7 TGTTGTTTAATTACG
VS_2422 pepD -605 4.5 TGTAAAATAATTCCA
VS_2422 pepD -256 5.5 CGTAATTAAATTACA
VS_0288 pgi -143 4.7 TGAAAAAAAATTACA
VS_1082 glgC -366 4.5 TGTAACTTAATTAAA
VS_0498 grcA -250 5 TGTAGTAAATTTACA
VS_2912 tpiA -70 4.1 TGTTATATTATTTCG
VS_1032 ptsG -322 4.5 TGTAATTTTGTTACT
VS_1032 ptsG -172 4.1 TGAAACTAAATTTCG
VS_0131 pckA -242 4.4 CGTAATAAAATCACC
VS_0474 gltB -484 4.7 TGAAAAAAAATTACA
Vibrio fischeri ES114
VF_0913 gapA -62 5.1 TGTAATTTTACTACC
VF_2308 ppc -177 4.7 TGAAATAAATTTACA
VF_2308 ppc -31 5.1 TGTAACAAAATTACA
VF_0776 nirB -184 5 TGTAAAAAAACTACA
VF_0202 gpmM -63 5.4 TGTAGTAAAATTACA
VF_0967 ygaW -164 5 TGTAAATTTACTACA
VF_0967 ygaW -226 5.3 TGTAATTTTATTACC
VF_0736 pepD -200 5.4 TGTAATTTTATTACG
VF_0736 pepD -275 4.6 AGAAATTAAATTACA
VF_1973 aceB -295 5.5 TGTAATTTAATTACG
VF_A0586 pntA -87 4.9 TGTCATTTTATTACA
VF_A0806 glgC -84 4.1 TGTAAATAATTTATG
VF_2115 grcA -238 4.7 TGTAGTAAATTTACC
VF_2115 grcA -107 4.4 TGTAGTTTTTTGACA
VF_0206 tpiA -52 4.2 TGTTATATTTTTACG
VF_1894 ptsH -206 5.2 TGTAAAATAATTACA
VF_0891 hexR -148 4.6 TGTTATTAAAATACA
VF_2124 gltB -299 4.3 TGTAGGATAGTTACA
Vibrio salmonicida LFI1238
VSAL_I0798 nirB -77 4.6 CGTAATTGATCTACA
VSAL_I0798 nirB -184 5.2 TGTAATAAAACTACG
VSAL_I2754 ppc -30 5.6 TGTAATAAAATTACA
VSAL_I2754 ppc -175 4.7 TGAAATAAATTTACA
VSAL_I3050 gpmM -45 5.4 TGTAGTAAAATTACA
VSAL_I1909 ygaW -275 5.1 TGAAATTAAATTACG
VSAL_I1909 ygaW -213 5 TGTAAATTTACTACA
VSAL_I2439 aceB -295 5.4 TGTAATTTTATTACG
VSAL_I1849 gapA -63 5.1 TGTAATTTTACTACC
VSAL_I2813 mtlA -422 4.9 CGTAATAAAATTTCA
VSAL_I2813 mtlA -207 4.6 TGTAGTAAATTTTCA
VSAL_II0623 pntA -87 4.9 TGTCATTTTATTACA
VSAL_II0232 glgX -147 4 GGTGATAAATTTACG
VSAL_I2553 grcA -235 4.2 AGTAAGTTTACTACA
VSAL_I0283 tpiA -52 4.2 TGTTATATTTTTACG
VSAL_I2357 ptsH -205 5.2 TGTAAAATAATTACA
VSAL_I1956 focA -357 5.3 TGAAATTAAATTACA
VSAL_I2031 hexR -274 4 TGAAAATAAACCACA
VSAL_I1956 focA -306 4.5 TGTCATTTTATTTCA
VSAL_I0973 pepD -198 4.1 CGTAACTAAATAACG
VSAL_I0973 pepD -272 4.6 TGAAACTTTATTACA
Vibrio angustum S14
VAS14_06013 gapA -55 5.1 TGTAATTTTACTACC
VAS14_21427 ppc -163 4.6 TGAAACAAAATTACA
VAS14_21427 ppc -28 5 TGTAACTAAATTACG
VAS14_21577 gpmM -108 5.4 TGTAGTAAAATTACA
VAS14_16781 pepD -364 4.4 CGTAATTAACTTTCA
VAS14_06773 aceB -297 5.4 TGTAATAAAATTACG
VAS14_11949 pntA -85 5 TGTATTTTTACTACA
VAS14_06518 pflA -46 4.9 TGTAATAAAATAACA
VAS14_07684 grcA -230 4.4 TGTAAAATAACAACA
VAS14_21527 tpiA -57 4.3 TATATTTTTACTACA
VAS14_23029 pckA -295 5.1 TGAAATATAATTACA
VAS14_01376 lctP -406 5 TGTAGTTTAATTACT
VAS14_06508 focA -115 4.5 TGTTATAAAATTTCA
VAS14_06508 focA -219 5.1 TGTAACAAAATTACA
VAS14_07734 gltB -495 4.6 CGTAAATAAAATACA
Photobacterium profundum SS9
PBPRA2602 gapA -55 4.5 TGTAATTTTACCACC
PBPRA0265 ppc -28 4.9 TGTAACAAAATTACG
PBPRA0265 ppc -163 4 CGAAATAAAGTTTCA
PBPRA1428 nirB -174 5.2 TGTAATTTAGTTACA
PBPRA2224 dld -389 4.8 CGTTATTTAATTACA
PBPRA0224 gpmM -93 5.4 TGTAGTAAAATTACA
PBPRA0737 aceB -303 5.2 GGTAATTAAATTACG
PBPRA0833 pepD -713 5 CGTAACTTAATTACA
PBPRA0833 pepD -639 4.5 TGAAAGTTTATTACA
PBPRB0363 mtlA -210 4.6 TGTAATTCACTTACA
PBPRA3328 pgi -135 4.2 AGTTGTAAAATTACA
PBPRB0412 glgX -336 4.7 CGTAATAAAAATACG
PBPRB0405 glgC -146 4.6 TGAAATGAAATTACA
PBPRB0405 glgC -99 4.3 TGTAATTATACATCA
PBPRA0235 tpiA -18 4.5 TTTAGTTAATTTACA
PBPRA0556 grcA -234 5.4 TGTAATTTTACTACA
PBPRA1203 ptsG -298 5.1 TGAAATTTTATTACA
PBPRA1203 ptsG -176 4.8 TGAAATTAAATTTCA
PBPRA2430 hexR -225 5.1 TGAAATTAAACTACA
PBPRA2430 hexR -80 4.4 AGTAGTATAATTTCA
PBPRA2357 lctP -428 4.6 CGTAATTTTACGACA
PBPRA2223 lctP -437 4.1 TGTAATATAACACCA
PBPRA2431 pykA -75 4.8 TGTAGTAATATTTCA
PBPRB1262 eda -137 5.1 TGTAATTTTATTTCA
PBPRA0542 gltB -295 4.3 TGTAGGATAGTTACA
Export
Regulatory Sites [ FASTA format ] DOWNLOAD